Predicted mutation | |||||||
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JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | 100% | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
* | ? | NC_000913 | = 458795 | 0 (0.000) | 65 (1.320) | 49/406 | NT | 100% | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region |
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
TGCTCGATACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCCATATACTGACGTACATGTTAATAGATGGCGTGAAGCACAGTCGTGTCATCTGATTACCTGGCGGAAATTAAACTAAGAGAGAGCTCTATGAATCCTGAGCGTTCTGAACGCATTGAAATCCCCGTATTGCCGCTGCGCGATGTGGTGGTTTATCCGCACATGGTCATCCCCTTATTTGTCGGGCGGGAAAAATCTATCCGTTGTCTGGAAGC > NC_000913/458564‑459012 | acgacatccccccggggccgtaagccagccccagacgtagcagagttgcagcatcacgaatttcgcggcggcgggttagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggGa > 1:62250‑M1/227‑228 (MQ=255) tggctcccccccggggccgtaagccagccccagacgtagcagagttgcagcatcacgaatttccaggcggttggttagatccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaattccacaacccttaagttagcgcttatgggGa > 1:645892‑M1/226‑227 (MQ=255) 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> 2:390463‑M1/223‑228 (MQ=255) tACCATGTACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGAAAAAGTGGTTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGGGAATAATTAACCATTCCCATACAATAGGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATTTCCCCTTTAATTTTTCTCTTATTCTCGGCGTTGAATGGGGGGAAAACAtcc > 2:91605‑M1/1‑225 (MQ=255) ccgggggccgtaagccagccccaggcgtagcagagttgcaacatcccgaatgtcgcggcggggggttagagccccggcattacgtgccgaagtatccagttcttcgggcttaccaatatgggccagaattgctgaccagttatcgtgagagtaattcatcggcacgttaaatcatatcaggcgtaataccacaacccttaagttagcgcttatgggGAAACATcccc > 1:144797‑M1/217‑227 (MQ=255) tctACGATCTGCCGTCCATGGAAGACGTCGTATAAGAGGCTATCGACGAGTCGGTAATTGATGGTCAAAGCAAACCGTTGCTGATTTATTGAAAGCCGGAAGCGCAACAGGCACCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATGCAATTAGTTACCAAAAAAGGGGGGAGTTTTTCTCCCCTTTACTTTTTCCTCTATTCTCGGGGTTGAATGTGGGGGAAACATcccctaa > 2:451831/3‑225 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |