Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,609,767 | T→G | 24.6% | G118G (GGT→GGG) | prfC → | peptide chain release factor RF‑3 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,609,767 | 0 | T | G | 24.6% | 73.9 / 3.0 | 55 | G118G (GGT→GGG) | prfC | peptide chain release factor RF‑3 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (16/21); new base G (12/3); total (31/24) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.99e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AAAAGGCCGTGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTACCACCTTTATAAAGACGAAACCTATCTC > NC_000913/4609551‑4609989 | aaaaGGCCGTGGGTCCAACCAGTCCGGTAAGGCGGGCTGGATGGAGGTGGAAAAGCAGCGTGGGATCGCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCg < 2:642081/228‑1 (MQ=255) tGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGTTACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTCCCTGTTGGTTTTCGACGCCGCCAAGGGGGTGGAAGATCGTACCCCTaa > 2:119087/1‑228 (MQ=255) tGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGGGGACTCCTGCCTGATGGTTATCGACTCCGCAAAAGGGGTTGAGGATCGTAccccaca > 1:651544/1‑224 (MQ=255) tGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTAACGGCGTTGGACGGCTGCCTGATGGTTACCGACCCCGCAAAAGGGGTTGAGAATCGTACCCGTaa > 2:651452/1‑228 (MQ=255) tGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCCGACGGCGGTGGCATTCTGACGTGTGGTGATGGACGCTGCAAAAGGCGTTGCAGAGCgacccccg > 1:364884/1‑219 (MQ=255) tGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGCACCCTGACGGCGGTGGACGGCTGCCTGATGGTTATCGACTCCGCACAAGGGTTTGCAGATCGTACCCGGaa > 1:83436/1‑228 (MQ=255) cACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGtt > 1:557843/1‑228 (MQ=255) aCTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGCGGACTGCTGCCTGCTGGTTATCGACGCCGCCAAAGGAGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTccgc > 1:343102/1‑227 (MQ=255) tggagatggaAAAGGGGGGGGGGTCCTCCATTTCTTCGCCTGGGATTCAGTTTCCGT‑TCACCGATTGCCGGGTTAACCGGCTCCACACCCCGGGGCACGAAGACTTCCCGGAAGTTACCTATCTTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTCCCCGTCTGCGCGACACGc < 2:557340/228‑1 (MQ=255) gagatggaAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCGGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGcc < 1:32956/227‑1 (MQ=255) gaAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGCCGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGGGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTTGGCGGGACACGCCGGTCCTc > 1:241131/1‑228 (MQ=255) aaaaGCAGCGTGGGATCCCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACCCCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAGGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCa < 1:119087/228‑1 (MQ=255) aaaaGCAGCGTGGAATCTCCATTACTTCGTCTGGTATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTTGTTAACCTGCTAGACACCCCGGTGCACGAAGACTTCTCGGAAGATTCCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCa < 1:358794/228‑1 (MQ=255) gTGGGATCTCCATTACGACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATg < 1:382743/185‑1 (MQ=255) ggctctcCTTTACTTCGGTTGTGGTGCGTGTTCCGTATCC‑CGCTTCCCTGGTTACCCGGCTCGCCACCCCGGGGATCGAAGTTGTCTCGGACTATATCGATCGTACCTGTACTGCGTTTGACTGCTGCCTGATGGTGATCGACGCCGCAAAAGGGGTTGAAGATCGTACCCTTAATCTGATGGAAGTTCCCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCGCCTTTATGAAc < 2:435966/224‑1 (MQ=255) ctcCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGCCTGATGCCCGATTGTTATCGACTCCGCAAAAGGTGTTGACGAGCGCACCCGTAAGCTGACGGAAGTTACCAGTCTGCGCGCAACGCCCACTCTGCCCCTTCAGAACAAACt > 2:239820/1‑228 (MQ=255) ttcttcGTCTGGTATGGAGTTCCCGTATCA‑CGTTTGCCTGGTTACCCTGCTCGACCCCCCGGGGCACGAAGGCTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGGGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCg < 2:607790/223‑1 (MQ=255) cGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGCGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGGGCGCCACCCCGCTCCCCCCCTTTTTGAAACAAATTTACCgggtaa > 2:445492/1‑223 (MQ=255) cGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTCCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGGGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCACAACGCCAATCCCAACCATTATGAAAAAAATTGAcctgacaa > 2:11400/1‑222 (MQ=255) tCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACACGTCTGCTCGACACGCCGATCCTCACCCTTATGAACAAACTTGACCGTGAGATc > 1:362558/1‑228 (MQ=255) tCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGAAAGTTACCCGTCTGCCGGACCCGCCGTTCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATc > 1:468743/1‑228 (MQ=255) tCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGGGTTGGAGATCGTACCCCTAAGCTGATGGAAGTTACCCGCCTGCGCGCCCCCCCGAGCCCCACCTTTTTGAACAAACTTCACCGGGAAATc > 2:599114/1‑228 (MQ=255) tCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCCGATGGTTATCGACGCCCCAAAAGGTGTTGACGATCGTACCCGGAAGCCGATGGAAGCTCCCCGCCTACGCGAAACCCCCCACCACACATTTATGACCAAACTTGACCGCGATATc > 2:55621/1‑228 (MQ=255) tCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGGGGACTGCTGCCTGATTGTTATCGACGCCGCAAAAGGGGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGACGTTACCCGTACGGCCGCCACGCCGACCCCCCCCTTTATGAACCAACTTAACCGGGATATc > 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gctATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCCCGACCCCCCGGGGCACGAAGTCTTCTCGGAAGATACCTTTCGTTCCCTGACGGCGTTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGAAGGAg < 1:484370/225‑1 (MQ=255) a‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAAATTGACCGTGATATCCGCGACCCCATGGAGCTGCTCg > 1:49246/1‑228 (MQ=255) gATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCg < 1:11400/226‑1 (MQ=255) ctttGCTTGGTTACCCTTCCCGCCCCCCCGGGTACCGAAGCCTTCTCGGAAGATACCGATCGTACCCTGACGGCGGGGGACTGCTGCCTGAAGGTTGTCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGACCGTACCCGTAAGCGGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGAt < 2:309160/226‑1 (MQ=255) aatggCCGGGTTAACCTCGTGAACACCCCGGGGCACGAAGACTTCCAGGAAGGTACCTACCGTGCCCTGACGCGGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTTTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGAGCCGATGGAGCTGCGCGAt < 2:390490/224‑1 (MQ=255) aTTGCCTGGTTAACCTGCTCGACCCCCCGGGGCACGAAGTCTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGAt < 1:423108/227‑1 (MQ=255) gTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGGCCTTCTCGATGAAGTTggg > 1:148189/1‑226 (MQ=255) ttACCCTGTTCGACCCCTCGGGGCACGAAGACTTCTGGGAAGATCCCTATCGTGCCCGGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGGCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTgaga < 2:412222/228‑1 (MQ=255) cccTGCCCGACACCCGGGGGCAGGAAGACTTCGCGGAAGATACCAGCCTTACCGTGAGGGCGGTGGCAGGCTGCCTGATGGTTAGCGAGGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGGCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCTACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACg < 2:455621/227‑1 (MQ=255) tCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAAATTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGCACGAGCTGAAAATCGGCTGTGGGCCGGTCCCCCGGCCGATTgggcgggg > 1:306128/1‑222 (MQ=255) tCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGAAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGAGGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGGCCCGATCACCTGGCCGATTGACTGCgg > 1:73296/1‑228 (MQ=255) cctgggcgggggTGGCCTGCTCCCGTAGGGTTATCGGCGCCGAAAAGGGTGTTGAAGACCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTAGGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAg < 2:651544/221‑1 (MQ=255) cccTGCCGGCTGTGGACTGCGGCCTTATTGTTAGCGACGCAGAAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTTATGGAAGTTACCCGTCTGGGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAg < 1:223238/227‑1 (MQ=255) cccTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCCCCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGACGTTGGAAGCGAGATGCAAATCGGCTGTGACCCGACCACCTGGCGGATTGGCGGGGGCacca > 2:240443/1‑225 (MQ=255) cccTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAACTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGTTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGGGCGGAGAACCTGCCCGATGGGCGGAGGAAAGc > 2:269992/1‑228 (MQ=255) aCGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGGAGGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGtt > 1:357315/1‑227 (MQ=255) aCGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGACCTGaaaa > 1:29098/1‑181 (MQ=255) aCGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGGTGAGAACGAGCTGAAAAACCGCAGTGCGCCGGTCACCTGGCCGATTGGGCGCGGCAACCCGttt > 2:579154/1‑228 (MQ=255) tgctgcCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTac < 1:445492/228‑1 (MQ=255) gttcgcgtagggTTATCGCCCCCGCAAAGGGGGGTGAAGATCGTACCCGGAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCCGAGCGCCACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTac < 2:49246/217‑1 (MQ=255) ctgcCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGGGTTGAAGATCGTACCCGGAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTCCTCGATGAAATTGGGAACGAGCTGAAAATCGCCTGTGCGCCGATTACCTGGCGGATTGGGTGCGGCAAAAGGTTTAAAGGGGTTTaca > 2:600999/1‑226 (MQ=255) cctgtaTGTTTTTCGACGCGGCAAAAGGTGTTGAAGACCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTCCCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTaccac < 2:241131/222‑1 (MQ=255) aTCGATGCCGCAAAGGGGGTTGAAGATCGTACCCGTAAGGTGAGGGAAGTTCCCCGTCTGGGCGGCCCGGCGATCCTCCCCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTACCACCTTTATAAAGAc < 2:148189/228‑1 (MQ=255) aTCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGAGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCAGCTGTGCGCCGAGCACCTGGCTGATTGGCTGCGGCAAGCGTGTTAAAGCCCTTTa > 1:137793/1‑212 (MQ=255) tggACCCCTCAAAAGGTGTTGAAGATCTTCCCCGTAAGCGGATGAAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCCCCTTTATGAACAAACCTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTACCACCTTTATAAAGACg < 1:225100/226‑1 (MQ=255) gcctcAAAAGGTGTTGAAGCTCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTACCACCTTTATAAAGACGAAAc < 1:599114/227‑1 (MQ=255) cgcAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCTGTTACACCCTTTTTAAAAACGAAAccat > 2:442262/1‑226 (MQ=255) aaaGGTTGTGAAGTTCTTCCCCGTAAGGTTATGGAGATTCCCCGTCGGGCCACCCCGCCGCTCCCCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGAGGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTACCACCTTTATAAAGACGAAACCTAtctc < 2:357315/228‑1 (MQ=255) | AAAAGGCCGTGGTTCCAACCAGCACGCTAAGTCGGACTGGATGGAGATGGAAAAGCAGCGTGGGATCTCCATTACTACGTCTGTGATGCAGTTTCCGTATCA‑CGATTGCCTGGTTAACCTGCTCGACACCCCGGGGCACGAAGACTTCTCGGAAGATACCTATCGTACCCTGACGGCGGTGGACTGCTGCCTGATGGTTATCGACGCCGCAAAAGGTGTTGAAGATCGTACCCGTAAGCTGATGGAAGTTACCCGTCTGCGCGACACGCCGATCCTCACCTTTATGAACAAACTTGACCGTGATATCCGCGACCCGATGGAGCTGCTCGATGAAGTTGAGAACGAGCTGAAAATCGGCTGTGCGCCGATCACCTGGCCGATTGGCTGCGGCAAGCTGTTTAAAGGCGTTTACCACCTTTATAAAGACGAAACCTATCTC > NC_000913/4609551‑4609989 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |