| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,931,523 | A→C | 13.6% | T70P (ACC→CCC) | kup → | potassium transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,931,523 | 0 | A | C | 13.6% | 222.8 / 5.1 | 91 | T70P (ACC→CCC) | kup | potassium transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (47/26); new base C (2/13); total (49/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.75e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACATTTCATATTTCAACGAAAGACTAGTCTATGAGCACTGATAATAAGCAATCATTGCCCGCGATTACCCTCGCGGCGATTGGAGTTGTCTACGGCGATATTGGTACCAGCCCGTTATATACACTTCGTGAATGTTTGTCCGGCCAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCT‑CACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGG‑TGA‑GGGGGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGTGAAGTCGTCATAACACCCGCTATTTCGGTGATGTCAGCCATTGAAGGTCTGGAAATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAAT > NC_000913/3931286‑3931758 | ccaTTTAATATTTCAACTAAAGACTAGCCTAAGGACCCTGATAATAAGCAATCATTGCCCGCGATTACCCTCGCGGCGATTGGAGTTGTCTACGGCGATATTGGTACCAGCCCGTTATATACACTTCGTGAATGTTTGTCCGGCCAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCT‑CAc < 1:583310/238‑1 (MQ=255)acaTTTCATATTTCAACGAAAGACTAGTCTATGAGCACTGATAATAAGCAATCATTGCCCGCGATTACCCTCGCGGCGATTGGAGTTGTCTACGGCGATATTGGTACCAGCCCGTTATATACACTTCGTGAATGTTTGTCCGGCCAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATGGCGGGTCTTCTGGGTGCAAATCTTTGTGGTTTCCATTAAAAATCT‑Ca > 2:12737/1‑238 (MQ=255)acaTTTCATATTTCAACGAAAGACTAGTCTATGAGCACTGATAATAAGCAATCATTGCCCGCGATTACCCTCGCGGCGATTGGAGTTGTCTACGGCGATATTGGTACCAGCCCGTTATATACACTTCGTGAATGTTTGTCCGGCCAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCT‑Ca > 1:90302/1‑238 (MQ=255) cATATTTCAACGAAAGACTAGTCTATGAGCACTGATAATAAGCAATCATTGCCCGCGATTACCCTCGCGGCGATTGGAGTTGTCTACGGCGATATTGGTACCAGCCCGTTATATACACTTCGTGAATGTTTGTCCGGCCAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGGGGTTTCCTTTAAATATCT‑CACCTTCGt > 1:247690/1‑239 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |