| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | 62.8% | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 458790 = | 53 (0.520) | 104 (0.990) | 72/420 | NT | 65.6% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 458795 | 50 (0.490) | 70 (0.670) | 51/418 | NT | 57.6% | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
| ? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
GGTCCATCGCCGCTTCCAGACAACGGATAGATTTTTCCCGCCCGACAAATAAGGGGATGACCATGTGCGGATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/459023‑458790‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGT > NC_000913/608008‑608243 tGTCCTTCGCTGCTTCCAGACAGCGGTTAGATTTTTCCCGCCCGACAAATAAGGGGATGACGAGGTGCGGATAAACCACCACCTCGCGCTGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCAT < 2:577531/238‑1 tcccctCTTCCAGACAACGGATAGATTTTTCCCGCCCGAAAAATAAGGGTATTGCCATGTGAGGATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGTATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGC < 2:95139/233‑1 TCGCCGCTTCAAGACAACGGAAAGATTTTTCCCGCCCTGCAAATAAGGGGATGACCATGTGCGGATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGC < 1:1136725/239‑1 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CAACGGATAGATTTTTCCCGCCCGACAAATAAGGGGATGACCATGTGCGGATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAACGCTAACTTAAGGGTTG > 2:176314/1‑239 CGGATAGATTTTTCCCGCCCGACAAATAAGGGGATGACCATGTGCGGATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGG > 1:433445/1‑239 CGGATAGATTTTTCCCGCCCGACAAATAAGGGGATGACCATGTGCGGATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGG > 1:514293/1‑239 CGGATAGATTTTTCCCGCCCGACAAATAAGGGGATGACCATGTGCGGATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGAATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGG > 1:996153/1‑239 CCCGACAAATAAGGGGATGACCATGTGCGGATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTAAGACCGCTCAGGCTTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGAAACAAATATGCTTCACGCCATCTATTAACATGAACGTCAGAATATGGAGTTGTTTCCCCATAACCGCTAACTTAAGGGTTG‑GGTAATTAGCCTGGTATGgt > 2:1174053/1‑237 ATGACCATGTGCGGATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGATTTAAGCCTGGAATGATTTAACGTGCCGCTGA > 2:192829/1‑239 attTGCGGATAACCCCCCACTTCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACT < 2:253298/236‑1 ATGTGCGGATAAACCCCCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACT < 1:568053/239‑1 TGTGCGGATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACT > 1:485271/1‑238 GTGCGGATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGAATTACGCCTGTTATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTC > 1:253298/1‑238 TGCGGATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGCTATGATTTAACGTGCCGTTGAATTACTCTC > 1:1088116/1‑239 TGCGGATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGGGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCGGAGGAATTACTCTa > 2:598691/1‑238 GATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTACCTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCGGTTATGTTTTAACGGCCCAATGAATTACTtccccga > 2:1212565/1‑232 ATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGAT < 2:498892/205‑1 ACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCAGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCAATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTaccgtac > 2:1324146/1‑229 CCACCCCATCGCGGCGCGGCAATTCGGGGATTTCCATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG < 1:70268/239‑1 CCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGACCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTATCCTCACGAAAAATG > 2:204467/1‑239 CCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAACGCTAACTTAAGGGTTGTGGAATTACGCCTGATCACATTTAACGTGCCTATGAATTAACCCCACGAAAACGGGga > 2:718885/1‑237 cCATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTAAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAG < 2:1023221/238‑1 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AGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTG > 1:1349576/1‑238 gccGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAAAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCTATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGC < 1:1324146/236‑1 CGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACT < 2:645851/210‑1 GGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGGTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGC < 1:192829/237‑1 GGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGC < 1:1299104/237‑1 GGCAATACGGGGAGTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGC < 1:1158678/237‑1 AATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCAT < 1:646482/238‑1 GGGGTTTTCAATGCTTTCATAACGCTCAGGATTCATAGAGCTTTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGT < 2:591267/239‑1 GGGGTTTTCAATGCGTTCAAGACCCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGT < 1:359703/239‑1 TCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCG < 1:598691/239‑1 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CTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACTACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGCATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGATGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGACGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCACTTATGGCCCATATTGGTAATCCCGAAGAACTGGAAACTTCTGCACGTAATGCCGGGcagct > 1:1112365/1‑234 ATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGTTCAGCAATTCTGGC > 2:430774/1‑174 ATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGC < 1:430774/174‑1 GCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATT < 1:936120/163‑1 GCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATT > 2:936120/1‑163 TGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATCCTGGCCCATATTGGTAAGCACGAAGAACTGGATAATTAGGCACGTAATACCGGGGGCCTAACCCGCCGCCCCGAAAGTCCTGATGCTGC > 1:1070390/1‑238 ACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTATGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCCCGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGGGATGCggaaa > 2:1314556/1‑233 cacggcgtTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAAC < 1:989865/230‑1 GACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCT > 1:212173/1‑238 CTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCGGCCGCCGCGAAATTCGGGATGCTGCAACTCGGCT > 1:273914/1‑239 TGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCT < 1:176314/238‑1 CTTCCCTCCATTTTTTAACATGTCCGTCATTTTATGGGGGTGGTTCCCCTTAAGCGCTAACTTAAGGGTTTGGGTAATCCGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGTATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTC < 2:1034827/239‑1 CTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGACGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGA > 2:882129/1‑219 CTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGA < 1:882129/219‑1 CGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCATGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCG < 2:517321/183‑1 CGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCG > 1:517321/1‑183 CGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCC > 1:662453/1‑78 CGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCC < 2:662453/78‑1 CATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGG > 1:446397/1‑236 CATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCG > 1:1327679/1‑180 CATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAACCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGGCCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGGGATGCTGCAACACTGCCACGCCTGGGGCcg > 2:357890/1‑237 CATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGC < 2:1175155/133‑1 CATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGC > 1:1175155/1‑133 TCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCGGGGGCTG > 1:485342/1‑237 TGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGGTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTGGGGATGCCGCAACCTGGCACCGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCgc > 2:310808/1‑237 TACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGTCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAA < 2:549557/189‑1 TACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGGGATGCTGCAACTCTGCTCCGCCCGGGGCTGGCTTCCGGCCCCGG > 1:282797/1‑239 TACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAA > 1:549557/1‑189 TACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGAAACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGATGCAAATCTGCTACGTATGGGGCTGGCTTACGGCCCCGG > 1:546342/1‑239 TACGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCT < 1:99067/36‑1 ACGTCAGTTTATGGGGATGTTT‑CCCATAAGCGCTAATTTAAGGGTTTTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGG < 1:1363413/239‑1 CGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGA < 1:1046677/195‑1 CGTCAGTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGA > 2:1046677/1‑195 catttTATTGGGGTTTTTCCCCATAACCCCTATCTAAAGTGTTGTGGTATTCCGCCTGTTATGGTTTAACGGGCCGATGAATTACTCCCTCGTTAACGGGTCACCAATTCTGGCCCATATTGGTAACCCCGAAGAACTGGATGCTTCGCCACGTAATGCCGGGTCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGG < 2:916304/231‑1 GTATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCCCGAAATTCGGGAAGCTGCAACTCTGCTACTCCTGGGGCGGGCTTACGGACCCCGGGGGcag > 2:152421/1‑236 TATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGGGATGCTGCCACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATG > 1:614542/1‑238 TATATGGGGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCCTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATG > 1:1201748/1‑238 ttTGGGGATTTTTCCCCATAAGGCCTAACTTAAGGTTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCA < 2:341459/237‑1 GGATGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGAACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGAGGTCATTACG > 1:916304/1‑239 TGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCGTTACGTGA > 1:1221404/1‑239 TGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGg > 1:341459/1‑238 TGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGGGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGGGGGCATTACGTGA > 2:805743/1‑239 TGTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGGGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACtcga > 1:608095/1‑235 GTTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGGGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAA < 1:357890/239‑1 TTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAA > 2:1336925/1‑238 TTTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAA < 1:1336925/238‑1 ccCCCCATAAGGGCTATATTAAGGTTTTTGGTTTTACCCCTTATTTGATTTAACGCGCCGATGAATTACTCTCCCGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGT < 2:1296712/237‑1 TTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACCCTGCTCCGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGAGGTCATTCCGTGAAG > 1:976472/1‑238 TTCCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGGGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGT < 1:152421/239‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTTCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTG < 1:817911/231‑1 GGTCCATCGCCGCTTCCAGACAACGGATAGATTTTTCCCGCCCGACAAATAAGGGGATGACCATGTGCGGATAAACCACCACATCGCGCAGCGGCAATACGGGGATTTCAATGCGTTCAGAACGCTCAGGATTCATAGAGCTCTCTCTTAGTTTAATTTCCGCCAGGTAATCAGATGACACGACTGTGCTTCACGCCATCTATTAACATGTACGTCAGTATATGGGGATGTTTCccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/459023‑458790‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGGGGCTCTAACCCGCCGCCGCGAAATTCGTGATGCTGCAACTCTGCTACGTCTGGGGCTGGCTTACGGCCCCGGGGGGATGTCATTACGTGAAGT > NC_000913/608008‑608243 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |