Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 3,027,731 | A→G | 14.6% | E204G (GAG→GGG) | ghxQ → | guanine/hypoxanthine permease, high affinity; guanine/hypoxanthine:H+ symporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,027,731 | 0 | A | G | 14.6% | 258.1 / 4.9 | 115 | E204G (GAG→GGG) | ghxQ | guanine/hypoxanthine permease, high affinity; guanine/hypoxanthine:H+ symporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/60); new base G (15/4); total (51/64) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.98e-04 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
ATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCGTACCCGGCGGGATCTTGTTGGTGATTATTGCAATTTCGATCATCGGCTTAATCTTTGACCCAGCGGTGAAATACCACGGTCTGGTGGCGATGCCAAGCCTGACTGGCGAAGATGGTAAGTCTCTGATTTTCAG‑CCTC‑GATATTATGGGTGCACTCCAGCCAACTGTACTTCCGAGTGTACTGGCATTGGTGATGACCGCAGTGTTCGACGCTACTGGC > NC_000913/3027496‑3027960 | attgtCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATTGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGaa < 1:774364/235‑1 (MQ=255) 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ATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCGTACCCGGCGGGATCTTGTTGGTGATTATTGCAATTTCGATCATCGGCTTAATCTTTGACCCAGCGGTGAAATACCACGGTCTGGTGGCGATGCCAAGCCTGACTGGCGAAGATGGTAAGTCTCTGATTTTCAG‑CCTC‑GATATTATGGGTGCACTCCAGCCAACTGTACTTCCGAGTGTACTGGCATTGGTGATGACCGCAGTGTTCGACGCTACTGGC > NC_000913/3027496‑3027960 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |