| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,011,490 | A→G | 9.2% | T139A (ACT→GCT) | yigM → | putative inner membrane EamA‑like transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,011,490 | 0 | A | G | 9.2% | 320.2 / 3.2 | 116 | T139A (ACT→GCT) | yigM | putative inner membrane EamA‑like transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (48/53); new base G (9/3); total (58/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.24e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TGGGCGCGATGCAGCTTGGCGTGATGTATATGCTGAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTTACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCAT‑AACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGTGATTGCATGGTTCTTGCTGGGAAATGCGCAGAAAATG‑CCGCAAACCACGCTGCAATGGGGCATTCTGGTGTTTCTTGGCGTGGTGGCTTCCGGGATTG > NC_000913/4011263‑4011727 | tggGCGCGATGCAGCTTGGCGTGATGTATATGCTGAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGGTCCGGGATTATTCCCCTTGCTCCGGTCCCCGACACTTTTTGGACTGGCtt > 1:874710/1‑235 (MQ=255) ggCGCGGTGCGTGTTGGGGTGAGTTTTATGCTGAGTTTCCGCCATTATCCC‑TACCTGAAGGTTTCCGAGCTGCTTCTGTTCACCGGTCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATGTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTt‑gct‑gc < 2:1364423/238‑1 (MQ=255) ggCGCGATGCAGCTTGGCGTGATGTATATGCTGAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGGGCTTGGTGGCGGGGTTATTCCCCTTGTACAGGGCACCGCCCCTTTCTGGGCGGGCCt‑ggt‑gtt > 2:160952/1‑237 (MQ=255) cgcgATGCAGCTTGGCGTGATGTATATGCTGAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGGGATTGGTGCCGGGGTTATTCGCTATGATCAGGTTACCGCCCATTTCTGGGCTGGCttccgccctg > 1:1032005/1‑231 (MQ=255) aacTTGGCCGGATTTAAATGCTGAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCAAct < 1:407177/236‑1 (MQ=255) cGTGATGTATATGCTGAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGTTTGGGGCCGGGCTTATTCGCTATGGTCAGGTCACCGACCATTTTTGGACTGGCTT‑GCTCGCTGGTGAAAC‑CTCCCata > 1:665453/1‑239 (MQ=255) aTGTATATGCTGAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGATAATGGTGCCCGGGTTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCAATTTTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGGGCAACACTCCAatata > 1:340532/1‑236 (MQ=255) tGTATATGCTGAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACt > 1:1187606/1‑239 (MQ=255) tGTATAGTCTGAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCt < 1:1324185/210‑1 (MQ=255) gCTGAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCa < 1:1186158/239‑1 (MQ=255) tGAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCAtt < 1:203718/239‑1 (MQ=255) gAGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGGTTATTCGCTATGATCCGGGCCCCCACCATTTTTGGACTGGCTTGGTT‑CCTGGGGCACCTCCCAACTATCACTTTTCCCttt > 1:611308/1‑239 (MQ=255) aGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGGTCAGGGCACCCGCCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTTGGGCAACTCTCCCATATCCCTTTTGCCAttt > 1:1202357/1‑237 (MQ=255) aGTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGGGGTTGGGGCCGGGGGTATTCTCTTTGGTCAGGTCACCCACCCTTTCTGGGCTGGCTT‑GTT‑GTTGGTGCAAACCTCCAAAAAACCATTTGCCATTgg > 2:623874/1‑239 (MQ=255) gTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGGTTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGGGCAACTCTCCAATATACCTTTTGCCATTGGc > 1:22875/1‑239 (MQ=255) gTTTCCGCGCTTATCTC‑TACCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑TCGGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTg > 1:753470/1‑237 (MQ=255) ccGCGCTTAGCTCTTCCCTGA‑GGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCCCCGTGCTGACGCCGCTTTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑tg‑g < 1:226948/239‑1 (MQ=255) aCCTGACGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGGGCCGGGATTATTCGCTATGGTCAGGGCACCGACCCTTTCTGGGCTGGCTT‑GCT‑CCTGGGGCAACTTTCCAATATCACTTTTGCCATTTGCC‑TT‑GTGGGTTACAAAcc > 1:1372150/1‑237 (MQ=255) ccgtttcccGGGCTTCTGTTTTTCCCCGTGCTTGCCCCGCTCTCCATCCCGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTTACAAACGCCTGAt < 2:1269908/232‑1 (MQ=255) aCGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCCCCGTGCTGACGCCGCTCTTCATCGCGGTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTTACAAACGCCTGAt < 1:623874/239‑1 (MQ=255) aCGGTTTCCGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGGTTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATACCTTTTGCCATTGGCA‑TT‑GTGGGTTTCAAACGCCTGAt > 1:1303919/1‑239 (MQ=255) tttCCGGGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTTACAAACGCCTGATg < 1:1107388/236‑1 (MQ=255) ccGAGCTGCTGCTGTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTTACAAACGCCTGATGGAAACt < 1:199054/239‑1 (MQ=255) gAGCTGCTGCTGTTCCCCGTGCTGACGCCGCTTTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTTACAAACGCCTGATGGAAACTCg < 1:711424/239‑1 (MQ=255) cttctgctgTTCACCGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTTACAAACGCCTGATGGAAACTCGcc < 1:1215911/235‑1 (MQ=255) 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ttttcccccttcTGGCGGCGCTCTACATTCCGTTGATTTATGACATTATGAGTAAGCGCGGGCGGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGGGACTTGCTGGCGGGGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTTACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCca < 2:1312075/228‑1 (MQ=255) ttttCGCCGGGCGGGCGCCGTTTTACAACGCGCTTTTTTAGAACATCATGGGTAAGGGTCGTCTGCGTTGGGGCTAGGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTTACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCca < 2:628737/237‑1 (MQ=255) ccGTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTTGACTGGCTT‑TCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTTACAAACGCCCGATGGAAACTCCCCCGC‑TGcccaagcct > 1:400072/1‑232 (MQ=255) gTGCTGCCGCCGCTTTACATCACGTTGATTTATGACATCATGGGTACGGGCCGTCTGCGCTGGGGCTTTGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTTACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCAT‑aa < 2:753761/239‑1 (MQ=255) gTGCTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTTACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCAT‑aa < 1:749150/239‑1 (MQ=255) cTGACGCCGCTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCAAATCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTTACAAACGCCTGATGGAAACTCGGCCCA‑TGCCCCACCAT‑aaac > 1:276405/1‑236 (MQ=255) cccctttACCTCCCGCTGATTTATGACAGCATGGGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATTCCTTTAGCCTCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTTACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCAT‑AACGC‑CTTTGc < 2:400072/233‑1 (MQ=255) tgcTTTACATCACGTTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTTACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCAT‑AACGC‑CTTTGC‑g < 2:563526/238‑1 (MQ=255) cgcTCTACATCACGCTGATTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTTACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCAT‑AACGC‑CTTTGC‑g < 1:963035/239‑1 (MQ=255) 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aTTTATGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTTACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCAT‑AACGC‑CTTTGC‑g < 1:430630/222‑1 (MQ=255) tGACATCATGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTTACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCca < 1:1082076/199‑1 (MQ=255) tcatGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGTTCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGCATGGTGCCGGGGTTTTTCGCCATGATCCTGTTGCCCACCCTTTTTTGGCAGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCAAATCTCCAATAACCCTTTTGCCACTGGCA‑TGTGGGGGTTACAAA‑GCCTTCTGGTAACACGCCCGA‑GTCCCCAGCCT‑AACGCACTTCGT‑GGGGTTGTTTTTT‑Gg‑cggggtttggtg > 2:799412/1‑229 (MQ=255) tcatGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTTGTGCCGGGGTTATTTGCTATGATCAGGTCACCGACCCTTTTTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCa > 2:1074091/1‑124 (MQ=255) 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tcatGAGTAAGCGCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGGGGTTGGTGCCGGGGTTATTTGCTATGATCAGGTCACCCACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑TCTGGGGCACCTCTCCAATATCACTTTTTCCATTGGCATTG‑GTGGGTCA‑AAACGCCTGATGGAAAATCGCCCCAGTCCCAC‑CCAT‑AAAGC‑CCTTTC‑GGGGTTCCTTCTTGGG‑CGCTTTTTtggg > 2:397798/1‑238 (MQ=255) gggtagggcccGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCTTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTTACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCAT‑AACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAg < 2:611308/230‑1 (MQ=255) gTAAGGCCCGTCTGCGCTGGGGCTATGCCTTTAGCGCCTTGCTGGCGGTGATTGGTGCCGGGATTATTCGCTATGATCAGGTCACCGACCATTTCTGGACTGGCTT‑GCT‑GCTGGTGCAACTCTCCAATATCACTTTTGCCATTGGCA‑TG‑GTGGGTTACAAACGCCTGATGGAAACTCGCCCGA‑TGCCACAGCAT‑AACGC‑CTTTGC‑GTGGTTCTATCTT‑GG‑CGCGTTTCTGGTGGCAGt < 1:1085703/238‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |