Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 4,022,863 | A→C | 7.4% | H43P (CAC→CCC) | tatC → | TatABCE protein translocation system subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,022,863 | 0 | A | C | 7.4% | 422.5 / 2.3 | 137 | H43P (CAC→CCC) | tatC | TatABCE protein translocation system subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (75/47); new base C (3/11); total (78/59) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.02e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
TCGCCGGAACAGAAGCCAGAAACCACGCCAGAGCCGGTGGTAAAACCTGCTGCGGACGCTGAACCGAAAACCGCTGCACCTTCCCCTTCGTCGAGTGATAAACCGTAAACATGTCTGTAGAAGATACTCAACCGCTTATCACGCATCTGATTGAGCTGCGTAAGCGTCTGCTGAACTGCATTATCGCGGTGATCGTGATATTCCTGTGTCTGGTCTATTTCGCCAATGACATCTATCACCTGGTATCCGCGCCATTGATCAAGCAGTTGCCGCAAGGTTCAACGATGATCGCCACCGACGTGGCCTCGCCGTTCTTTACGCCGATCAAGCTGACCTTTATGGTGTCGCTGATTCTGTCAGCGCCGGTGATTCTCTATCAGGTGTGGGCATTTATCGCCCCAGCGCTGTATAAGCATGAACGTCGCCTGGTGGTGCCGCTGCTGGTTTCCAGCTCTCTGCTGTTTTATA > NC_000913/4022626‑4023093 | tccccGGAACAGAACCCAAAAACCACGCCAGAGCCGGTGGTAAAACCTGCTGCGGACGCTGAACCGAAAACCGCTGCCCCTTCCCCTTCGTCGAGTGATAAACCGTAAACATGTCTGTAGAAGATACTCAACCGCTTATCCCGCATCTGATTGAGCTGCGTAAGCGTCTGCTGAACTGCATTATCGCGGTGATCGTGATATTCCTGTGTCTGGTCTATTTCGCCAATGACATCTATCAc < 2:1020617/236‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |