Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,097,266 | 0 | C | A | 12.3% | 339.0 / 9.1 | 144 | intergenic (+41/+55) | hisI/wzzB | phosphoribosyl‑AMP cyclohydrolase and phosphoribosyl‑ATP pyrophosphatase/regulator of length of O‑antigen component of lipopolysaccharide chains |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (63/60); new base A (2/17); total (66/78) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.12e-04 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
TATGCCAGCGGCACCAAACGCATTGCGCAGAAAGTGGGTGAAGAAGGCGTGGAAACCGCGCTGGCAGCAACGGTACATGACCGCTTTGAGCTGACCAACGAGGCGTCTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTAATTGAGAACCTGCGTAAACGGCATCAGTGAGTTGCGGGGTAAGCGGATGCGATATTGTTGCCGCATCCGGCAAAAAAACGGGCAAGGTGTCACCACCCTGCCCTTTTTCTTTAAAACCGAAAAGATTACTTCGCGTTGTAATTGCGTAGAGCATTACGCCCCAGCACAATCCCCGCGCCAACCATGCCACCCAGCAGCACCGCCAGAATCAAGGTAATTGCCTTTTTCGGGCTATCACGACGAATAGGTAACATCGGTTTCATCACATAACGGTAAGCATGAATATCAAGATCATCAA > NC_000913/2097028‑2097493 | tATGCCAGCGGCACCAAACGCATTGCGCAGAAAGTGGGTGAAGAAGGCGTGGAAACCGCGCTGGCAGCAACGGTACATGACCGCTTTGAGCTGACCAACGAGGCGTCTGATTTGATGTATCACCTGCTGGTGTTGTTGCAGGATCAGGGGCTGGATTTAACGACGGTAATTGAGAACCTGCGTAAACGGCATCAGTGAGTTGCGGGGTAAGCGGATGCGATATTGTTGCCGCATCCGGc > 1:752992/1‑239 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |