| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2882234 = | 78 (0.900) | 3 (0.040) | 3/394 | NT | 4.2% | coding (404/483 nt) | casB | CRISP RNA (crRNA) containing Cascade antiviral complex protein |
| ? | NC_000913 | 2882252 = | 66 (0.830) | coding (386/483 nt) | casB | CRISP RNA (crRNA) containing Cascade antiviral complex protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
TTTGACTTGAAATTCTTACTCGTCTTTTGCCGCCGAAAATAGCGTCTTTCTGCATGTTCATATCGTCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAG‑CTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGCTCCGATTTTTTGTCCTGATGTCGGATGACATTCTTTCCTGCG‑CT‑CAGGCAAAACACCATGCGCAAAAGAGCCTGCTGGTGACGTGGGTTTT > NC_000913/2882016‑2882489 | tttGACTTGAAATTTTTACTCGGCTTTTGCCGACGAAAATAGCGTCTTTCTGCATTTTCATAGCGTCGCGGTTCAGACATGAATGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTc < 2:239259/238‑1 (MQ=255) ttGACTTGAAATTCTTACTCGTCTTTTGCCGCCGAAAATAGCGTCTTTCTGCATGTTCATATCGTCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATCCAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGTTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCaa > 1:1036195/1‑239 (MQ=255) ttGACTTGAAATTCTTACTCGTCTTTTGCCGCCGAAAATAGCGTCTTTCTGCATGTTCATATCGTCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCaa > 1:132648/1‑239 (MQ=255) tGACTTGAAATTCTTACTCGTCTTTTGCCGCCGAAAATAGCGTCTTTCTGCATGTTTATATCGTCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAAAATCCTGGCCATTCATGGCCAGTCAAg > 1:627813/1‑239 (MQ=255) aCTTGAAATTCTTACTCGTCTTTTGCCGCCGAAAATAGCGTCTTTCTGCATGTTCATATCGTCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCTCCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTa < 1:266439/239‑1 (MQ=255) ttcTCGTCTTTTTCCGCCAAAAATAGCGTCTTTCTGCATGTTCATATCGTCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGt < 2:543560/237‑1 (MQ=255) tACTCGTCTTTTGCCGCCGAAAATAGCGTCTTTCTGCATGTTCATATCGTCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGt < 2:932165/239‑1 (MQ=255) tcttgttctttCCCGCCGAAAATTGGGTTTTTCTGCATGGTCATATCGTCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTg < 2:211415/231‑1 (MQ=255) tgtgcctgagcgcaggaaagaatgtcatccgacatcaggacaaaaaatcggatcaaacaacaggtatctcgttgggaagagctttagccaatagtggaagaattaacgagcgccgtatctttcaattaattcgggctgacagaacagccgatatggtccagttacgtcgattacttactcacgccgaacccgtacttgactggccattaatggccagTCAAGTACGGGTTCGGCGTGa < 1:698645‑M2/21‑1 (MQ=255) gTCTTTTGCCGCCGAAAATAGCGTTTTTCTGCATTTTCATATCGTCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGGGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGagta < 2:68900/239‑1 (MQ=255) ttccgcccAAAATTGGGTCTTTGTGCATGTTCATATCGGCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTGCGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACTAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAAt < 2:690486/237‑1 (MQ=255) tGCCGCCGAAAATAGCGTCTTTCTGCATGTTCATATCGTCGCGGTTCAGAAATGAAGGGATGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAAt < 1:1083685/239‑1 (MQ=255) cgccgAAAATTGCGTCTTTCTGCATGTTCATATCGTCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGa < 1:42538/239‑1 (MQ=255) cgccgAAAATAGCGTCTTTCTGCATGTTCATATCGTCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATTCAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGa < 1:539812/239‑1 (MQ=255) gccgAAAATAGCGTCTTTCTGCATGTTCATATCGTCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGAc < 1:385046/239‑1 (MQ=255) cgAAAATAGCGTCTTTCTGCATGTTCATATCGGCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGa < 1:478933/236‑1 (MQ=255) aaaaTGGCGTTTTTCTGCATTGTCATATCGGCGGGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTaa < 2:1023236/239‑1 (MQ=255) aaaTAGCGTCTTTCGGCATGTTAATATCTTCGCGGTTCAGACATGAAGTGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTaa < 2:166000/238‑1 (MQ=255) tagttttttttTGTATTTTCATTTCGTCTCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGATAGATCAGAACCTGAATATTGATAAATGTAGACATGGAAAGGTTTCCTTACGCATTTGTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTgg < 2:360669/232‑1 (MQ=255) tagctgttttCTTCATGTTCATATCGTCGGGGTTAAGGACTGAAGGGCTGTGAGAAACCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTgg < 2:938275/232‑1 (MQ=255) tAGCGTCTTTCTGCATGTTCATATCGTCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTgg < 1:152743/239‑1 (MQ=255) gCGTCTTTTTGCAGTTTCATATCGTCTGCGTTTAGACATGAAGGGCTGTTAGACATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCCCCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGAc < 2:103920/239‑1 (MQ=255) ttttCTGCATGTTCATATCGTCGCGGTTCAGGCATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCat < 1:169729/237‑1 (MQ=255) gaTGTTTATATCGCCGCGGTTACAACATGAAGGGCTTTGAAAGATAAGAACATGAATATTGAAAAAGGTAGACAAAGAAAGGTTTCCGTACGCATTTTTGTATGTTGTCAATCCAAAAGCTACCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGATTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTg < 2:606052/238‑1 (MQ=255) gTTCATATCGTCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGt > 1:380449/1‑237 (MQ=255) gTTCATATCGTCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACGGGACCAAATCGGCTGt > 1:833606/1‑237 (MQ=255) taatttcgtcgGGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAAAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTg < 2:380449/234‑1 (MQ=255) cATATCGTCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTCCGGCGGGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCCTATCGGCTGttttt > 1:483420/1‑235 (MQ=255) ggTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGaat < 1:933036/238‑1 (MQ=255) tCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAATTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGGCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGaattaa < 1:864646/238‑1 (MQ=255) aCATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGaa < 1:178864/239‑1 (MQ=255) cATGAAGGGCTGAGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGa < 1:320193/237‑1 (MQ=255) aaTGAAGGGGTGTGAGAGAGCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGGCATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGGCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGaa < 2:27431/237‑1 (MQ=255) aaGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGGGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGGTTTGTCAACCCGCATTAATTGaaaaaa > 1:449424/1‑235 (MQ=255) aaGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCTCCGTACCTGGCCCATATCGGCTGTTCTGGTAGCCCGAATTAATTGaaaaaa > 1:929845/1‑235 (MQ=255) aaGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAACGAt > 1:717527/1‑238 (MQ=255) aaGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGGAATCGCCGTAACTGGACCAATTCGGCTGTTCTGTCAGGCCGAATTAATTGaaaagaa > 1:502373/1‑235 (MQ=255) aaGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGGAATCGAAGTAACTGGACAAAATCGGGTGGTCTGTCAGCCCAaataaaagtaaaaaaa > 2:806497/1‑229 (MQ=255) aaggtgAGAAATCAGAACAATAATTTTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTGTGTTTGTGGTCAATACAAAATCGTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGgc < 1:1051295/236‑1 (MQ=255) cTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTAAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCCAATCGGCTGTTTTTTCAGCCCGAAATAAATTaaaaaaaaggg > 2:733951/1‑230 (MQ=255) tttgAGAGATCAGAAAATGAATAGTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTAAATACAAAAACTTCCAGAATTTGCTGGCGTTCGCGCTTCCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGgcg < 2:741591/236‑1 (MQ=255) tgggaaagaTCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGgcg < 1:226765/232‑1 (MQ=255) tCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGGTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAAtt > 1:751328/1‑239 (MQ=255) aCATTAATTTTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTGCGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAAttcttc < 2:171547/238‑1 (MQ=255) taaTTTTGTTAAAATTAAACTTTGAAAGGTTTTCTTTCTCATTTTTGTTTGTGGGCAATACAAAATCTTCCAGAATTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACAGCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTa < 2:797388/238‑1 (MQ=255) aGTAAGCCATAAAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTTTTTGGTGGCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGGTGGCGTTCGCGCTTTCCCCTCCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTa < 1:17789/227‑1 (MQ=255) ttAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGgcg < 1:204443/206‑1 (MQ=255) aCATAGAAAGGTTTCCTGTCGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAG‑CTCTTccc < 1:8826/239‑1 (MQ=255) cATAGAAGGTTTTCCTTTCCACTTTTTGTTGGTGCTCAATACCAAAGCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAAGGGCCAGTCAAGTGCGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAGTCGACGTAACTGGACCAAATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCGCGATTGGCTAAAG‑CGCTTccc < 2:232120/238‑1 (MQ=255) atatAAAGGTTTCTTTCCGCATTTTTTTTTGTGGTAAAGACAAAATCTTCCAGAAGTTGCGGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTGCGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAG‑CTCTTCCCaa < 2:816789/239‑1 (MQ=255) aaaGAAAGGTTTCCTTACGGTTTTTTGTTTGGGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAG‑CTCTTCCCaa < 2:449424/237‑1 (MQ=255) aTAGAAAGGTTTCCTTCCGCCTTTTTGTTTTTGGTCAAAACAAAAACTTCCAGAAGTTGCTGGGCTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACTTCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAG‑CTCTTCCCaa < 2:717527/239‑1 (MQ=255) cgccgtatctttcaattaattcgggctgacagaacagccgatatggtccagttacgtcgattacttactcacgccgaacccgtacttgaCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTaa > 1:81484‑M1/90‑145 (MQ=255) cgccgtatctttcaattaattcgggctgacagaacagccgatatggtccagttacgtcgattacttactcacgccgaacccgtacttgaCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTaa < 2:81484‑M1/56‑1 (MQ=255) ccTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCCAGTCCGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAAACGGCCAATATCGGCTGTTCTGGCAGGCCGCATTAATTTAAAAGAACTGCAGTCGGTAATTCTTCCACTATATGCTAAAGTCTTTTCCCAACgagaccagtt > 2:125192/1‑233 (MQ=255) ccTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTTAAAAGTACAGGGCTCTGTAAATCTTTCCCTTTTTGCTAAAA‑ATCTTCCCAAACAGAAAccctt > 2:400453/1‑236 (MQ=255) ccTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGGTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGTTACGGCGTCCGTTAATTCTTCCCATATTTGCCAAAG‑CCCTTTCCAACAAGATACCtgt > 1:158281/1‑239 (MQ=255) ttgtGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAAATTATCCACTATTGGCTAAAA‑CTCTTCCCAACGGGTAACCTTGTGTTTGCTCCGCtttt > 1:842162/1‑239 (MQ=255) ttgtGGGCAATAAAAAATCTGCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAG‑CTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGCTCCGAtttt < 1:806497/239‑1 (MQ=255) tgtgGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGGAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTTTTCCAATTTTTGCTAAAG‑CCCTTCCCCACGAGATACCTGTTGTTTGCTCCGAttttt > 1:344534/1‑239 (MQ=255) tCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAAttcttc < 1:206029/166‑1 (MQ=255) tCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAG‑CTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGCTCCGATTTTTTTTCCTGATTTCGGATGAc > 1:13343/1‑239 (MQ=255) gccAGAAATGTCTGGCGTTGGCGCTTTCCCCCCCAGGTCAACATCCGGGCCATTCATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGCCGTAACTGGACCAGATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAG‑CTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGCTCCGATTTTTTGTCCTGATGTCGGATGAc < 1:901769/238‑1 (MQ=255) ttacgtcgattacttactcacgccgaacccgtacttgactggccattaatggccagTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGgcg < 2:81484‑M2/89‑1 (MQ=255) ttacgtcgattacttactcacgccgaacccgtacttgactggccattaatggccagTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGgcg > 1:81484‑M2/57‑145 (MQ=255) tttcggtcGTTCGCGCTTTCCCCTCCAGTTCCACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTCCGGGTTCGGCGGGAGTAAGTAAGCGACGTAACTTGACCATATCGGCGGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAG‑CTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGCTCCGATTTTTTGTCCTGATGTCGGATGACATTCTTTc < 2:102632/232‑1 (MQ=255) gCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAG‑CTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGCt < 2:126209/201‑1 (MQ=255) gCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAG‑CTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGCt > 1:126209/1‑201 (MQ=255) cGTTCCCGTTTTCCCCCCCAGTTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAG‑CTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGCTCCGATTTTTTGTCCTGATGTCGGATGACATTCTTTCCTgcg‑c < 2:156835/238‑1 (MQ=255) gTTCGCGCTTTCCCCCCCCGGTAATCATCCTGGCCCTTAATGGCCAGTCGAGTACGGGTTAGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACCGGCCCATATCGGCTGTTCTGGCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAG‑CTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGCTCCGATTTTTTGTCCTGATGTCGGATGACATTCTTTCCTGCG‑Ct < 2:929845/238‑1 (MQ=255) ttCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAG‑CTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGCTCCGATTTTTTGTCCTGATGTCGGATGACATTCTTTCCTGCG‑CT‑c < 1:400453/238‑1 (MQ=255) tcacgccgaacccgtacttgaCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAG‑CTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGATCCGATTTTTTGTCCTGATGTCGGATGACATTCTTTCCTGCG‑CT‑CAGgcaca < 1:698645‑M1/217‑3 (MQ=255) cccaGGTCAACACCGTGGCCATTAAAGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGGCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAG‑CTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGCTCCGATTTTTTGTCCTGATGTCGGATGACATTCTTTCCTGCG‑CT‑CAGGCAAAACACCATg < 1:153752/238‑1 (MQ=255) gTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAACATACGGTCGTCGTTAATTTTTCCACTATTTGCTAAAA‑CCCTTCCCAACGAGATACCTGTTTTTTGCCCCCCTTTTTTTTCCTTATGTCGGACAAACTTCTTTCCT‑TG‑CTCCAGGCAAAAAACAATCCGCac > 2:648119/1‑238 (MQ=255) gTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCAGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGGTACTGCGCTCGTTAATTCTTCCCATATTGGATAAAG‑CTCTTCCCACAGAGATACCTCTTGGTTGTCCCGCTTTTTTTTCCTTGTGTCGGCTGGAATTCTTTATTGTG‑TC‑CAGGGAAAAAACCCTTCGCaa > 2:120130/1‑239 (MQ=255) cAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTTTTCCACTATTGGCTAAAG‑CTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGGTTGCTCCGATTTTTTGTCCCTATGTCGGATGACATTCTTTCCTGCGCCC‑CGGGCAAAAC‑CCCTGGGCaaaa > 1:1048644/1‑239 (MQ=255) GGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGaattaa < 1:429112‑M1/90‑1 (MQ=255) GGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGaattaa > 2:429112‑M1/1‑90 (MQ=255) attaatggccagTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAA‑CCATTCCCAACGAGATACCAGTTGTTTGCTCCGATTTTTTGTCCTGATGTTGGATGACATTCTTTCCTGCC‑CC‑CCGGCACAACACCATGCGCAAaaaagcctgattgcg > 1:20814‑M2/13‑233 (MQ=255) AGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTaa < 1:443589‑M1/40‑1 (MQ=255) AGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTaa > 2:443589‑M1/1‑40 (MQ=255) gTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCCGCCCGAATTAATTTAAAGATACGGCGCTTGTTAATTCTTCCCCTTTTGGCTAAAA‑CTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGCTCCGATTTTTTGTCCTGATGTCGGATGACATTCTTTCCTCCG‑CT‑CAGTCAAAACACCATCCGCAAAAGAGCCTGCTGGGGACGTGGGttt > 1:1001631‑M2/2‑238 (MQ=255) tCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTTAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAA‑CTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGCTCCGATTTTTTGTCCTGATGTCGGGAGACATTCTTTTCTGCG‑CT‑CCGGCAAAACACCCAGCGCAAAAACGCCCGCTTGTGAGGGGGGgttt > 2:808008/1‑238 (MQ=255) tCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTTGCTAAAG‑CTCTTCCCAACGAGATACCCGTTGGTTGCTCCGATTTTTTGTCCTGATTTCGGATGACATTCTTTCCTCCG‑CT‑CAGGCAAAAAACCCTGCGCCAAAGAGCCTGCTGGTGCCGTGGGtttt > 1:1024139/1‑238 (MQ=255) | TTTGACTTGAAATTCTTACTCGTCTTTTGCCGCCGAAAATAGCGTCTTTCTGCATGTTCATATCGTCGCGGTTCAGACATGAAGGGCTGTGAGAGATCAGAACATGAATATTGATAAAGTTAGACATAGAAAGGTTTCCTTACGCATTTTTGTTTGTGGTCAATACAAAATCTTCCAGAAGTTGCTGGCGTTCGCGCTTTCCCCACCAGGTCAACATCCTGGCCATTAATGGCCAGTCAAGTACGGGTTCGGCGTGAGTAAGTAATCGACGTAACTGGACCATATCGGCTGTTCTGTCAGCCCGAATTAATTGAAAGATACGGCGCTCGTTAATTCTTCCACTATTGGCTAAAG‑CTCTTCCCAACGAGATACCTGTTGTTTGCTCCGATTTTTTGTCCTGATGTCGGATGACATTCTTTCCTGCG‑CT‑CAGGCAAAACACCATGCGCAAAAGAGCCTGCTGGTGACGTGGGTTTT > NC_000913/2882016‑2882489 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |