Missing coverage evidence... | ||||||||||
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TAGATTTGGCAGACAAAGCAATATTATGGGCACTAATATCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTA > NC_000913/3769340‑3769739 | tAGATTTGGCAAAAAAAGCAATATTATGGGCACTAATATCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGaaa < 1:271154/238‑1 (MQ=255) atatTTTGGGCCTTAATATCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTTTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGaa < 2:1044476/239‑1 (MQ=255) tCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATCGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTTTTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATTCACCCCa > 1:535383/1‑239 (MQ=255) aaGGGGGACGAAAAGCGTTTTCCCTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGAt < 2:877507/239‑1 (MQ=255) cGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGGCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTg < 1:173810/238‑1 (MQ=255) gAAAAGGCTGTTCCTTAATCTTTTTTGCCTGTAATGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACCCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGa < 2:535383/238‑1 (MQ=255) gtcccTAAGGTTTTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGtaaata < 2:604656/235‑1 (MQ=255) tttGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGaaa > 1:391920/1‑155 (MQ=255) tttGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGaaa < 2:391920/155‑1 (MQ=255) atGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGaaa < 2:937552/113‑1 (MQ=255) atGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGaaa > 1:937552/1‑113 (MQ=255) gAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGaaa > 2:597767/1‑92 (MQ=255) gAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGaaa < 1:597767/92‑1 (MQ=255) tATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGaaa > 1:628471/1‑76 (MQ=255) tATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGaaa < 2:628471/76‑1 (MQ=255) gTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGaaa < 2:273632/60‑1 (MQ=255) gTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGaaa > 1:273632/1‑60 (MQ=255) gCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGCTGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTa > 2:1023265/1‑184 (MQ=255) gCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACGCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTa < 1:1023265/184‑1 (MQ=255) | TAGATTTGGCAGACAAAGCAATATTATGGGCACTAATATCAGCCAGTACTAAAGAGGGACGAAAAGCGTGTTCACTAAGCTATTTTGCCTGTAAGGCCGCAGAGGCTGAACTCGGACTGGCATATATGGCTGCGAATGATAACAAGGAATTTCTCACATCCTTATCTAATATAATGAGGTACAAAATAGATGCTGGACTTTCCGAATCCTATACATGCTATTTATTAAGTAAGGGAAAGATCATAAGACCATATCTGAAAAATCTAAATCCACTCCAACTTGCCGCTGATTGCATTGAAACAGTAAATAAAATAAAAGATAAGAATAAAAAAAATCATTGATATAAATTCAGTTAATATTTGTAGTGATGATAAAAATATAAAATTGAGAGTTAATAGTA > NC_000913/3769340‑3769739 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |