Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 357,381 | 0 | T | G | 10.9% | 395.4 / 3.1 | 150 | V404G (GTG→GGG) | codA | cytosine/isoguanine deaminase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/89); new base G (23/3); total (58/92) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.23e-08 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |