Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 759,427 | 0 | A | G | 12.5% | 274.5 / 2.0 | 112 | E241G (GAG→GGG) | sucA | 2‑oxoglutarate decarboxylase, thiamine triphosphate‑binding |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (51/43); new base G (4/12); total (56/56) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.58e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
ACCTACTGCGGCCCGATTGGTGCCGAGTATATGCACATTACCAGCACCGAAGAAAAACGCTGGATCCAACAGCGTATCGAGTCTGGTCGCGCGACTTTCAATAGCGAAGAGAAAAAACG‑CTTCTTAAGCGAA‑CTGA‑CCGCCGCTGAAGGTCTTGAACGTTACCTCGGCGCAAAATTCCCTGGCGCAAAACGCTTCTCG‑CTGGAAGGCGGTGACGCGTTAATCCCGATGCTTAAAGAGATGATCCG‑CCACGCTGGCAACAGCGGCACCCGCGAAGTGGTTCTCGGGATGGCGCACCGTGGTCGTCTGAACGTGCTGGTGAACGTGCTGGGTAAAAAACCGCAAGACTTGTTCGACGAGTTCGCCGGTAAACATAAAGAACACCTCGGCACGGGTGACGTGAAATACCACATGGGCTTCTCGTCTGACTTCCAGACCGATGGCGGCCTGGTGCACCTGGCGCTGGCGTTTAAC > NC_000913/759192‑759662 | aCCTACTGCGGCCCGATTGGTGCCGAGTATATGCACATTACCAGCACCGAAGAAAAACGCTGGATCCAACAGCGTATCGAGTCTGGTCGCGCGACTTTCAATAGCGAAGAGAAAAAACG‑CTTCTTAAGCGAA‑CTGA‑CCGCCGCTGAAGGTCTTGAACGTTACCTCGGCGCAAACTTCCCTGGCGCAAAACGCTTCTCG‑CTGGAAGGCGGGGACGCGTTAATCCCGATGCTTAACGAgat > 1:1000056/1‑239 (MQ=255) 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NC_000913/759192‑759662 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |