Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 976,672 | 0 | T | G | 17.3% | 186.6 / 2.9 | 86 | V116G (GTG→GGG) | mukB | chromosome condensin MukBEF, ATPase and DNA‑binding subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/36); new base G (13/5); total (45/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.48e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GGGGCGGGTAAATCCACCACCATGGCGGCGTTCGTTACGGCGCTGATCCCCGACCTGACCCTGCTGCATTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTCA‑ACTCCATTACTGATTACCACTCGCTGATGTTCGATCTGGGCATCATCGCGCGTCGTCTGCGCTCCGCATCTGACC > NC_000913/976434‑976905 | ggggCTGGTAAACCCCCCACCATGGCGGCTTTCGTTACGGCGCCGATCCCCGACCGGACCCTGCTGCATTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGt < 2:492645/239‑1 (MQ=255) tCCCCCCCCTTGGCGGCGTGCGTTGCGGGGCTGATCCCCGCCCTTACCCTGCGGCATTTCCTTAACACTACGGCAGCCGGGGCCGCCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCAGGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGCAACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTAGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGcc < 2:632341/239‑1 (MQ=255) cccaccaTGGCGGCCTTCGTTTCGGCGCTGATCCCCGCCCTGACCCTGCTGCATTTCCGTAACCCTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGtt < 2:829648/238‑1 (MQ=255) cccccaTGGCGGCGTTCGTTCCGGCGCTGATCCCCGACCGGACCCTGCTGCATTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGttt < 1:2064/236‑1 (MQ=255) 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GGGGCGGGTAAATCCACCACCATGGCGGCGTTCGTTACGGCGCTGATCCCCGACCTGACCCTGCTGCATTTCCGTAACACTACGGAAGCCGGGGCCACCAGCGGTTCGCGCGATAAAGGTCTGCACGGTAAGCTGAAAGCGGGTGTCTGTTATTCGATGCTCGACACCATTAACTCGCGCCACCAGCGCGTGGTGGTCGGTGTGCGT‑CTGCAACAGGTTGCCGGACGCGATCGTAAAGTGGATATCAAGCCGTTTGCCATTCAGGGACTGCCGATGTCGGTGCAGCCGACACAGCTGGTGACCGAAACCCTGAACGAACGCCAGGCGCGCGTGCTGCCGCTTAACGAGCTGAAAGACAAGCTCGAGGCGATGGAAGGCGTGCAGTTTAAACAGTTCA‑ACTCCATTACTGATTACCACTCGCTGATGTTCGATCTGGGCATCATCGCGCGTCGTCTGCGCTCCGCATCTGACC > NC_000913/976434‑976905 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |