Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 2,747,959 | A→C | 13.5% | intergenic (‑164/‑3) | ffh ← / → ypjD | Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)/cytochrome c assembly protein family inner membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | NC_000913 | 2,747,959 | 0 | A | C | 13.5% | 292.6 / 4.4 | 114 | intergenic (‑164/‑3) | ffh/ypjD | Signal Recognition Particle (SRP) component with 4.5S RNA (ffs)/cytochrome c assembly protein family inner membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (66/29); new base C (6/12); total (72/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.28e-03 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
TTCAGTGAGGCGTCCACGGCCACTGATATTGCGCAGCGTGCGCGACAAACGATCGGTTAAATTATCAAACATTGTCTCTCGCCTGGGGTGGAAACGGTTGGCCGCAATCGCGACACATCATCAGTATTTTGCCGCAGTATAACATGAAGGCGTCTTTGTTGTTATGCAACGGTTGGAGCAGCGTTCACCTGACGCTATACTGCTTCTCTTTCTTATTGCTCAAACTGTCGACATCACTATGCCCGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGC‑TGATTGTTCCCGGTCTGCTGCAAAAAAACGGCGGCTGGCGGCGCATGGCTATTATTTCTGCGGTCATTGCGCTGGTCTGCCACGCAATCGCTCTGGAAGCCCGCATCCTGCCCGACGGTGATAGCGGACAAAACCTCAGCCTGCTGAACGTTGGTTCATTGGTCAGTTTGATGATCTGTA > NC_000913/2747724‑2748193 | ttCAGTGAGGCGTCCACGGCCACTGATATTGCGCAGCGTGCGCGACAAACGATCGGTTAAATTATCAAACATTGTCTCTCGCCTGGGGTGGAAACGGTTGGCCGCAATCGCGACACATCATCAGTATTTTGCCGCAGTATAACATGAAGGCGTCTTTGTTGTTATGCAACGGTTGGAGCAGCGTTCACCTGACGCTATAATGCTTCTCTTTCTTTTTGCTCAAACTGTCGACATCCCtt > 1:1020614/1‑238 (MQ=255) 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cGGTTAATTTTCCAAACTTTGTCTCTCGCCGGGGGGTGAAACGGTTGGCCGGAATCGCGACACATCATCAGTATGTTGCCGCAGTATAACATGAAGGCGTCTTTGTTGTTATGCAACGGTTGGAGCAGCGTTCACCTGACGCTATACTGCTTCTCTTTCTTATTGCTCAAACTGTCGACATCACTATGCCCGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGC‑Tg < 2:1008460/239‑1 (MQ=255) ggTTATATTACAAAACATTGTCTCTCGCCTGGGGTGGAAACGGTTGGCCGAAATCGAGAAGCATCATCAGTATTTTGCCGCAGTAAAACATGAAGGCGTCTTTGTTGTTATGCAACGGTTGGAGCAGCGTTCACCTGACGCTATACTGCTTCTCTTTCTTATTGCTCAAACTGTCGACATCACTATGCCCGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTGTCGCCTACTCCGTCAGTCTTGCGC‑TGa < 1:535117/239‑1 (MQ=255) gTTAAATTATCAAACATTGTCTCTCGCCTGGGGTGGAAACGGTTGGCCGCAATCGCGACACATCATCAGTATTTTGCCGCAGTATAACATGAAGGCGTCTTTGTTGTTATGCAACGGTTGGAGCAGCGTTCACCTGACGCTATACTGCTTCTCTTTCTTATTGCTCAAACTGTCGACATCACTATGCCCGTTTTTGCTCTGCTCGCGCTTTTCGCCTACTCCGTCAGTCTTTCTC‑TGAt > 1:530951/1‑239 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |