| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,722,169 | A→G | 6.1% | T17A (ACG→GCG) | ydhK → | putative efflux protein (PET) component of YdhJK efflux pump |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,722,169 | 0 | A | G | 6.1% | 214.7 / 3.4 | 65 | T17A (ACG→GCG) | ydhK | putative efflux protein (PET) component of YdhJK efflux pump |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/26); new base G (2/2); total (37/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.97e-01 | |||||||||||
CTATAGTGATAACAAAACGTTACAGGGTCACGTTTCCAGTATCGGTCGGGCGATTTATGATCAGAGCGTTGAAAGTGACTCAAGCCTTATTCCGGATGTTAAACCTAACGTCCCCTGGGTTCGACTCGCCCAACGCGTTCCCGTCCGCTTTGCGCTGGATAAAGTCCCAGGCGATGTCACGTTGGTGTCGGGCACCACCTGTAGCATTGCCGTAGGTCAATAATGAACGCATCGTCATGGTCCTTGCGCAATTTGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGTTACGCAATACCATTGCCATGTGTCTGGCGCTGACGGTTGCCTATTATTTAAATCTGGATGAACCCTATTGGGCGATGACCTCGGCTGCAGTGGTTAGCTTTCCCACCGTTGGCGGTGTTATCAGCAAAAGCCTCGGACGCATCGCTGGCAGTTTGCTCGGAGCCATTGCGGCACTGCTTCTTGCCGGGCATACGCTCAATGAGCCGTGGTTTTTTCTATTGAGCATGTCGGCGTGGCTTGGCTTTTGTACCTGGGCCTGTGCG > NC_000913/1721899‑1722456 | ctATAGTGATAACAAAACGTTACAGGGTCACGTTTCCAGTATCGGTCGGGCGATTTATGATCAGAGCGTTGAAAGTGACTCAAGCCTTATTCCGGATGTTAAACCTAACGTCCCCTGGGTTCGACTCGCCCAACGCGTTCCCGTCCGATTTGCGCTGGATAAAGTCCCAGGCGATGTCACGTTGGTGTCGGGCACCACCTGTAGCATTGCCGTAGGTCAATAATTAACGCATCGTCATGGTCCTTGCGCCATTTGCCCTGGTTCAGGGCCAACCTGGCCCAATGGCttt > 2:35298/1‑289 (MQ=255) tataGTGATAACAAAACGTTACAGGGTCACGTTTCCAGTATCGGTCGGGCGATTTATGATCAGAGCGTTGAAAGTGACTCAAGCCTTATTCCGGATGTTAAACCTAACGTCCCCTGGGTTCGACTCGCCCAACGCGTTCCCGTCCGCTTTGCGCTGGATAAAGTCCCAGGCGATGTCACGTTGGTGTCGGGCACCACCTGTAGCATTGCCGTAGGTCAATAATGAACGCATCGTCATGGTCCTTGCGCAATTTGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTa > 2:42809/1‑289 (MQ=255) tGATAACAAAACGTTACAGGGTCACGTTTCCAGTATCGGTCGGGCGATTTATGATCAGAGCGTTGAAAGTGACTCAAGCCTTATTCCGGATGTTAAACCTAACGTCCCCTGGGTTCGACTCGCCCAACGCGTTCCCGTCCGCTTTGCGCTGGATAAAGTCCCAGGCGATGTCACGTTGGTGTCGGGCACCACCTGTAGCATTGCCGTAGGTCAATAATGAACGCATCGTCATGGTCCTTGCGCAATTTGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCg < 2:432092/288‑1 (MQ=255) gATAACAAAACGTTACAGGGTCACGTTTCCAGTATCGGTCGGGCGATTTATGATCAGAGCGTTGAAAGTGACTCAAGCCTTATTCCGGATGTTAAACCTAACGTCCCCTGGGTTCGACTCGCCCAACGCGTTCCCGTCCGCTTTGCGCTGGATAAAGTCCCAGGCGATGTCACGTTGGTGTCGGGCACCACCTGTAGCATTGCCGTAGGTCAATAATGAACGCATCGTCATTGTCCTTGCGCCATTTGCCCTGGTTCAGGGCCACCCTGGCGCAATGGCGTTCTGCGtt > 2:401727/1‑289 (MQ=255) aTAACAAAACGTTACAGGGTCACGTTTCCAGTATCGGTCGGGCGATTTATGATCAGAGCGTTGAAAGTGACTCAAGCCTTATTCCGGATGTTAAACCTAACGTCCCCTGGGTTCGACTCGCCCAACGCGTTCCCGTCCGCTTTGCGCTGGATAAAGTCCCAGGCGATGTCACGTTGGTGTCGGGCACCACCTGTAGCATTGCCGTAGGTCAATAATGAACGCATCGTCATGGTCCTTGCGCAATTTGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGtt > 2:142604/1‑288 (MQ=255) aaCAAAACGTTACAGGGTCACGTTTCCAGTATCGGTCGGGCGATTTATGATCAGAGCGTTGAAAGTGACTCAAGCCTTATTCCGGATGTTAAACCTAACGTCCCCTGGGTTCGACTCGCCCAACGCGTTCCCGTCCGCTTTGCGCTGGATAAAGTCCCAGGCGATGTCACGTTGGTGTCGGGCACCACCTGTAGCATTGCCGTAGGTCAATAATGAACGCATCGTCATGGTCCTTGCGCAATTTGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGTTAc > 2:180722/1‑288 (MQ=255) aCAAAACGTTACAGGGTCACGTTTCCAGTATCGGTCGGGCGATTTATGATCAGAGCGTTGAAAGTGACTCAAGCCTTATTCCGGATGTTAAACCTAACGTCCCCTGGGTTCGACTCGCCCAACGCGTTCCCGTCCGCTTTGCGCTGGATAAAGTCCCAGGCGATGTCACGTTGGTGTCGGGCACCACCTGTAGCATTGCCGTAGGTCAATAATGAACGCATCGTCATGGTCCTTGCGCAATTTGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGTTACg > 2:43050/1‑288 (MQ=255) 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tCAGAGCGTTGAAAGTGACTCAAGCCTTATTCCGGATGTTAAACCTAACGTCCCCTGGGTTCGACTCGCCCAACGCGTTCCCGTCCGCTTTGCGCTGGATAAAGTCCCAGGCGATGTCACGTTGGTGTCGGGCACCACCTGTAGCATTGCCGTAGGTCAATAATGAACGCATCGTCATGGTCCTTGCGCAATTTGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGTTACGCAATACCATTGCCATGTGTCTGGCGCTGACGGTTGCCTATTATTTAAATc < 1:35298/289‑1 (MQ=255) gagCGTTGAAAGTGACTCAAGCCTTATTCCGGATGTTAAACCTAACGTCCCCTGGGTTCGACTCGCCCAACGCGTTCCCGTCCGCTTTGCGCTGGATAAAGTCCCAGGCGATGTCACGTTGGTGTCGGGCACCACCTGTAGCATTGCCGTAGGTCAATAATGAACGCATCGTCATGGTCCTTGCGCAATTTGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGTTACGCAATACCATTGCCATGTGTCTGGCGCTGACGGTTGCCTATTATTTAAATCTgg > 1:231420/1‑289 (MQ=255) gagCGTTGAAAGTGACTCAAGCCTTATTCCGGATGTTAAACCTAACGTCCCCTGGGTTCGACTCGCCCAACGCGTTCCCGTCCGCTTTGCGCTGGATAAAGTCCCAGGCGATGTCACGTTGGTGTCGGGCACCACCTGTAGCATTGCCGTAGGTCAATAATGAACGCATCGTCATGGTCCTTGCGCAATTTGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGTTACGCAATACCATTGCCATGTGTCTGGCGCTGACGGTTGCCTATTATTTAAATCTgg > 1:157370/1‑289 (MQ=255) 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tATTCCGGATGTTAAACCTAACGTCCCCTGGGTTCGACTCGCCCAACGCGTTCCCGTCCGCTTTGCGCTGGATAAAGTCCCAGGCGATGTCACGTTGGTGTCGGGCACCACCTGTAGCATTGCCGTAGGTCAATAATGAACGCATCGTCATGGTCCTTGCGCAATTTGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGTTACGCAATACCATTGCCATGTGTCTGGCGCTGACGGTTGCCTATTATTTAAATCTGGATGAACCCTATTGGGCGATGAcc > 2:344548/1‑288 (MQ=255) tCCGGATGTTAAACCTAACGTCCCCGGGGTTCGACTCGCCCAACGCGTTCCCGTCCGCTTTGCGCTGGATAAAGTCCCAGGCGATGTCACGTTGGTGTCGGGCACCACCTGTAGCATTGCCGTAGGTCAATAATGAACGCATCGTCATGGTCCTTGCGCAATTTGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGTTACGCAATACCATTGCCATGTGTCTGGCGCTGACGGTTGCCTATTATTTAAATCTGGATGAACCCTATTGGGCGATGACCTCgg < 1:180722/289‑1 (MQ=255) gTTAAACCTAACGTCCCCTGGGTTCGACTCGCCCAACGCGTTCCCGTCCGCTTTGCGCTGGATAAAGTCCCAGGCGATGTCACGTTGGTGTCGGGCACCACCTGTAGCATTGCCGTAGGTCAATAATGAACGCATCGTCATGGTCCTTGCGCAATTTGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCg < 2:76601/197‑1 (MQ=255) 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ccTGTAGCATTGCCGTAGGTCAATAATGAACGCATCGTCATGGTCCTTGCGCAATTTGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGTTACGCAATACCATTGCCATGTGTCTGGCGCTGACGGTTGCCTATTATTTAAATCTGGATGAACCCTATTGGGCGATGACCTCGGCTGCAGTGGTTAGCTTTCCCACCGTTGGCGGTGTTATCAGCAAAAGCCTCGGACGCATCGCTGGCAGTTTGCTCGGAGCCATTGCGGCACTGCTTCTTCCCGGGCAt > 2:491628/1‑289 (MQ=255) aTTGCCGTAGGTCAATAATGAACGCATCGTCATGGTCCTTGCGCAATTTGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGTTACGCAATACCATTGCCATGTGTCTGGCGCTGACGGTTGCCTATTATTTAAATCTGGATGAACCCTATTGGTCGATGACCTCGGCTGCAGTGGTTAGCTTTCCCACCGTTGGCGGTGTTATCAGCAAAAGCCTCGGACGCATCGCTGGCAGTTTGCTCGGAGCCATTGCGGCACTGCTTCTTGCCGGGCATACGCTCaa > 1:76589/1‑289 (MQ=255) tGCCGTAGGTCAATAATGAACGCATCGTCATGGTCCTTGCGCAATTTGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGTTACGCAATACCATTGCCATGTGTCTGGCGCTGACGGTTGCCTATTATTTAAATCTGGATGAACCCTATTGGGCGATGACCTCGGCTGCAGTGGTTAGCTTTCCCACCGTTGGCGGTGTTATCAGCAAAAGCCTCGGACGCATCGCTGGCAGTTTGCTCGGAGCCATTGCGGCACTGCTTCTTGCCGGGCATACg < 1:159468/282‑1 (MQ=255) tGCCGTAGGTCAATAATGAACGCATCGTCATGGTCCTTGCGCAATTTGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGTTACGCAATACCATTGCCATGTGTCTGGCGCTGACGGTTGCCTATTATTTAAATCTGGATGAACCCTATTGGGCGATGACCTCGGCTGCAGTGGTTAGCTTTCCCACCGTTGGCGGTGTTATCAGCAAAAGCCTCGGACGCATCGCTGGCAGTTTGCTCGGAGCCATTGCGGCACTGCTTCTTGCCGGGCATACg > 2:159468/1‑282 (MQ=255) ggTCAATAATGAACGCATCGTCATGGTCCTTGCGCAATTTGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGTTACGCAATACCATTGCCATGTGTCTGGCGCTGACGGTTGCCTATTATTTAAATCTGGATGAACCCTATTGGGCGATGACCTCGGCTGCAGTGGTTAGCTTTCCCACCGTTGGCGGTGTTATCAGCAAAAGCCTCGGACGCATCGCTGGCAGTTTGCTCGGAGCCATTGCGGCACTGCTTCTTGCCGGGCATACGCTCAATGAGCCGTg > 1:276284/1‑289 (MQ=255) tCATGGTCCTTGCGCAATTTGCCCTGGTTAAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGTTACGCAATACCATTGCCATGTGTCTGGCGCGGACGGTTGCCTATTATTTAAATCTGGATGAACCCTATTGGGCGATGACCTCGGCTGCAGGGGTTAGCTTTCCCACCGTTGGCGGTGTTATCAGCAAAAGCCTCGGACGCATCGCTGGCAGTTTGCTCGGAGCCATTGCGGCACTGCTTCTTGCCGGGCATACGCTCAATGAGCCGTGGTTTTTTCTATTGAGCATg < 1:370284/288‑1 (MQ=255) gTCCTTGCGCAATTTGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGTTACGCAATACCATTGCCATGTGTCTGGCGCTGACGGTTGCCTATTATTTAAATCTGGATGAACCCTATTGGGCGATGACCTCGGCTGCAGTGGTTAGCTTTCCCACCGTTGGCGGTGTTATCAGCAAAAGCCTCGGACGCATCGCTGGCAGTTTGCTCGGAGCCATTGCGGCACTGCTTCTTGCCGGGCATACGCTCAATGAGCCGTGGTTTTTTCTATTGAGCATGTCGGc < 1:43050/288‑1 (MQ=255) cTTGCGCAATTTGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGTTACGCAATACCATTGCCATGTGTCTGGCGCTGACGGTTGCCTATTATTTAAATCTGGATGAACCCTATTGGGCGATGACCTCGGCTGCAGTGGTTAGCTTTCCCACCGTTGGCGGTGTTATCAGCAAAAGCCTCGGACGCATCGCTGGCAGTTTGCTCGGAGCCATTGCGGCACTGCTTCTTGCCGAGCATACGCTCAATGAGCCGTGGTTTTTTCTATTGAGCATGTCGGCGtg > 1:43156/1‑288 (MQ=255) tGCGCAATTTGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGTTACGCAATACCATTGCCATGTGTCTGGCGCTGACGGTTGCCTATTATTTAAATCTGGATGAACCCTATTGGGCGATGACCTCGGCTGCAGTGGTTAGCTTTCCCACCGTTGGCGGTGTTATCAGCAAAAGCCTCGGACGCATCGCTGGCAGTTTGCTCGGAGCCATTGCGGCACTGCTTCTTGCCGGGCa < 2:32599/241‑1 (MQ=255) tGCGCAATTTGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGTTACGCAATACCATTGCCATGTGTCTGGCGCTGACGGTTGCCTATTATTTAAATCTGGATGAACCCTATTGGGCGATGACCTCGGCTGCAGTGGTTAGCTTTCCCACCGTTGGCGGTGTTATCAGCAAAAGCCTCGGACGCATCGCTGGCAGTTTGCTCGGAGCCATTGCGGCACTGCTTCTTGCCGGGCa > 1:32599/1‑241 (MQ=255) tGCGCAATTTGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGTTACGCAATACCATTGCCATGTGTCTGGCGCTGACGGTTGCCTATTATTTAAATCTGGATGAACCCTATTGGGCGATGACCTCGGCTGCAGTGGTTAGCTTTCCCACCGTTGGCGGTGTTATCAGCAAAAGCCTCGGACGCATCGCTGGCAGTTTGCTCGGAGCCATTGCGGCACTGCTTCTTGCCGGGCATACGCTCAATGAGCCg < 1:90314/257‑1 (MQ=255) tGCGCAATTTGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGTTACGCAATACCATTGCCATGTGTCTGGCGCTGACGGTTGCCTATTATTTAAATCTGGATGAACCCTATTGGGCGATGACCTCGGCTGCAGTGGTTAGCTTTCCCACCGTTGGCGGTGTTATCAGCAAAAGCCTCGGACGCATCGCTGGCAGTTTGCTCGGAGCCATTGCGGCACTGCTTCTTGCCGGGCATACGCTCAATGAGCCg > 2:90314/1‑257 (MQ=255) gcgcAATTTGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGTTACGCAATACCATTGCCATGTGTCTGGCGCTGACGGTTGCCTATTATTTAAATCTGGATGAACCCTATTGGGCGATGACCTCGGCTGCAGTGGTTCGCTTTCCCACCGTTGGCGGTGTTATCAGCAAAAGCCTCGGACGCATCGCTGGCAGTTTGCTCGGAGCCATTGCGGCACTGCTTCTTTCCGGGCATACGCTCAATGAGCCGTGGTTTTTTCTATTGATCATTTCGCCGtggc > 2:370284/1‑287 (MQ=255) tttGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGTTACGCAATACCATTGCCATGTGTCTGGCGCTGACGGTTGCCTATTATTTAAATCTGGATGAACCCTATTGGGCGATGACCTCGGCTGCAGTGGTTAGCTTTCCCACCGTTGGCGGTGTTATCAGCAAAAGCCTCGGACGCATCGCTGGCAGTTTGCTCGGAGCCATTGCGGCCCTGCTTCTTGCCGGGCATACGCTCAATGAGCCGTGGTTTTTTTTATTGAGCTTTTCGGTGTGGCCTGGtttt > 2:186497/1‑289 (MQ=255) tttGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGTTACGCAATACCATTGCCATGTGTCTGGCGCTGACGGTTGCCTATTATTTAAATCTGGATGAACCCTATTGGGCGATGACCTCGGCTGCAGTGGTTAGCTTTCCCACCGTTGGCGGTGTTATCAGCAAAAGCCTCGGACGCATCGCTGGCAGTTTGCTCGGAGCCATTGCGGCACTGCTTCTTGCCGGGCATACGCTCAATGAGCCGTGGTTTTTTCTATTGAGCATGTCGGCGTGGCTTGGCttt > 1:113933/1‑289 (MQ=255) ttGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGTTACGCAATACCATTGCCATGTGTCTGGCGCTGACGGTTGCCTATTATTTAAATCTGGATGAACCCTATTGGGCGATGACCTCGGCTGCAGTGGTTAGCTTTCCCACCGTTGGCGGTGTTATCAGCAAAAGCCTCGGACGCATCGCTGGCAGTTTGCTCGGAGCCATTGCGGCACTGCTTCTTGCCGGGCATACGCTCAATGAGCCGTGGTTTTTTCTATTGAGCATGTCGGCGTGGCTTGGCtttt < 2:157370/289‑1 (MQ=255) ccTGGTTCAGGGCCACGCGGGCGAAATGGCGTTATGCGTTACGCAATACCATTGCCATGTGTCTGGCGCTGACGGTTGCCTATTATTTAAATCTGGATGAACCCTATTGGGCGATGACCTCGGCTGCAGTGGTTAGCTTTCCCACCGTTGGCGGTGTTATCAGCAAAAGCCTCGGACGCATCGCTGGCAGTTTGCTCGGAGCCATTGCGGCACTGCTTCTTGCCGGGCATACGCTCAATGAGCCGTGGTTTTTTCTATTGAGCATGTCGGCGTGGCTTGGCTTTTGTAc < 2:128758/289‑1 (MQ=255) tCAGGGCCAAACGGGGGAAATGGCGTATTGCGTTACGCAATCCCATTGCCAGGTGTCTGGCGCTGACGGTTGCCTATTATTTAAATCTGGATGAACCCTATTGGGCGATGACCTCGGCTGCAGTGGTTAGCTTTCCCACCGTTGGCGGTGTTATCAGCAAAAGCCTCGGACGCATCGCTGGCAGTTTGCTCGGAGCCATTGCGGCACTGCTTCTTGCCGGGCATACGCTCAATGAGCCGTGGTTTTTTCTATTGAGCATGTCGGCGTGGCTTGGCTTTTGTACCTGGGc < 2:269364/289‑1 (MQ=255) aCGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGTTACGCAATACCATTGCCATGTGTCTGGCGCTGACGGTTGCCTATTATTTAAATCTGGATGAACCCTATTGGGCGATGACCTCGGCTGCAGTGGTTAGCTTTCCCACCGTTGGCGGTGTTATCAGCAAAAGCCTCGGACGCATCGCTGGCAGTTTGCTCGGAGCCATTGCGGCACTGCTTCTTGCCGGGCATACGCTCAATGAGCCGTGGTTTTTTCTATTGAGCATGTCGGCGTGGCTTGGCTTTTGTACCTGGGCCTGTgcg > 2:356513/1‑288 (MQ=255) | CTATAGTGATAACAAAACGTTACAGGGTCACGTTTCCAGTATCGGTCGGGCGATTTATGATCAGAGCGTTGAAAGTGACTCAAGCCTTATTCCGGATGTTAAACCTAACGTCCCCTGGGTTCGACTCGCCCAACGCGTTCCCGTCCGCTTTGCGCTGGATAAAGTCCCAGGCGATGTCACGTTGGTGTCGGGCACCACCTGTAGCATTGCCGTAGGTCAATAATGAACGCATCGTCATGGTCCTTGCGCAATTTGCCCTGGTTCAGGGCCACGCTGGCGCAATGGCGTTATGCGTTACGCAATACCATTGCCATGTGTCTGGCGCTGACGGTTGCCTATTATTTAAATCTGGATGAACCCTATTGGGCGATGACCTCGGCTGCAGTGGTTAGCTTTCCCACCGTTGGCGGTGTTATCAGCAAAAGCCTCGGACGCATCGCTGGCAGTTTGCTCGGAGCCATTGCGGCACTGCTTCTTGCCGGGCATACGCTCAATGAGCCGTGGTTTTTTCTATTGAGCATGTCGGCGTGGCTTGGCTTTTGTACCTGGGCCTGTGCG > NC_000913/1721899‑1722456 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |