| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 850992 | 108 (1.100) | 4 (0.040) | 4/408 | NT | 3.6% | intergenic (+27/+22) | ompX/opgE | outer membrane protein X/OPG biosynthetic transmembrane phosphoethanolamine transferase |
| ? | NC_000913 | = 850998 | 111 (1.190) | intergenic (+33/+16) | ompX/opgE | outer membrane protein X/OPG biosynthetic transmembrane phosphoethanolamine transferase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
TAGTGGGTGTGGGTTATGGTAAATTCCAGACCACTGAATACCCGACCTACAAACACGACACCAGCGACTACGGTTTCTCCTACGGTGCGGGTCTGCAGTTCAACCCGATGGAAAACGTTGCTCTGGACTTCTCTTACGAGCAGAGCCGTATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCGGCCCGGCTTTCTTCTCAGATATAAACGGGTATTTGATGTTAATTTCCTTCGCTTTAATCCCCGTCCACTGGGAGAAAAAGCCTAAGAAGTCATTGGCTGAGCGGCGGGCTTTAATCACACGATGCGCTTTATCGTCGCTG > NC_000913/850763‑851233 | tAGTGGGTGTGGGTTATGGTAAATTCCAGACCACTGAATACCCGACCTACAAACACGACACCAGCGACTACGGTTTCTCCTACGGTGCGGGTCTGCAGTTCAACCCGATGGAAAACGTTGCTCTGGACTTCTCTTACGAGCAGAGCCGTATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGggc < 1:848449‑M2/239‑4 (MQ=255)tAGTGGGTGTGGGTTATGGTAAATTCCAGACCACTGAATACACGACCTACAAACACGACCCCAGCGACTACGGTTTCTCCAACGGTGAGGGTCTGCAGTTCAACCCGATGGAACACGTAGCCCTGGACTTCTCTTCCGAGCAGAGCCGTATTCGTAGCGTTGACGCAGTCACCTTTATTGCAGGCGTTGGTTACCGCTACTAATCATGTTGGAGATATAAAAAATCAGCCTCTTGGggc < 2:751688‑M2/239‑4 (MQ=255) tgggtgtgggtTATGGTAAATTCCAGACCACTGAATACCCGACCTACAAACACGACACCAGCGACTACGGTTTCTCCTACGGTGCGGGTCTGCAGTTCAACCCGATGGAAAACGTTGCTCTGGACTTCTCTTACGAGCAGAGCCGTATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGggcgga < 1:996952‑M2/239‑7 (MQ=255) ggtgtggttTAAGGGAAATTCCAGACCACTGAATACCCGACCTACAAAAACTACACCAGCGACTACGGTTTCTCCTACGGTGCGGGCCTGCAGTTCAACCCGCTGGAAAACGTTGCTCTGGACTTCTCTTACGCACAGAGCTGGATTCGGAACGTTTGCGTACGCACCTAGATGGCCGGTGATGGTTCCTGCTTCTAATCCCTCTGGAGATTTAAGAAGTCTGCCTCTCggctcggctt > 2:1049430/1‑231 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |