| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 2,608,231 | A→G | 14.7% | M439V (ATG→GTG) | hyfF → | hydrogenase 4, membrane subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,608,231 | 0 | A | G | 14.7% | 231.5 / 7.9 | 115 | M439V (ATG→GTG) | hyfF | hydrogenase 4, membrane subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (55/40); new base G (16/3); total (72/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.81e-02 | |||||||||||
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Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
AATGTACTGCTCAAGTACGGCACGCGCGATCTCAACGTCGTCTGTGGGATGCTCAAAATCATGCC‑ATTTACCGCCGTGCTGTTTGGCGGCGGTGCGCTGGCGCTGGCAGGGATGCCG‑CCCTTCAACATTTTTCTTAGCG‑AATTTATGACCATT‑ACCGCCGGACTGG‑CACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGC‑TG‑TTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGTACGGA‑TGGCTGCGCGGGT‑GTTAATGGCGAAACCGCCG‑CAGG‑CCGTTAACCGGGGTGATCTCGGCTGGTTGACCACCTCGCCAATGGTGATTCTGCTGGTCATGATGCTGGCGATGGGAACGCATA‑TTCCACAACCTGTCATCAGG‑ATCCTGGCGGGC‑GCTTCCACTATAGTCCTCTCAG‑GGACGCACGATCTGCCTGCACAACGTAGCACCTGGCATGATTTTTTGCCTTCAGGCACCGCA > NC_000913/2607994‑2608467 | aatctccTGCTCAAGTCCGTCCCGCGTGATCTCACCTTCGTTTGGAGGATGCTCAAAATCAGGCC‑TTTTTCCGCCGTGCTGTTTGGCGGCGGTGCGCTGGCGCTGGCAGGGATGCCG‑CCCTTCAACATTTTTCTTAGCG‑AATTTATGCCCATT‑ACCGCCGGACTGG‑CACGTAATCACCTGCTGATTATCGTCCTGCTGTTATTGC‑TG‑TTAACGCTGGTGCTGGCGGGCCTGGTACGGA‑t < 2:949621/233‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |