Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,206,469 | A→G | 9.3% | S3G (AGC→GGC) ‡ | ttdA → | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,206,469 | 0 | A | G | 9.3% | 243.1 / 2.1 | 107 | S3G (AGC→GGC) ‡ | ttdA | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/60); new base G (6/4); total (43/64) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.68e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
CTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGT > NC_000913/3206235‑3206704 | cTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCg < 1:81087/238‑1 (MQ=255) tAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGa < 2:1153003/238‑1 (MQ=255) tAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGa < 2:206757/238‑1 (MQ=255) cAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGtaat < 2:363801/238‑1 (MQ=255) aGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAGACAAAAACAAAAA‑ATTGG‑GTTGTCATTGTGTGGGGAAGgaataa > 1:522800/1‑239 (MQ=255) ttCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AAc < 2:864547/239‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAgg < 1:75802/236‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAgg < 2:1186004/236‑1 (MQ=255) cGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTg < 2:118861/239‑1 (MQ=255) cGTTAATTATCCGCAGTTGGGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGAGAATTTTTTCAGGCAAAAACAAAAA‑CTTGA‑GGTGGCATTGTGTGGGAAAGGAATAAGC‑AAAAggacggg > 1:975497/1‑234 (MQ=255) ttAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAA‑ATGTA‑GTTTGCCTGGTGAGGGGAAGTAATAAAC‑AACAGGGAGGGaa > 1:459149/1‑239 (MQ=255) ttAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAAAACAATACAAAAA‑CATGA‑GTTGCCCTGATGAGCGGAAAGAACAAGC‑cacaagaaaggaa > 1:194187/1‑230 (MQ=255) tAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGaa < 1:986923/238‑1 (MQ=255) aaTTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CGGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATa < 1:390139/239‑1 (MQ=255) tgtgATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAgaga < 2:297507/238‑1 (MQ=255) tgATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGGGAATTTTTTCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAATAATAAAC‑AAAAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATTg > 1:487376/1‑239 (MQ=255) cgcAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCTTACAAAAACAAAAA‑ACGGG‑GTTGGCATGGTAGGCGAAAAGAATAAAG‑AAAAAGAAGTGCATAAAT‑TGACAAAGAGTGTTGCT‑aa > 1:985118/1‑239 (MQ=255) cgcAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCCCATAAATACAAAAA‑ATGGA‑GTTGGCATGATGTGGGGAAGATATAAAC‑AACAAGCCGGGGATAAAT‑TTATACAGATTTTTGCT‑aa > 1:43561/1‑239 (MQ=255) tATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAAACAAAAACAAAAA‑AAAGA‑GGTGTCATGATGAGAGGAAAGAATAAAC‑AAAAGGAAAGGGATAAAA‑TGACAGAGAATGGTGCT‑acaatttt > 1:433037/1‑231 (MQ=255) tATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGa < 1:1149144/184‑1 (MQ=255) tCGAAAAACATTGCCATTCCCGGCTCTGGCGAAATTTTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACAAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATAAAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGGGGGGGTAAATTTTTCCAGAAAAATAAAAAAA‑CGGGA‑GTTGCCATGATGAGCAAAATTAAAAAGC‑AACAGGCAGTAAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCa < 2:277728/239‑1 (MQ=255) aaaaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAA‑CATGA‑GTTGGCATGATGAGCGGAAGAAAAAAAA‑AAAAAGCAAGGAAAAAAA‑TGACAGAGAATGTTGCT‑AAATTTACCCCCATGAt > 1:987055/1‑239 (MQ=255) aaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAAATTTTTCAGAAAAAAAAAAAAA‑ATAGA‑GTTTGCATGATGAGGGAGAGAAATAAAA‑CAAACGCAGAGAAAAAGTATAACA‑AGATTGTCACC‑AACTTTATCGCCCTAAttt > 2:1130141/1‑239 (MQ=255) aaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑‑AGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTTCAACAAATACAAAAA‑ATGGA‑GGTGTCAAGATGAGGGGAAGTAATAAGA‑AACAAGCAGTGAATAAAT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGAtt > 1:1217691/1‑237 (MQ=255) cATCGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATCCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCAGGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGGGGCGGTAAATTTTTCCAGACAAATAAAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AATTTTACCGCCATGATTTCt < 1:970075/239‑1 (MQ=255) tGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTTAATTTTTTCTGACAAATAAAAAAA‑ATTGA‑GTTGCCCCGTTGAGCGAAAGGAATAAGA‑AACAGGCACTGAATAAAA‑TGACAAAGATTTTCGCT‑ACCTTTACCCCCATGCTTTCTTCCCGGATTccct > 1:73837/1‑237 (MQ=255) tGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTTAGACAAAAAAAAAAA‑ATGGAGGTTGCCTTG‑TGGGGGGAAGGAAAAAAA‑AAAAGGCAATGAATAAGT‑TGATAAAGAGTTTCGCT‑TAATTTACCGCCATGATTTTTACACGacaggctc > 2:624652/1‑232 (MQ=255) tGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAg < 1:590123/187‑1 (MQ=255) ctttGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTAATTCACGACCTGTTAATTACATATTCACGGTGACAAAAAATAAAAAACCAC‑ATTTTAAGTGG‑‑AGTTTGTGGCGGTAAATTTTTCCAAAAAAATAAAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGAGAAAGTAATAACC‑AACAGGCAGTAAATAAGT‑TGACAGAGATGGCCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCtgatg < 2:1217691/236‑1 (MQ=255) ctctGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAGAAAAAAACAAAAA‑ATGGA‑GTTGCCATGATGAGGGGAAGAAATAAAA‑AAAAAGCAAGGAAAAAAA‑AGAGAGAGAATGGCGCG‑AAAATTACAGCGATGAATTTTACCCGaaagacagag > 2:1183843/1‑231 (MQ=255) tctGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCAAAAGAAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAATT‑TGACAGAGATTGTCGTT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCtgatg < 1:826841/239‑1 (MQ=255) tGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGGAAATTTCCCGTAAAATACAAAAA‑ATTGT‑GGTGGTCAGATGAGGAAAAGAAATAAAC‑AAAAGGCAGTGAATTAGA‑TGACAGAAAATGTCCCT‑AACTTTTTCGCCCTGCTTTCTTACCGTATACCttattaa > 1:800471/1‑236 (MQ=255) gcgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGTAATTTTTCAGACAAATAAAAAAA‑CTGGA‑GTGGCCATGATGAGGGGAAGTAATAAGA‑AACAGGAAGAGCATAAAA‑TGATAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCCAGAATTCTACCCTAATGCCtgatggagt > 1:408108/1‑235 (MQ=255) gcgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAGAAAAAAAAAAAAA‑ATGGA‑GTTGCCATGGTGGGCGGAAATAATAAAA‑AAAAAGCAGTTAATAAGT‑TGGCAGAGAATGTTGCT‑AAATTTTACCCCATAATTTTTAACCCAAATCCtggtggagg > 1:431741/1‑235 (MQ=255) gcgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAAAAAAAAAAAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCCATATGGGCGGAAGGAATAAAA‑AACAAGAAAGGAAAAAAG‑TTAAAAAAATTGTTGGTAAACTTTCCGCCCAGGATTTTTACCCGATTGccgatagagg > 1:581942/1‑231 (MQ=255) gcgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAAATTTTTCAGACAAATACAAAAA‑ATGGG‑GGTGTCATGATGAGCTGAAAAAATAAAC‑AAAAAGCAGAGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGGT‑AACTTTACACCCCTGATTTTTACCCCAATGCCTGATGACgg > 1:713440/1‑238 (MQ=255) gcgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGAGGATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAA‑ATGGA‑GTTGGCATGTTGAGCGAAAGTAATAAAC‑AACCAGCAGGGAATAAAT‑TGACAGAGAATGTCGCT‑AAATTTAACGCCCTGATTTCTAACCGAATGCCtgattgagt > 1:102849/1‑234 (MQ=255) cgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTTTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATAAAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGGGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTAc < 1:572396/205‑1 (MQ=255) cacAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATACACGAACTTTTAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGGGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CGGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACgt < 2:863678/236‑1 (MQ=255) cacAAAATTCATTCTTATTTTGGCGTTAATTCACGAACTGTTAATTACATAGTCAGGGGGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑AAGTTGGGGGGGGTGAATTTTTCCACAAAAATACAAAAT‑CTGGT‑GTTCAGAAAGAGACGGAAAAAAACAAGC‑AACAGGTGGAGAATAAGA‑AGAAAAAGATTGTGGCA‑ATATTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACgt < 2:796575/236‑1 (MQ=255) caaaaTATCCATGCTTATTTCGACTTTGATGCAGCAATTGTAAATGACATTTTCACAGTGAAAAAAAAAATAAAACCAC‑ATTGAGAGTGG‑TAGTTGTGGGCGGTAAATTTTTCAAAACAAAAAAAAAAA‑AAGGA‑TTTGCGATGATGATAAAAAGAAATAAGA‑AACAGGCGGTAAATAATT‑GGACAGGGTTTGTCCCA‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACgt < 2:680323/235‑1 (MQ=255) gcAATATTCATTCTTATTTTCGCTTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTAAATTTTTCCAGAAAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCAAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTAAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACgtg < 1:292805/238‑1 (MQ=255) aaaaTATTAATTCTTATTTTGGCGTTGATTCACGATTTGTTAATTACAGATCCAGGGTGGAAAAAAATAAAAAACAAC‑ATTTTGAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTCCCAGACAAATACAAAAA‑CAGGA‑GTTGCTATGAGGAGCGAAATAAATAAGC‑ACCGGGAAGAGAATAAGT‑TGACAGATATTGTCGTT‑AACTTTCCCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACgtg < 1:904719/236‑1 (MQ=255) tatttattTTTTTTTTCGCATTAATTCACTAAATTTTAATAACATATACAGGGTGGAAAAAAATAAAAATCCAG‑ATTATAGATGG‑GTTTTGGGGGGAGTGATTTTTTGCAGAGAAATAAAAATA‑GGGGG‑GTTGCGTAGAGGAGTAAAAGTAATAAGA‑AACGGGGTGTAGATAGGT‑AGAAAAGAATTGTCGGT‑AGCTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 2:880155/239‑1 (MQ=255) tatTCATTTTTAGTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTAAATTACATATTCGCGGGGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGT‑TGGTTTGGGGCGGTAAATTTTCCCAGACAAAAACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATAATGGGGGAAAATAATAAGA‑AACGGGCAGTAAATAAGT‑TGACAGAGTTTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 1:1115247/239‑1 (MQ=255) aattcattcTTATTTTCGCGTGGATTCATGAACTGTTAAGTACAGATTCACGGGGGCAAAAAATATAAACCCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTAAATTTTTCCAGACAAAGACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCTTGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑ACCAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGTT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 1:911028/238‑1 (MQ=255) attcattcTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAgg < 1:872637/162‑1 (MQ=255) ttcattcTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAGACAAATACAAAAA‑ATGGA‑GTTTCCATGATTGACGAAAGTAATAAAG‑AACAGGCAATGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCCCT‑AACTTTACCCCCCTGATTTTTTTCCGCAAGCATTCTGACGGGGTGGATa > 1:769192/1‑239 (MQ=255) ttATTTTCGCGTTGATTCACGAACTTTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGAAAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaa < 1:939662/239‑1 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAA‑ATGGA‑GTTGTTATTATTAGCGGAAATAAAAAAC‑AAAAAGGAGTGAAAAAAT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AAAATTACACACATCATTTTTAAACGAATGCCTGATGACATGTGGGGTAAAACaaaa > 2:461981/1‑239 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCCAACAAAAACAAAAA‑ATTGA‑GGTGTCCTTGTGAGGGGAAAGAATAAAA‑CACAAGCAGTGGATAAAT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AAATTTACCGCCACGATTTCTTCCCCAATGCCTGATGGCGTGGGGGATTAACTaaaa > 2:680575/1‑239 (MQ=255) ttttCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAAATTTTTTCGACAAAAACAAAAA‑ATGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGGAATAAAC‑AAAAGGCAATGAATAAAT‑TGACAGAGAATGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTTTTCCCGAAAGCCTGATGACGAGGTGGGtaaaataaaaaa > 1:1095181/1‑237 (MQ=255) ttttCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAAATTTTTCAGACAAATAAAAAAA‑ATGGA‑GGTGCCCTGATGAGCGGGAGTAATAAGC‑AACACGCAGTGAATAAAG‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTTTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaaaa > 1:866702/1‑237 (MQ=255) gcgTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAAATTTTTCAGACAAAAACAAAAA‑ATGGA‑GTTGTCATGATGAGCGAAAGTAATAAAC‑AAAAGGCAGAGAATAAGA‑TGACAGAGAGTGTTGCT‑AAATTTAACGCCATGATTTTTACCCCAATGCCTGATGACGTGGGGGGTAAACTAAAAAAGCTaa > 1:307624/1‑239 (MQ=255) gTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAAACAAAAACAAAAA‑ATGGA‑GTTTGCATGATGAGGGGAAGTAATAAAC‑AAAAGGCAGGGAAAAAGA‑TGACAGAGATTGTCGGC‑AAATTTTCCGCCCTGAATTTTACCCCAAAACCTTGTGTCGTGGGGGGTAAACTTAAACAACTAAAg > 2:939662/1‑239 (MQ=255) cGAACTTTAAATAACATATTCGCGGTGGAAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TATTTTGTGGCGGTAAATTTTTCCAGAAAAATAAAAAAA‑CGGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGaa < 2:307624/239‑1 (MQ=255) ttttATTTAAATATGCACGTTAGCAAAAAATATAAACCCAC‑A‑TTTTGGTGGTTAGTTTGTGGGGGTAATTTTTTCCAGAAAAATACAAAAC‑CTGGT‑GTTGCCATGATGAGCAAAAGTAAAAAGC‑AAGAGACAGTAAATAAGT‑TGACAGGAATTGTCGCT‑ATCTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAAcgtc < 2:54715/237‑1 (MQ=255) ttAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGGGAAATTTTTCAAACAAATAAAAAAA‑CTGGA‑GTTTGCCTGGTGGGCGACAGTAATAAGC‑AACAGGCAATGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCC‑CACTTTAACACCACTAATTTTACCCGAACACCTGATTTCGTGGTGGGTAAACTAAAAAAGCCCACAGAT‑GCCGAAAcgccc > 2:113577/1‑235 (MQ=255) ttAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAAAAAAAAACAAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTGGTGGGGGGGAATTTTTCAAAAAAAATAAAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTAAATAAGT‑TAACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCtgatg < 2:511277/194‑1 (MQ=255) aaTTACATATTCAGGGTGACAAAAAATAAAAAACCAA‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGGGGTGAATTTTTCCAGAAAAATACAAAAA‑CGGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAAAAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGtcgtcg < 2:522800/239‑1 (MQ=255) aaTTACATATGCACGGTGGCAAAAAATAAAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TATTTTGGGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTGGCCATGATGAGCAAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGtcgtcg < 1:1006830/239‑1 (MQ=255) caaattagcGGTGGAAAAAAATATAAAACCAA‑ATTTTTAGTGG‑TTGTTTGTGGGGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATAATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTAAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAGAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATggg < 2:599583/231‑1 (MQ=255) aatatTCACGGGGGAAAAAAATATAAAACAAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGAAAAAAAAAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATggg < 2:480813/238‑1 (MQ=255) atatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGGGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCAAAAGTAATAAGC‑AACGGGCAGTGAATAGTT‑TGACAGAAATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 1:799563/196‑1 (MQ=255) tatTCAGGGTGGAAAAAAATATAAAACACA‑ATTTTTAGGGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATAAAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCAAAAGTAAAAAGC‑AACAGGCATTGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGAT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:425040/239‑1 (MQ=255) tatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTAATGGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:1130141/239‑1 (MQ=255) tatTCACGGGGGAAAAAAATAAAAACCCAC‑ATTTTTAGTGG‑TATTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGAAAAAAACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCAAAAGTAATAAGC‑AACAGGAAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:532241/239‑1 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCCGACAAAAACAAAAA‑CTGGG‑GTTTCCCTGATGAGCGAAAGTAATAAAC‑AACAGGAAGAGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTAACGCCCTGATTTTTACCCCAATGCCTGATGACGGGGGGGATAAACTAAAAAAAATAAAGGATGGCCGAAA‑ATCGTCGGTggggga > 1:262041/1‑237 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAA‑ATGGG‑GGTGCCATGGTGAGCGAAAGGAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAAT‑TGACAGAGATTTTCGCT‑TACTTTTCCCCCCTGATTTCTTACCCAAAGCCTGATGACGTGGGGGGTAAACTAAAACAACTAAAAGAA‑TCCCGAACAGCGTCGGTggggga > 1:232164/1‑237 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAAACAAAAACAAAAA‑ATGGA‑GTTGGCCTGATGTGGGAAATGAATAAAA‑AACAAGCAGTGAAAAAGA‑TGACAGAGAGTTTCGCT‑AACTTTTACGCCCTGATTTCTACCCGAATTCCTGATGACGGGGGGGGTTAAATAAAACAGATAAAAGAA‑GCCGCAACGTCCTCGCTgggggc > 2:1006830/1‑237 (MQ=255) caggTGGAAAAAAATAAAAAACCAA‑ATTGTTATTGT‑TGGTTGGTGGCGGTAAATTTTTCAAAAAAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTCCAATGATGAGCGAAAGAAAAAAGC‑AACAGGCGGTGAATAAGT‑GGAAAGAGATTTCCGTT‑AATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAAtt < 2:1095181/237‑1 (MQ=255) ggTGACAAAAAAAATAAACCCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTGTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGAAAAATAAAAAAA‑CGGGA‑GTGGCCATTAGAGGCAAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTAATTAAGT‑TAAAAGAGATTGTCGTT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 1:506847/239‑1 (MQ=255) tgggCAAAAAATATAAACCCAC‑ATTTTTAGGGG‑TAGTTTGTGGCGGAGAATTTTTCAAGAAAAATAAAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTAAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 2:190656/236‑1 (MQ=255) gtgaaaaaaaaTAAAAAACCAA‑ATTTGTAGTGG‑TAGGTTGTGGCGGTGAATTTTACCAAAAAAAAACAAAAA‑GTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGAAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑GGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 2:194187/233‑1 (MQ=255) tGGCAAAAATAATAAAACCAC‑ATTTTTATTGT‑TAGTTTGTGGCGGTAAATTTTTCCAGACAAATAAAAAAA‑CGGGA‑GTTGCCTTGATGAGCAAAATAAATAAGC‑AACAGGCAGTAAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATc < 1:1036074/238‑1 (MQ=255) tGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAAATTTTTTAGACAAAAACAAAAA‑CTGGA‑GGTGCCATGATGAGGGAAAATAATAAAA‑AAAAAGCAGGGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTTGCT‑AACTTTTCCGCCATGATTTTTTACCCACTGGCTGATGACGTGGTGGGTAAACTAAAACAACTAAAGGAA‑GCCGAAAAGGCGCCGGTGGGGAAAAatatat > 2:857484/1‑237 (MQ=255) gCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAGACAAATAAAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGGAAGGAATAAAC‑AACAAGCAGGGAAAAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTAACGCCAAGATTTTTAACCGAATGCCTGATGACGTGGGGGGTAAAATAAAAAAGCTAAAGGAT‑GCCGAAAACTCGGCGATGGGGGAAAATATCTa > 1:608616/1‑238 (MQ=255) aaaaaaaaaaACCAC‑ATGTTTAGTGG‑TAGGTTGGGGCGGGAAATTTTCCAAGAAAAATACAAAAA‑CGGGA‑GTGGCCATGATGAGCAAAAGAAATAAAC‑ACCAGGCAGTAAATAAGT‑GAACAGAGGTTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATa < 2:314969/239‑1 (MQ=255) aaaaaaTAAAGCGAC‑ATTTTTAGTGG‑TATTTTGTGGCGGTTAATTTTTCAAAAAAAAAACAAAAA‑CGGGA‑GTTGCCATGATGACGGAAAGAAAAAAGC‑AACAGGCAGTGAATAATT‑TCACATAGATTGCCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATa < 2:1199158/239‑1 (MQ=255) aaaaaaTAAAACCAC‑ATTTGTAGGGG‑TAGTTTGTGGCGTTAAATTTTTCCAGAAAAATACAAAAA‑CGGGA‑GTTGCCATGATGACGAAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGTTTGTCGCT‑AATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATa < 1:555187/239‑1 (MQ=255) aaaaTAAAAAACCAC‑ATTTTTAGGGG‑TAGTTTGTGGCGGTAAATTTTCCCAGAAAAAAACAAAAA‑CGGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGTTTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATa < 1:680575/239‑1 (MQ=255) aaTATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTAAATTTTTCCAGAAAAATAAAAAAA‑CTGGA‑GTGGCCATGATGAGCAAAAGTAATAAGC‑AACAGGCGGTAAATAAGT‑TGAAAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 1:1183843/239‑1 (MQ=255) aaaaaaaaACACAATTTTTAGTGG‑TATTTTGTGGGGTTAAATTTTTCAAAAAAAATAAAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGAGGAGCAAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑GGACAGAGATGGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 2:262041/235‑1 (MQ=255) taAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCAGACAAATACAAAAA‑AAGGG‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAAC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCCTGATTTCTTCCCGAATGCCTGATGAc > 1:478258/1‑166 (MQ=255) aCCAC‑ATTTGTAGTGG‑TATTTTGTGGGGGTG‑ATTTTTCCAAGAAAAAACAAAAACCAGGA‑GTTGCCATGTTGAGAGAAAGTAATAAGA‑ACCAGGCGGTAAATAAGT‑TGCCAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGa < 2:148612/239‑1 (MQ=255) ccgaaTTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTAAATTTTTCAAGACAAATACAACAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCAAAAGTAATAGGC‑ACAAGGCAGTGAATAATG‑TGACAGAAATGTCCGTT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGac < 1:1177898/235‑1 (MQ=255) cac‑aTTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAgg < 2:725546/92‑1 (MQ=255) ac‑aTTTTAAGTGG‑TAGTTTGGGGCGGAAAAGTTGTCAAGAAAAATAAAAAAA‑CGGGA‑GGTGCAATGATGAGC‑AAAGAAAAAAACAAAGAGGTAGAAAAGAAGG‑TGACCAGGATAGTCGCT‑AACTTAACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGGCGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCAGACGATGTTCGacaa < 2:73837/239‑1 (MQ=255) g‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTTCCGACAAATACAAAAA‑ATGGA‑GTTTCCCTGATTAGCGGAAGTAATAAAC‑AACAAGCAGTGAATAAGT‑TGGCAGAGATTTTCGCT‑AACTTTACCGCCCTGATTTTTTCCCCAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAAAAACTAAAGGAT‑GCCGCAACGTCGTCGATGGGGGAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCcaaaaac > 1:76032/1‑237 (MQ=255) tgGGGGTAAATTTATCAAGAAAAAAAAAAAAA‑CGGGG‑GATGCAATGATGAGAAAAAGTAATAAGC‑AAAAGGCAGTGAATAAGT‑TAGAGGGGATTGCCGTA‑AACTTGACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGAc < 2:339576/238‑1 (MQ=255) acaaGACAAATAAAAAAA‑CTGGT‑GTTGCCATTATGAGCAAAAGTAATAAGC‑ACCAGGCGGTGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctgcc < 1:1231645/236‑1 (MQ=255) gACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctgcatggc > 2:939611/1‑237 (MQ=255) aaaa‑CTGGA‑GGTGCAAGGAGGGGAAAAAGAAATAAGC‑AACAGGTAGATAATAAGT‑GGCAGGAGTTTTTGGTT‑AATTTTCCCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgg < 2:800471/239‑1 (MQ=255) aaa‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCggg > 2:528162/1‑239 (MQ=255) aa‑CGGGA‑GTTGCCATGAGGAGCGAAAGTAATAAAC‑AACAGGCAGTGAAGAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgggg < 2:43561/239‑1 (MQ=255) ggA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGAt > 2:1225605/1‑239 (MQ=255) gA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGCTGTTCGACAACATGCAAAAAGGGATTGACCTGCATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGAtt > 2:1206132/1‑239 (MQ=255) gA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGAtt > 1:967787/1‑239 (MQ=255) ccATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGt > 2:1042344/1‑237 (MQ=255) atgaGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACATGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGCT‑GCCGAAACGTCGTCGATGCGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACCACATTCAAAAAGCGATTGACTTACACCGTCCACCCTGTAAGGACACCGGGCAGTTAATGTTCTTCGt > 2:926692/1‑239 (MQ=255) | CTAAAGGCCAGCTATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCAC‑ATTTTTAGTGG‑TAGTTTGTGGCGGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGGA‑GTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGC‑AACAGGCAGTGAATAAGT‑TGACAGAGATTGTCGCT‑AACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGAT‑GCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGT > NC_000913/3206235‑3206704 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |