| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 4,394,322 | T→G | 12.8% | V86G (GTC→GGC) | nnr → | bifunctional NAD(P)H‑hydrate repair enzyme; C‑terminal domain ADP‑dependent (S)‑NAD(P)H‑hydrate dehydratase and N‑terminal domain NAD(P)H‑hydrate epimerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,394,322 | 0 | T | G | 12.8% | 267.4 / 2.2 | 105 | V86G (GTC→GGC) | nnr | bifunctional NAD(P)H‑hydrate repair enzyme; C‑terminal domain ADP‑dependent (S)‑NAD(P)H‑hydrate dehydratase and N‑terminal domain NAD(P)H‑hydrate epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (38/48); new base G (16/2); total (55/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.41e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
AAGAAAAACCCCGTAAGTATACCACACACCGTCTGGTACGCCGACGATATCCGCCGCGGAGAACGCGAGGCGGCAGATGTGCTGGGGCTCACACTCTATGAGCTGATGCTTCGCGCTGGCGAGGCCGCATTCCAGGTG‑TGTCGTTCGGCGTATCCTGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGTCGGCATTGAGGTCACGTTG‑TTGGCCCAGGAGAGC‑GACAAACCGTTGCCGGAAGAGGCCGCGCTGGCACG‑CGAAGCATGGTTAAACGCGGGTGGCGAGATCCATGCTTCGAATATTGT‑CTGGCCCGAATCGGTAGATCTGATTGTTGATGCGCTGCTCGGTACCGGTTTGCGGCAAGCGCCCCGCGAATCCATTAGCCAGTTAATCGACCACGCTAATTCCCATCCTGCGCCGATTGTG > NC_000913/4394084‑4394560 | aaaaaaacCCCCGAAATAATCCCCCCCGCCGTTTGTTCCGCCGCGGATACCCGCCCGGGAGAACGGGAGGGGGCGGATGGCGGGGGGCTCACTTTCTAGGGGCGGATGCTGCGCGCTGGGGGGGCGGCATTCCGGGTG‑TGTCGTTGGGCGTATCCGGACGCCCGCCACTGGCTGGTGCTGTGCGGTCATGGTAATAACGGCGGC‑GATG‑GCT‑ACGTGGTCGCGCGACTGGCCAAAGCGGt < 2:1100798/236‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |