Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,206,477 | 0 | T | A | 19.3% | 170.3 / 14.9 | 111 | S5R (AGT→AGA) | ttdA | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (25/59); new base A (11/10); total (42/69) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.14e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |