Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 92,250 | T→C | 6.4% | S280P (TCA→CCA) | ftsI → | transpeptidase involved in septal peptidoglycan synthesis; penicillin‑binding protein 3 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 92,250 | 0 | T | C | 6.4% | 206.0 / 4.0 | 62 | S280P (TCA→CCA) | ftsI | transpeptidase involved in septal peptidoglycan synthesis; penicillin‑binding protein 3 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/30); new base C (2/2); total (30/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.06e-01 |
GATAGTCAAGGGATTGAGGGCGTTGAGAAGAGTTTCGATAAATGGCTTACCGGGCAGCCGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCGGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTAATGACCGCGTTGCAACGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAATACCATTCCTTATCGAATTAACGGCCACGAAATCAAAGACGTGGCACGCTACAGCGAATTAACCCTGACCGGGGTATTACAGAAGTCGAGTAACGTCGGTGTTTCCAAGCTGGCGTTAGCGATGCCGTCCTCA > NC_000913/91965‑92534 | gATAGTCAAGGGATTGAGGGCGTTGAGAAGAGTTTCGATAAATGGCTTACCGGGCAGCCGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCAt > 2:451268/1‑289 (MQ=255) 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gTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCGGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTAATGACCGCGTTGCAACGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAATACCATTCCTTATCGAATTAACGGCCACGAAATCAAAGACGTGGCACGCTACAGCGAAt < 2:575272/240‑1 (MQ=255) gAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCGGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTAATGACCGCGTTGCAACGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAATACCATTCCTTATCGAATTAACGGCCACGAAATCAAAGACGTGGCACGCTACAGCGAATTAACCCTGACCGGGGTATTACAGAAGTCGAGTAACGTCGGTGTTTCCAAg < 1:143357/288‑1 (MQ=255) ggCTAACAGCCCGCCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCGGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTAATGACCGCGTTGCAACGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAATACCATTCCTTATCGAATTAACGGCCACGAAATCAAAGACGTGGCACGCTACAGCGAATTAACCCTGACCGGGGTATTACAGAAGTCGAGTAACGTCGGTGTTTCCAAGCTGGCGTTAGCGATg < 1:342959/289‑1 (MQ=255) cccGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCGGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTAATGACCGCGTTGCAACGTGGCGTGGTGCGGGAAACCTCGGTACTCAATACCATTCCTTATCGAATTAACGGCCACGAAATCAAAGACGTGGCACGCTACAGCGAATTAACCCTGACCGGGGTATTACAGAAGTCGAGTAACGTCGGTGTTTCCAAGCTGGCGTTAGCGATGCCGTCCTCa > 2:540523/1‑289 (MQ=255) cGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCGGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTAATGACCGCGTTGCAACGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAATACCATTCCTTATCGAATTAACGGCCACGAAATCAAAGACGTGGCACGCTACAGCGAATTAACCCTGAc < 1:14198/223‑1 (MQ=255) cGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCGGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTAATGACCGCGTTGCAACGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAATACCATTCCTTATCGAATTAACGGCCACGAAATCAAAGACGTGGCACGCTACAGCGAATTAACCCTGAc > 2:14198/1‑223 (MQ=255) | GATAGTCAAGGGATTGAGGGCGTTGAGAAGAGTTTCGATAAATGGCTTACCGGGCAGCCGGGTGAGCGCATTGTGCGTAAAGACCGCTATGGTCGCGTAATTGAAGATATTTCTTCTACTGACAGCCAGGCAGCGCACAACCTGGCGCTGAGTATTGATGAACGCCTGCAGGCGCTGGTTTATCGCGAACTGAACAACGCGGTGGCCTTTAACAAGGCTGAATCTGGTAGCGCCGTGCTGGTGGATGTCAACACCGGTGAAGTGCTGGCGATGGCTAACAGCCCGTCATACAACCCTAACAATCTGAGCGGCACGCCGAAAGAGGCGATGCGTAACCGTACCATCACCGACGTGTTTGAACCGGGCTCAACGGTTAAACCGATGGTGGTAATGACCGCGTTGCAACGTGGCGTGGTGCGGGAAAACTCGGTACTCAATACCATTCCTTATCGAATTAACGGCCACGAAATCAAAGACGTGGCACGCTACAGCGAATTAACCCTGACCGGGGTATTACAGAAGTCGAGTAACGTCGGTGTTTCCAAGCTGGCGTTAGCGATGCCGTCCTCA > NC_000913/91965‑92534 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |