Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,936,308 | C→T | 100% | V3I (GTA→ATA) | zwf ← | glucose‑6‑phosphate 1‑dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,936,308 | 0 | C | T | 100.0% | 279.8 / ‑6.7 | 75 | V3I (GTA→ATA) | zwf | glucose‑6‑phosphate 1‑dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (30/44); total (31/44) | |||||||||||
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
GCAGCAGTGTCATTGACATCGAGATTACAAAAATCCAGACGTGCACTCAGGGTGTCCCATAAACCTTCATCAATGGTTTCTTTCATGAAAGTTTCGAGCGCCTCGCGGACAACTTTGGTATATGCCGCTTTATCCCAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCTTTTACGAGCTTGCGAAAACTGTAAACGCTTATCCACCCGTGCGATTACGGGAAAAGCGCGCAAAGTGCGGCAAAACTGATAAAAAAATCATCGTTTTCCATTGGGTAAAAATCTGACACTGATCATGTTATGAAAAAAAATAACAACTTTTTTATCTGCTTTTGTCATTAACACGGCACACAGGCGTAATATCTG > NC_000913/1936022‑1936587 | gcagcaGTGTCATTGCAATCGAGATTAGTAAAGTACAGACGTGCACTCAGGGGGTCCCATAAACCTTAATCAATGGTTTCTTTCAGGAAAGTTTCGATCGCCTCGCGGACAACTTTGGTATATGCCGCTTTATCCCAGTCAGCCCGCCCTACGCGGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTAGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCg < 2:623137/289‑1 (MQ=255) gcagcaGTGTCATTGACATCGAGATTACAAAAATCCAGACGTGCACTCAGGGTGTCCCATAAACCTTCATCAATGGTTTCTTTCATGAAAGTTTCGAGCGCCTCGCGGACAACTTTGGTATATGCCGCTTTATCCCAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCg < 2:507368/289‑1 (MQ=255) agTGTCATTGACATCGAGATTACAAAAATCCAGACGTGCACTCAGGGTGTCCCATAAACCTTCATCAATGGTTTCTTTCATGAAAGTTTCGAGCGCCTCGCGGACAACTTTGGTATATGCCGCTTTATCCCAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGcc < 1:226841/286‑1 (MQ=255) tCATTGTCATCGGAATTACAAAAATCCAGACGTGCACTCAGGGTGTCCCATAAACCTTCAGCAATGGTTTCTTTCATGAAAGTTTCGAGCGCCTCGCGGACAACTTTGGTATATGCCGCTTTATCCCAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCAt < 1:312060/289‑1 (MQ=255) tCATTGACATCGAGATTACAAAAATCCAGACGTGCACTCAGGGTGTCCCATAAACCTTCCCCAATGGTTTCTTTCATGAAAGTTTCGAGCGCCTCGCGGACAACTTTGGTATATGCCGCTCTATCCCAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGAGCCGAAAATGACCAGGTTACCGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCCTGTCAt > 2:41334/1‑289 (MQ=255) cATTGACATCGAGATTACAAAAATCCAGACGTGCACTCAGGGTGTCCCATAAACCTTCATCAATGGTTTCTTTCATGAAAGTTTCGAGCGCCTCGCGGACAACTTTGGTATATGCCGCTTTATCCCAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCAtt < 2:330152/289‑1 (MQ=255) aTCGAGATTACAAAAATCCAGACGTGCACTCAGGGTGTCCCATAAACCTTCATCAATGGTTTCTTTCATGAAAGTTTCGAGCGCCTCGCGGACAACTTTGGTATATGCCGCTTTATCCCAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTcc > 1:680792/1‑286 (MQ=255) 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aaTCCAGACGTGCACTCAGTGTGTCACATAAACCTTCAGCAATGGTTTCTTTCATGAAAGTTTCGAGCGCCTCGCGGACAACTTTGGTATATGCCGCTTTATCCCAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCg < 2:76075/289‑1 (MQ=255) cAGACGTGCACTCAGGGTGTCCCATAAACCTTCATCAATGGTTTCTTTCATGAAAGTTTCGAGCGCCTCGCGGACAACTTTGGTATATGCCGCTTTATCCCAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGt > 2:282655/1‑287 (MQ=255) aaaCGTGTCCTCAGGGGGTCCCATAAACCGTCATCAATGGTTTCTTTCATGAAAGTTTCGAGCGCCTCGCGGACAACTTTCGTATATGCCGCCTTATCCCAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGTTGGTACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACt < 2:380934/287‑1 (MQ=255) 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ggTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCTTTTACGAGCTTGCGAAAACTGTAAACGCTTATCCACCCGTGCGATTACGGGAAAAGCGCGCAAAGTGCGGCAAAACTGATaa > 2:145262/1‑289 (MQ=255) gCTGACCGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCTTTTACGAGCTTGCGAAAACTGTAAACGCTTATCCACCCGTGCGATTACGGGAAAAGCGCGCAAAGTGCGGCAAAACTGATAAAAAAATCATCGttt > 1:432561/1‑289 (MQ=255) aCCGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCTTTTACGAGCTTGCGAAAACTGTAAACGCTTATCCACCCGTGCGATTACGGGAAAAGCGCGCAAAGTGCGGCAAAACTGATAAAAAAATCATCGTTTTCCa > 2:402502/1‑289 (MQ=255) 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tttGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCTTTTACGAGCTTGCGAAAACTGTAAACGCTTATCCACCCGTGCGATTACGGGAAAAGCGCGCAAAGTGCGGCAAAACTGATAAAAAAATCATCGTTTTCCATTGGGTAAAAATCTGACACTGATCATGTTATGAAAAAAAATAACAACTTTTTTATCTGCTTTTGTCATTAACACGGCACACAGGCGTAATATCTg > 1:180114/1‑289 (MQ=255) | GCAGCAGTGTCATTGACATCGAGATTACAAAAATCCAGACGTGCACTCAGGGTGTCCCATAAACCTTCATCAATGGTTTCTTTCATGAAAGTTTCGAGCGCCTCGCGGACAACTTTGGTATATGCCGCTTTATCCCAGTCAGCACGCCCTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCTTTTACGAGCTTGCGAAAACTGTAAACGCTTATCCACCCGTGCGATTACGGGAAAAGCGCGCAAAGTGCGGCAAAACTGATAAAAAAATCATCGTTTTCCATTGGGTAAAAATCTGACACTGATCATGTTATGAAAAAAAATAACAACTTTTTTATCTGCTTTTGTCATTAACACGGCACACAGGCGTAATATCTG > NC_000913/1936022‑1936587 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |