Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,206,483 | G→A | 21.2% | K7K (AAG→AAA) | ttdA → | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,206,483 | 0 | G | A | 21.2% | 170.9 / 17.6 | 102 | K7K (AAG→AAA) | ttdA | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (15/62); new base A (17/4); total (33/69) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.38e-07 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
TATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCG > NC_000913/3206247‑3206719 | tATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGc < 2:282520/238‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAgg < 2:356970/236‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAgg < 1:835962/236‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAgg < 2:57842/236‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAgg < 1:132617/236‑1 (MQ=255) aTCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGc < 1:738001/237‑1 (MQ=255) cGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGGATTTTTTCAGACAAATAAAAAAA‑ATGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑GT‑GAGCGAAAGAAATAAGCaaacgacaggg > 1:740417/1‑230 (MQ=255) cGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGAAAAAAACAAAAA‑ATGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGGGCAAGGAAAAAACAAAAAGCaagg > 1:772923/1‑236 (MQ=255) cGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGAGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTTAGACAAAAACAAAAA‑CAGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑GC‑GAGGGAAAGAAATAAACAACAGAAAGTg > 1:251238/1‑239 (MQ=255) tAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGaa < 1:722731/238‑1 (MQ=255) tAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGaa < 2:688796/238‑1 (MQ=255) tAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGaa < 2:1119944/238‑1 (MQ=255) aaTTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCGCATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGT‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAAAAGGCAGTGaaga < 2:151113/239‑3 (MQ=255) ttATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAg < 1:76192/239‑1 (MQ=255) tATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGt < 1:1011294/239‑1 (MQ=255) gCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACa < 2:193477/239‑1 (MQ=255) tgtgATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAgag‑a < 1:1030916/238‑1 (MQ=255) aGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCt < 2:237923/239‑1 (MQ=255) cgcAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCAGAAAAATAAAAAAA‑AATG‑G‑GGTG‑GC‑ATG‑AT‑TAGCGAAAGGAATAAACAAAAAGAAGGGAATAAAATGACAGAG‑Atttttgccaa > 1:983174/1‑231 (MQ=255) aGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGGATTTTTTCAGAAAAAAACAAAAA‑CTTG‑A‑GTTG‑CC‑CTG‑AT‑GAGGGGAAGTAATAAACAAAAGGCAGTGAATAAATTGACAGAG‑ATTGttggttaatt > 1:503738/1‑230 (MQ=255) tgtATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGGATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAA‑ATGG‑A‑GTTG‑GC‑ACG‑AT‑GAGCGGGAGGAATAAGTAACAAGGAGAGAAAAAATTGGCAGAG‑ATTTTCTCTTAA‑TTT‑a > 1:1225525/1‑239 (MQ=255) tATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑Acc < 1:824393/239‑1 (MQ=255) tCGAAAAACTTTGCCATTCCCTGCCTTGGCGCAATTTTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACAAACTGTTATTTAC‑ATATTCAGGGTGGCAAAAAATAAAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAAAAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑TTTGTCGCTAAT‑TTT‑ACCGCCa < 2:1225525/239‑1 (MQ=255) tCGAAAAACATTGCCATCCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTGTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATAAAAACCCACATTTTTAGGGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CGGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCa < 2:1128342/239‑1 (MQ=255) aaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGC‑ATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGTACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGGAGTTTTTCCGTGAAATACAAAAA‑CCAG‑A‑GCTG‑GT‑ATG‑GT‑GATAGGGCGTAATAAGCAACAAGGAGAGGGTAAAATGAAAGGG‑GTTGTGCCTAAG‑TTT‑ACCGCCATGAtgta > 2:779950/1‑236 (MQ=255) cATTGCCATCCCTTGCTCTGGCGAAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAACCCACATTTTTAGGGGGAGTTTGGGGC‑GGTAAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CGGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCt < 1:696702/239‑1 (MQ=255) cacccctttctctGGCGCATTATATATTCTGATTACCGAGTTGAACAACGAACTGTTAAATGC‑ATATGCCGGGGGGAAAAAAATATAAATCAACATTTGTAGTGGGATGTTGGGGG‑GGTGATTTTAACAAAAAAAAAAAAAAAA‑CAGG‑A‑GTTT‑CC‑ATA‑AG‑GCGCTAAAAAAATAAGCAACAGACGGAAAAAAAGTATACAGAG‑TTTGCCGTTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGa < 2:318866/230‑1 (MQ=255) cATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGTTTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAAACAAATACAAAAA‑TTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑AAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTAAATAAGTGGAAAGAG‑ATTGTCCCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGa < 1:95797/239‑1 (MQ=255) cccTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCAGACAAATACAAAAA‑CAGG‑A‑GGTG‑CC‑CTG‑AT‑GAGAGAAAAAAAAAAACAAAACACAGGGGAAAAATTTAAAAGG‑AATTTAGCTCAC‑TTT‑ACCGCCCACATTTTTTCCCGaaag > 2:634911/1‑236 (MQ=255) ctctGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGGAAAAAACAAAAA‑CTTG‑C‑GTTG‑CC‑ACT‑CT‑TTGTGCAAGGAATAAGCAACAGGCCGAGGATAAGATGGCAGAG‑ATTTTCGGCAAA‑TTT‑ACCGCCATGATTTTTACCCGAAAGCCtgtt > 1:156371/1‑237 (MQ=255) ggCGAAATATTATTACTTATTACGGGGTTGATACACGAAATTTAAATTCA‑ATATTCTGGGTGGAAAAAAAGATAAAACCATTTTTTAATTGGGAGTTTG‑GGG‑GGGGAATTTTTACGAAAAAAAGCAACAA‑GTGGAA‑GTTT‑CC‑AAG‑AG‑GAGAGAAGTTAAAAGGCAACAGGTAGGAAAAAGGTAGACGGAA‑GTTGTCGTAATC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGAc < 2:1329746/238‑1 (MQ=255) cgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCCGACAAATACAAAAA‑ATGG‑A‑GGTG‑GC‑CTG‑AT‑GAGAGAAAGTAATAAAAAAAAAGCAGGGAATAAATTTAAAGAG‑AATTTCGCCAAA‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCCGATGAAgtg > 1:507303/1‑239 (MQ=255) cgaaaTATTCATTCTTATTTTCGGTTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTAAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACgt < 1:1272623/235‑1 (MQ=255) gaaaTATTCATCTTTATTTCGTCGTTGATACACGAA‑TTTTAAATACAATATTCACGGTGACAAAAAATATAAAACCCCATTTTAAGTGGTAGTTCGCGGC‑GGTAATTTTTCCCAAACAAATACAAAAA‑CGGG‑A‑GTTC‑CC‑CTG‑AT‑GAGCGAAAGAAATAAGCACCAGGCAGTGAATAAGTTGCCAGAA‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACgtg < 2:561957/236‑1 (MQ=255) ttttcattcTTATTTTCGCTTTTATACACGAACTTTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTAAATTTTTCCAAACAAATACAAAAA‑CGGG‑A‑GTGG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACGGGCGGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 2:28948/237‑1 (MQ=255) tatgtattcTTATTGCCTCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCGCATTTTTAGGGGTAGTTTGGGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAAAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑TTG‑AG‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTAAATAAGTTGACAGGG‑ATGGCCGTTACC‑TTT‑TCCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 1:1342860/234‑1 (MQ=255) tatTCATTTTTATTTTCGCGTTGATTCACGAATTGTTAATTAC‑ATATTCAGGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGAAAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTGG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGAAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 1:7648/239‑1 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATT‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑Acc < 1:735171/201‑1 (MQ=255) cattcTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCCGACAAATACAAAAA‑ATGG‑A‑GTTG‑CC‑CTG‑AT‑GAGCGGAAGGAATAAAGAACAAGCAGTGAAAAAGATGACAGAG‑AATGTCGCCAAA‑TTT‑AACGCCATGATTTTTAACCGAATGCCTGATGACGTGGGGGGTaaa > 1:561957/1‑239 (MQ=255) attcTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAAACAAAAACAAAAA‑ATGG‑A‑GGTT‑CC‑CTG‑AT‑GAGGGAAAATAATAAGCAAAAAGCAAGGAATAAATTGTCAGAG‑AATGTCGCTAAC‑TTT‑AACCCCATGCTTTTTACCCGAAAGCCCGGTGACGggggggggaaa > 2:1272623/1‑233 (MQ=255) ttATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaa < 1:871887/239‑1 (MQ=255) tATTTTCGCTTTGATTCACGAACTGTTAATTGC‑ATACTCACGGTGGAAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGG‑GGTGAATTTTTCCAAACAAATACAAAAA‑GTGG‑A‑GTTG‑CC‑TTG‑AG‑GAGCAAAAGTAAAAAGCAACGGGCATTAAAAAAGTGAACAGAG‑TTTTTCTCTAAT‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 1:992903/239‑1 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGGAATTTTTCAGACAAAAAAAAAAA‑ATAG‑A‑GGTG‑TC‑AAT‑AT‑GTGCGGAAGTAATAAAAAACACGCAGTGAATAAAGTTACAGAG‑ATTGTGGCTAAC‑ATT‑ACCGCCCATATTTTTATCCCCATACCTGATAAGAGGGGGGGTAAACAaaaa > 1:883698/1‑239 (MQ=255) ttttCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTCCAAACAAATAAAAAAA‑ATGG‑A‑GGTG‑CC‑CTG‑AT‑GAGCGCAAAGAAAAAGCAAAAAGCAGTGAATAAGATGAGAGAG‑ATTGTCGGTAAC‑TTT‑TCCGCCCAGAATTCTTCCCCAATGACTCAAGAAGAGGGGGGtaaaataaaaaa > 1:1028344/1‑237 (MQ=255) gTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTTCCACAAAAAAAAAAA‑ATTG‑A‑GTGT‑CC‑ACT‑GT‑TAGCGGAAATAATAAGCAAAACGAAGCGAATAAAATGAGAGAG‑AATTTTGTTAAA‑CTT‑TCCGCCAAGATTTCTACCCCGAAACCTGAGGACGTGGGGGGTAAAATAAAACAGCTaaaa > 1:86550/1‑238 (MQ=255) tGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAA‑ATGG‑A‑GGTG‑CC‑ATG‑AT‑TAGGGAAAGGAATAAGCAAAAAGCAGGGAATTAATTGACAGAG‑ATTGTTTCTAAC‑TTT‑TCCGCCCTGATTTTTACCCCCATGCCTGATGAAGTGGGGGGTAAACTTAAAAAGCTAAAGGATGCCGGAAcac > 1:1194302/1‑236 (MQ=255) ttAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGGGGAATTTTTCAAAACAAAAAAAAAAA‑TGGG‑G‑GTTG‑‑C‑ATG‑ATGGGGGGAAGGAAAAAAAAAAAAGGCAG‑GAATAAATTGAAAGAGAATTTTGGTTAAT‑TTT‑ACCACAATATTTTTTACTGAAATG‑CTGATAGAGTGGGGGGTAAAACAAAAAAGATAAAGGATTCCGaaaaagag > 2:273912/1‑233 (MQ=255) ttAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 1:303499/214‑1 (MQ=255) aTTAC‑ATATCCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGG‑GGTGAATTTTTCAAGAAAAATAAAAAAA‑CGGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AG‑GGGCGAAAGTAATAAGCAACGGGAAGTGAATAAGTTGAAAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGa < 1:674231/239‑1 (MQ=255) atatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGACAAATACAAAAA‑CTTG‑G‑GTTT‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGAAATAAAAAAAAGGCATTGAGTTAAATGACAGCA‑ATTATCGCTTAC‑TTT‑ACCCCCATGATTTTTACCCGAATGCCCTCTGACGTGGTGGGTAAAATAAAAAAGATAAAGGATGCCGAAAAGTAGTCGATgggg > 1:707493/1‑239 (MQ=255) atatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCAGACCAAAACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGGGAAAAGAATAAACAAAAGGCAGTGAAAAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ATCGCCACGCTTTCTACCCCAAAGCCTGATGACGTGGGGGGTAAAATAAAAAAGCTAAAAGATGCCCAAACATCGTCCGTgggg > 2:774665/1‑239 (MQ=255) tatTCACGTGTGCAAAAAATATAAAACCTATTTTTTAGTGGGAGTTTGTGGC‑GTTGAATTTTCCCAGACAAAAACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACGGGCAGTTAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCTCTACC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:480142/239‑1 (MQ=255) tatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGTTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:1166729/239‑1 (MQ=255) tatTCACGGGGGAAAAAAATATAAAACCACTTTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CGGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGAAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 2:772923/239‑1 (MQ=255) atTGACGGTGGCAAAAAATACAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATAAAAAAG‑CTGG‑A‑GTTG‑CT‑AGG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAAGAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGaa < 2:86550/239‑1 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAGACAAAAACAAAAA‑CTGG‑A‑GGTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGGAAGTAAAAAACAAAAAGCAGGGAATAAATTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCCTGATTTCTACCCGAATGCCCGATGACGTGGGGGGTAAACTAAAAAAACTAAAAGATGGCGAAACGTCGTCGGTggggga > 2:896696/1‑237 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTTCAAACAAATACAAAAA‑ATGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAATTAAAAGCAAAAAGCAGTGAATAAGATGAGAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑ATT‑TACGCCATGCTTTTTAACCGGATACCTGATGAAGGGGGGGGTAAAAAAAAACAGCTAAAGGAGGCCGAAACGGCGTCGCTggggga > 1:48406/1‑237 (MQ=255) tgcagggTGGAAAAAAATATAAAACCACTTGGTTGGGGGTAGTTGGTGGC‑GGTGAATTTTTCAAGAAAAAAAAAAAAA‑CGGG‑A‑GTGG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAAGAGGAAGGAAGTAGGTTGAAGGAG‑ATTGTCGATAAT‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:127005/232‑1 (MQ=255) tCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGGGAAATTTTTCAAACAAAAAAAAAAA‑AAGG‑AGGTTG‑CC‑‑TG‑AT‑GAGGGGAAAAAATAAACAACAAGAAAGGAATAAGATGATCGAG‑ATTGTCGCCAAC‑ATT‑TCCGCCCCAATTTTTACCCGAAAGGCTGATGACGTTGGGGGGAAAATCAAACCGCTAAAAGAAGCCGAAAAATCGGCGGTTGGGaaaa > 2:191838/1‑239 (MQ=255) tgggTGGAAAAAAATATAAAACCACATGTTTAGTGGGAGTTTGTGGG‑GGTGAATTTTTCAAGACAAATAAAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑GT‑GAGAGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAATTTGACAGAA‑ATTGGCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAAtt < 1:301350/237‑1 (MQ=255) gggggCAAAAAATATAAAACCACATGTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GATGATTTTTTCCAGAAAAACACAAAAG‑CTGG‑G‑TTTG‑CG‑ATG‑AT‑GGGCCAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTGGACAGAG‑ATTGGCGCTAAC‑TTG‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 1:779950/236‑1 (MQ=255) gggacAAAAAATAAAAAACCCTCTTTTTAGTGGTATTTTGTGGG‑GGTGAAATTTTACAGAAAAATCAAAAAG‑CGTG‑A‑TGTG‑CA‑ATG‑AT‑GGGCAAAAATAATAAACATTAGGCAGTTAAGAAGTTGACGGAT‑ATTGTCTTTAAC‑TCT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 2:1046192/234‑1 (MQ=255) ggagaaaaaaaTATAAAACCAAATTTTTAGTGTTATTTTGGGGC‑GGTAAATTTTTCAAGACAAATAAAAAAA‑CTGG‑A‑GTGG‑CC‑ATG‑AG‑GAGCAAAAGTAAAAACCAAGAGGAATTAAATAAGTTGAAGGAG‑ATTGCCG‑TAACTTTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 2:1028344/233‑1 (MQ=255) tGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCCCAGAAAAATAAAAA‑ATTG‑A‑GGTG‑CA‑ACG‑AT‑AAGGGAAAGAAATAATTCACAGGCAGGGACTAAGTTGTTAGAG‑AATGTTGCTAAC‑CTT‑ACCGACATTGTTTATACCCGAAAGCCTTATTACGTGGTGGAAAAACTAAAAAACCTAAACGAAGTCCAAACGTGGTCGGTGGGGAAAATTATc > 1:1298972/1‑238 (MQ=255) cAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAAATTTTTCAGAAAAATAAAAAAA‑ATGG‑A‑GGTG‑TC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAAAAAAAAAAAAGCAGGGAATAAGATGACAGAG‑ATTGGCGCTAAA‑TTT‑ACCGCCATGATTTTTACCCGAATGGCTGATGACGTGGGGGGTAAACTAAAACAGCTAAAAGGAGCCCAAAAGTCGTCGATGGGGGAAAATATCTAcc > 1:949350/1‑239 (MQ=255) aaaataAACCCAATTTTTTAGGGTTAGTTTGGGGC‑GGTGAATTTATCAAGAAAAAAAAAAAAA‑TTGG‑A‑GTGG‑CT‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACGGGCAGTAAATAAGACGAGAGGA‑TTTGCCGCTAAT‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 1:429396/236‑1 (MQ=255) aaTAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGC‑GGTGAATTTTTCCAGAAAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑AGG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTAAATAAGTTAACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 2:1194302/239‑1 (MQ=255) caTTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGGATTTTTTCAAACAAAAACAAAAA‑ATTG‑G‑GGTT‑TC‑ATG‑GT‑GAGGGGAAGTAAAAAACAAAAGGCAGAGAAAAAATTGAAAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCCTGATTTTTTCCCCCAAGCCTGATGACGGGGGGGGTAAAATAAAAAAACTAAAAGAAGACGAAAAGGCGTCGGTGGGGGAAAATATTTACCACACGATGTTTGacaac > 2:531321/1‑239 (MQ=255) gtttgggggC‑GGTGAATTTTTCCAGAAAAATACAAAAG‑CTGG‑A‑GTGG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAAAAAGTGGCAAAAG‑TTTGTCCTTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTTCCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 1:88424/232‑1 (MQ=255) atttggtgGC‑GGTGAATTTTTCCAAAAAAATACAAAAC‑CTGG‑A‑GTAT‑CC‑ATG‑AT‑GGACGAAATAAAAAACAAACAGGCATTGAATAAGTTATCATAT‑ATTTTCGCTAAT‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 2:707493/234‑1 (MQ=255) aGTTTGTGGG‑GGTAAATTTTCCAAAAAAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑‑C‑ATGAAG‑GAGCAAAATTAAAAAGCAACAGGCAGTAAATAAGTGAACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTG‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 2:1019870/239‑1 (MQ=255) aGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACCAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GGTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAACAAAAGGCAGTGAATAAGATGACAGAG‑ATTGTTGCTAAC‑TTT‑ACCCCCATGCTTTCTACCCGAAAGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAAAAGCTAAAGGATGCCGAAAAGTCGTCGGTGGGGAAAAATATCTACCATAAAATGTTTGACAACATACAAAAAACGa > 1:1000310/1‑239 (MQ=255) aGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑TTTG‑CA‑AGG‑AG‑GAGCGAAAGTAAGAAGCAACAGGCGGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 2:117489/239‑1 (MQ=255) ttGGGGC‑GGTGAATTTTTCCAGAAAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGAtt < 1:284448/238‑1 (MQ=255) tgGC‑GGTAAATTTTCCCAGACAAATAAAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑AAGCGAAAGAAAAAACCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGAc < 1:272301/238‑1 (MQ=255) ggTAAATTTTTCCAAAAAAATAAAAAAA‑CGGG‑A‑GTTG‑CA‑ATG‑AT‑GAGCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTAAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGa < 1:531321/238‑1 (MQ=255) tttCAAGAAAAAAAAAAAAA‑CTGG‑G‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCAAAAGAAATAAGCAACAGGAAGTGAATAAGTTGACAGGA‑ATTGCCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctg < 2:945321/239‑1 (MQ=255) tttcaaaaaaaaACAAAAAGCTGG‑A‑GTGC‑GA‑ATG‑AT‑GAGAGAAAGGAATAAAAAACAGGCGGTGAAAAAGTGGACAGAG‑TGTGTCGTTACC‑TTT‑CCCGCCAGGATTTCGACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctg < 2:713947/231‑1 (MQ=255) acagaaCAAATACAAAAA‑CTGG‑‑‑GTTG‑CCAATA‑AG‑GAGCGAAAGAAATAAGCAACAGGCAGAAAATAAGTTAAAAGAG‑ATTGTCGC‑AAC‑TTTAACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctgcc < 2:251238/234‑1 (MQ=255) aaaaaTAAAAAAA‑CTAG‑‑‑GTTGCCC‑ATG‑AT‑GAGAAAAATGAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGTTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCa < 2:527294/237‑1 (MQ=255) aaaaaACAAAAA‑TGGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AA‑GAGGAAAAGGAAAAAGCAACGGGAAGTAAAAAAGTGAACAGAG‑ATTGTCGCTAAT‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTc < 2:59070/236‑1 (MQ=255) aaaTACAAAAA‑CGGG‑A‑GTTG‑CC‑ATA‑AT‑GAGGAAAAGTAATAAGAAACAGGCAGTAAATAAGTTGAAAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAgg < 1:1293926/239‑1 (MQ=255) aaaa‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑AGG‑AT‑GAGCAAAAATAATAAGCAAGAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTACT‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgg < 2:507303/239‑1 (MQ=255) aaaa‑CGGG‑A‑GTTT‑CC‑AGG‑AG‑GAGCAAAATTAATAAGCAACAGGCAGTAAAAAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTA‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgg < 1:509066/239‑1 (MQ=255) aa‑CTGG‑A‑TTGG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCAAAAGTAAAAAGCAAAAGGAAGTGAATAAGTTGAAAGGT‑ATGGCCGCTAAT‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgggg < 1:981200/239‑1 (MQ=255) aa‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTAAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTACC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgggg < 2:792659/239‑1 (MQ=255) aa‑CGGG‑T‑GTGG‑CC‑ATG‑AT‑GAGGAAAAATAATAAACAACAGGCAGTGAATAAGTTGAAGGAG‑ATTGCCGTAAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgggg < 2:395858/239‑1 (MQ=255) a‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACGCCGGGga > 1:798271/1‑239 (MQ=255) g‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGAtt > 2:204027/1‑239 (MQ=255) g‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGt > 1:1009050/1‑238 (MQ=255) g‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGt > 1:1270539/1‑238 (MQ=255) c‑ATG‑AT‑GAGGAAAAGTAATAAGAAACTGTCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATGGTCGTTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGttc < 1:176245/238‑1 (MQ=255) c‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAAAAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGCCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGttc < 1:896696/238‑1 (MQ=255) aatg‑ag‑gAGCAAAGATAAAAAGCAACGGGCAGGGAATAAGTTGCAAGAG‑ATTGCGGCAAAT‑TTA‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTGCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGttc < 2:740454/237‑1 (MQ=255) aagggt‑gaGCAAAAGAAATAAGAAACAGGCAGTGAAGAAGTTGAAAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGttc < 2:740417/233‑1 (MQ=255) at‑gaGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACgtg > 2:73660/1‑96 (MQ=255) at‑gaGCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACgtg < 1:73660/96‑1 (MQ=255) gggggaaagaaaAAAACACAAGGCATTAAATATGTTGAAGGAG‑CTGGTCTATAAT‑TTT‑CCCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTTGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTCCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGtt < 2:1260604/234‑1 (MQ=255) taaGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTccc > 1:1133048/1‑239 (MQ=255) gCAACAGAGAATGAAAAAGGTGACAGAG‑TGTGTCACTACC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTGCGTTAAAGTCGGTTCCCg < 1:811517/237‑1 (MQ=255) | TATTCAGCATCGTTAATTATCCGCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTAC‑ATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGC‑GGTGAATTTTTCCAGACAAATACAAAAA‑CTGG‑A‑GTTG‑CC‑ATG‑AT‑GAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAATAAGTTGACAGAG‑ATTGTCGCTAAC‑TTT‑ACCGCCATGATTTCTACCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCG > NC_000913/3206247‑3206719 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |