| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 3830057 | 180 (1.300) | 4 (0.030) | 3/418 | NT | 2.4% | coding (1113/1392 nt) | xanP | xanthine permease |
| ? | NC_000913 | = 3830253 | 157 (1.160) | coding (1309/1392 nt) | xanP | xanthine permease | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 196 total aligned reads displayed.
TCTGACGTTTCCGAACAGCCAGTGTCCGGTCCGCTGTACATGAAACGCCTGAAAGGCGGCGTGCTGGCAAACGGCCTGAACTCGTTTGTTTCGGCGGTGTTTAACACCTTCCCGAACTCCTGCTTCGGGCAAAACAACGGAGTGATCCAGTTGACTGGTGTTGCCAGCCGCTATGTCGGTTTTGTCGTCGCGCTGATGTTGATCGTGCTGGGTCTGTTCCCGGCAGTGAGCGGTTTTGTACAACACATTCCAGAACCGGTTCTGGGCGGCGCAACGCTTGTAATGTTTGGCACCATCGCCGCCTCCGGTGTGCGTATCGTTTCTCGTGAGCCGCTGAACCGTCGGGCGATTCTGATTATCGCGCTGTCGCTGGCGGTTGGTCTGGGCGTGTCTCAGCAGCCGCTGATTTTGCAGTTTGCCCCTGAATGGCTGAAAAACCTGCTCTCCTCCGGGATCGCCGCGGGCGGTATTAC > NC_000913/3829821‑3830293 | tctGACGTTTCCGAACAGCCAGTGTCCGGTCCGCTGTACATGAAACGCCTGAAAGGCGGCGTGCTGGCAAACGGCCTGAACTCGTTTGTTTCGGCGGTGGTTAACACTTTCCCGAACTCCTGCTTCGGGCAAAACAACGGAGTGATCCAGTTGAATGGTGTTGCCCGCCGCTTTGGCGGTTTTGTCGTCCCGCTGGATTTGCTCGTGCTGGGTTTGTTCCCCGCCGTGATGGGTTTTgg > 2:1489395/1‑238 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |