New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
GCGCCGGATAACTGAAAATCCAGTGGCGAAAAGGGCAGCGTTTTTTCCTCGCTGAAGGGAGCGGTGTCTACCAGGCGATACAGTGCGGCCCACTGCTGGTGATGACTTGCCCGTAGTCGAATTAATGCGTCGCGCTCTTCATGGTGTGTCGATGACAGAAAAATGAGCGTAACTAACATCAGCAACCAGAATGCCCAGCAAAGCTGGCGGAGGCGGGGTGATGTGGCGAA‑CCACCAGTCAAAGAACATGTTCATCGCTAACCTTCCTTGTTAACTGATACTCAAATTGCCAGCGTCCCTGCGCATCCTGCTGCGTGGCTCCCCGCTGATTGAGATGAAAAGATGCATCCTGGCGGAGTGACGTTTCTAGTGCGTTTAACGCGGTAATGCTTGTTGTCAGCCCCTTGATCTCCAGCGTTCCCTGCTGCCAGCTTATCGTTGTCAGCCAGGCGTGCTCGGGTAAAAGCGCCGCCAGT > NC_000913/3521196‑3521670 | gcgcCGGATAACTGAAAATCCAGTGGCGAAAAGGGCAGCGTTTTTTCCTCGCTGAAGGGAGCGGTGTCTACCAGGCGATACAGTGCGGCCCACTGCTGGTGATGACTTGCCCGTAGTCGAATTAATGCGTCGCGCTCTTCATGGTGTGTCGATGACAGAAAAATGAGCGTAACTAACATCAGCAACCAGAATGCCCAGCAAAGCTGGCGGAGGCGGGGTGATGTGGCGAA‑CCACCAGTc < 2:1389237/239‑1 (MQ=255) 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tGAAAATCCAGGGGCGAAAAGGGCAGCGTTTTTTCCTCGCTGAAGGGAGCGGTGTCTACCAGGCGATACAGTGCGGCCCACTGCTGGTGATGACTTGCCCGTAGTCGAATTAATGCGTCGCGCTCTTCATGGTGTGTCGATGACAGAAAAATGAGCGTAACTAACATAAGCAACCAGAATGCCCAGCAAAGCTGGCGGAGGCGGGGTGATGTGGCGAA‑CCACCAGTCAAAGAACATGtt < 1:1293784/239‑1 (MQ=255) aaaaTCCAGTGGCGAAAAGGGCAGCGTTTTTTCCTCGCTGAAGGGAGCGGTGTCTACCAGGCGATACAGTGCGGCCCACTGCTGGTGATGACTTGCCCGTAGTCGAATTAATGCGTCGCGCTCTTCATGGTGTGTCGATGACAGAAAAATGAGCGTAACTAACATCAGCAACCAGAATGCCCAGCAAAGCTGGCGGAGGCGGGGTGATGTGGCGAA‑CCACCAGTCAAAGAACATGTTc < 1:863120/238‑1 (MQ=255) aaaaTCCAGTGGCGAAAAGGGCAGCGTTTTTTCCTCGCTGAAGGGAGCGGTGTCTACCAGGCGATACAGTGCGGCCCACTGCTGGTGATGACTTGCCCGTAGTCGAATTAATGCGTCGCGCTCTTCATGGTGTGTCGATGACAGAAAAATGAGCGTAACTAACATCAGCAACCAGAATACCCAGCAAAGCTGGCGGAGGCGGGGTGATGTGGCGAA‑CCCCCCGTCAAAGAACCTGtcaa > 2:1001134/1‑236 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |