| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,206,506 | C→A | 17.5% | T15K (ACA→AAA) | ttdA → | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,206,506 | 0 | C | A | 17.5% | 259.7 / 12.1 | 105 | T15K (ACA→AAA) | ttdA | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (39/44); new base A (9/10); total (50/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
TGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCCACTGCTTGGCGAGCTGC > NC_000913/3206274‑3206742 | tgATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GAATTTTTTCAGACAAATACAAAAAAAGGAGTTGCCATAGTTGGCGAAAGAAATAAACAAAAGACAATGAAT‑AAATTA‑ACAGAGATTg > 2:1499789/1‑239 (MQ=255) tgtATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GAATTTTTTCAGACAAATAAAAAAAATGGAGGTGCCCTGGTGAGGGGAAGTAATAAAAAACAAGCAGTGAAT‑AAAGTG‑TAAAAGATTGTCGCT‑AAAttt > 1:1231640/1‑238 (MQ=255) tgtATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GAATTTTTTCAAACAAAAAAAAAAAATGGAGTTTCCATGATGGGGGGAAGTAATAAGAAACAAGCAGTGAAA‑AAAATG‑ACAGAGATTGTTGCT‑TACttt > 1:267806/1‑238 (MQ=255) cGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GGATTTTTTTAGACAAATACAAAAACCGGAGTCGCCATACTTGGCGGAAGTAATAAAAACCAAGCAGAGGAT‑AAAATG‑TAAGACATTATCCCC‑AACATT‑TCCGCCaa > 1:1450575/1‑238 (MQ=255) aaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GGATTTTTTCATACAAATACAAAAAAAGGGGTTTCCATTGTGAGGGAAAGAAAAAAAAAAAAGGAACAGAAT‑AAGATG‑ACATAGATTTTCGCT‑AACTTT‑ACCCCCCTGGttt > 2:1435656/1‑239 (MQ=255) tGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GAATTTTTTCAGACCAATACAAAAAATTGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAACAACAGGGCGGGAAT‑AAGATT‑ACAGAGATTGTTGGT‑CAATTT‑TACGCCATGCttttttc > 1:732931/1‑234 (MQ=255) cccTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GAATTTTTTCCGACAAAAACAAAAAATTGAGGTGTCATGATGAGCGGAAATAATAAGCAAAAAGCAGTGAAT‑AAGTTG‑AAAGGGATTGTCGCT‑AAATTT‑ACCCACATGATTTTTA‑CCCGAATg > 1:871984/1‑238 (MQ=255) tctGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCTTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GAATTTTTCCAGAAAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑ATTTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCtgatg < 1:734121/239‑1 (MQ=255) gcgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GGATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAAATGGGGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAACAACAAGCAGTGAAA‑AAATTG‑AACGAGATTGTCGCG‑TACATT‑TCCCCCATTATTTTTA‑CCCCAAAGACTCATTACgt > 1:59752/1‑239 (MQ=255) cgcAATATTAATTTTTATTTCAGCGTTGATTCACAAACTGTAAATTACATATTCAGGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACgt < 2:187344/238‑1 (MQ=255) gaaaaattcatttTTTTTTTCGCGTTGATTCACGAACTTTTAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GATTTTTTCAAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCTATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGCCAGTAATT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑ACCTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACgtg < 1:1111782/233‑1 (MQ=255) gaaaTATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GAATTTTTCAAGACAAAAACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACgtg < 1:1499789/236‑1 (MQ=255) tatTCATTTTTTTTTTCGCGTTGATTCACGAACTTTTAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATAAAAACCCACATTTTTAGTGGTATTTTGTGGCGGT‑AAATTTTTCCAGAAAAATAAAAAAACTGGAGTTGCAATGATGAGCGAAATTAATAAGCAACAGGCAGTAAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATGGTCGTT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 2:1225370/239‑1 (MQ=255) tatTCATTTTTATTTTCGCTTTGATTCACGAATTTTTAATTACATATTCAGGGTGGAAAAAAATATAAAACCAAATTTTTAGTGGTGGTTTGTGGCGGT‑GAATTTTTCCAAAAAAATAAAAAAACGGGGGTTGCCATGATGAGCAAAAGTAATAAGCAACGGGCAGTAAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AATTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 2:1231640/239‑1 (MQ=255) tatTCATTTTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGGGGAAAAAAATATAAAACCCCATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑AAATTTTCCCAGAAAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCAAAAGTAATAAGCAACAGGCATTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 1:1435656/239‑1 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTGCGCGTTGATTCACAAACTGTTAATTAAATATTCACGGGGGCAAAAAATATAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GAATTTTTCCAGACAAAAACAAAAACTGGAGTTGCCATGATAAGCGAAAGTAATAAGCAACGGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 1:1285598/239‑1 (MQ=255) tatTCATTCTTAATTTCTCTGTAATCCACGAATTGTTAATTACAGATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTGTGGGTAGTTTGTGGGGGT‑GAATTTTTCCAAACAAATACAAAAACTGGTGTTGCAATGGTGAGCGAAAATAATAAGCACCAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACATTGATTGACGCT‑AATTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGa < 2:1495060/239‑1 (MQ=255) ttATTTTCGCGTTGATTCACGAATTGTTAATTACATATTAACGGAGGCAAAAAAAATAAAACCACATTTGTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAAGTGGAGTTGCCATGATGAGAAAAAAAAATAAGCAACAGGCAGTAAAG‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑ATCTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaa < 1:869/239‑1 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GAATTTTTTCAGACAAAAACAAAAAATGGAGGTGGCATGGTGAGCGAAAGTAAAAAAAAACAAGCAAGGAAT‑AAAATG‑ACAGAGATTGTTGCT‑AAATTT‑ACCCCCATGATTTTTA‑TCCCAAAGGCTGATGACGGGGGGGGtaaaataaaa > 1:208935/1‑239 (MQ=255) tATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GAATTTTTTCAGAAAAATACAAAAAATGGGGTTTCCATGATGAGCGAAAGAAAAAAACAAAAAGCAGAGAAA‑AAAATG‑AAAGAAATTGTTGCT‑AAACTT‑TCCGCCCTGATTTTTA‑CCCCAAATCCTGATGAAGcggtggggaaaaaaaaa > 1:87149/1‑228 (MQ=255) cgcgTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCGCGGTGGAAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑AAATTTTTCCAGAAAAATACAAAAACTGGATTTGCCATGATGAGCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTAAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTa < 2:445209/239‑1 (MQ=255) gcgTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GAATTTTTTCAGACAAATAAAAAAAATGGAGTTGGCATGATTAGCGGAAGAAATAAACAACAAGGAGAGAAT‑AAAATG‑AGAGAGAGTGTTGCT‑AAATTT‑ACCCCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGGGGATAAAATAAAACAGCtca > 1:567210/1‑237 (MQ=255) cgTTGATTATCAATCTGTTAATTGCTTCATAAGGGAGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTATTGTTAGTTGTTGGCGGT‑TAATTTTACTAAACAAATCAAAAAATTGGATTGGCCAGGATGACAGAAAGAAACAGGAAAAAGGCCGTAAAT‑AAGTTG‑CCAGAGATTGTCGCT‑ATTTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTaaa < 1:1181395/239‑1 (MQ=255) cGAACTGTTAATTAAATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTGGTGGCGGT‑GAATTTTTCCAGACAAATAAAAAAACTGGAGTTGCAATGATGAGCAAAAGAAATAAGCAACAGGTAGTGAAT‑AAGTTG‑AAAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGaa < 1:894167/239‑1 (MQ=255) gaccttttAATTACATTTTCACGGTGGAAAAAAATATAAACCCACATTTTTAGGGGTAGTTTGGGGCGGT‑GAATTTTTCCAGACAAATAAAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAAAAAGCAACAGGCAGTGAAT‑‑AGTTGAACAGAGATGGTCGCT‑ACCTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGaaa < 1:31673/233‑1 (MQ=255) tGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GAAATTTTTCAAACAAAAAAAAAAAATGGGGGTGTCATGATGAGGGGAAAAAATAAACAAAAGGAAGTGAAT‑AAGTTG‑AAAGAGAATGTCGCTAAAATTT‑ACC‑CCATGATTTTTA‑CCCGAAAACCTGCTGACGTGGTGGATAAAAAAAAAAAGCTAAAAGATGCCGacaacg > 1:425549/1‑233 (MQ=255) ttAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GAAATTTTTCACACAAAAACAAAAAAAGGAGTTGCCCTCATGAGGGGAAAAAAAAAAAAAAAAGCAGCGAAA‑AAGTTG‑AAAGAGATTGTGGCT‑AACTTT‑ATACCCATGATTTTTT‑ACCCAATGCCTGTTGTAGGGGTGGGGAAACCAAAAAAGATTAAAGAAGGCGaaaattgg > 2:819420/1‑233 (MQ=255) atatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GGATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAACTGGAGGTGTCTTGATGAGGGGAAGTAAAAAACAAAAGGGAGAGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTTTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCCTGATTTCTT‑CCCGCATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAACTAAAGAATGCCGAAACGACGTC‑GGAgggg > 2:91766/1‑239 (MQ=255) tatgccgggTGGCAAAAAAGAAAAAACCACATTTTAAGGTGTTGTTGGTGGCGTG‑TAATTTTTCCAGACAAACACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGGTAAAGAAAAAAGCAACAGGCAGTTAAA‑AGTTTG‑ACAGAGTTTGTGGCT‑ATCTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGa < 2:903177/232‑1 (MQ=255) tatTCGCGGTGAAAAAAAATAAAAAACCAAATTTTAAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GAATTTTCCAAGACAAAAAAAAAAACGGGAGTTGCCTGGATGAGCGAAAGTAATAAGCAAACGGCAGTGAAT‑AATTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGa < 2:687815/239‑1 (MQ=255) tatTCACGGGGGCAAAAAATATAAAACAACATTTTAAGGGGTAGTTTGTGGGGGT‑GAATTTTCCCAGACAAATAAAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTA‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGa < 1:323688/239‑1 (MQ=255) tatCCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGCGGT‑AAATTTTCCCAGAAAAATAAAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTAAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGa < 1:813275/239‑1 (MQ=255) tgggaaaaaaaaaTAAAACCACTTTTTTAGTGGTAGTTTGGGGGGGG‑GAATTTTTACAGACAAATACAAAAACTGGAGGTGCCATGATGAGGGAAAGTAATAAGCAACAGGCATTAAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTTCCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTAt < 2:853033/233‑1 (MQ=255) tgggaaaaaaaTAAAAAACCCAATTTTAAGTGTGAGTTTGTGGGTGT‑AAATTTTCCCAGACAAATAAAAAACCGGGAGTTCCCTGGAGGAGGGAAATTAATAAGCAAAAGACATTAAAG‑AAGTGG‑ACAGAGATTGTCGCT‑ATCTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTAt < 2:513031/233‑1 (MQ=255) ggggaaaaaaaTATAAAACCACATTTTTGGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GAATTTTTCCAGAAAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAAT‑AAGTGG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTAt < 2:267806/233‑1 (MQ=255) gTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GAATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAAATGGGGTTGCCATGATGAGCGGAAGTAATAAAAAACAAGCAGAGAAT‑AAATTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑TCCGCCATGATTTTTA‑CCCCAAAGCCCGATGACGGGGGGGGTAAAATAAAACAGCTAAAAGATGTCGCAAAGTCGCC‑GGGGGGGGAAATTa > 1:513765/1‑237 (MQ=255) gTGGAAAAAAAAAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGGGGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACGGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AATTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTAt < 1:1389957/238‑1 (MQ=255) tGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GAATTTTTTCCGACAAAAACAAAAACTGGAGTTTCCATGATGAGCGAAAGTAAAAAACAACAGGCAAAGAATAAAGTTG‑‑CAGAGATTGTCGCT‑AAATTT‑ACCGCCATGATTTTTT‑CCCCAATGCCCGATGAAGTTGGGGGTAAAATAAAAAAACTAAAAGGTGCCGAAAACGCGTC‑GGTGGGGGAAAATATCt > 2:224749/1‑239 (MQ=255) tGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GAATTTTTTCAAACAAAAAAAAAAAATGGAGGTGTCATGATGAGCGGAAATAATAAACAAAAAGCAAGGAAT‑AAAATG‑ACAGAGATTGTTGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTTTACCCCCAATG‑CTTATGGCGGGGGGGGTAAAACAAAACAGCTAAAAGGAGCCGAAAAGGCCTCGGAGGGGGAAAAtatat > 2:628479/1‑235 (MQ=255) agaaaaaaaTATAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGCGGT‑AAATTTTTCAAAACAAAAACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGGAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTAAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGTT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTa < 2:348892/236‑1 (MQ=255) gCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GAAATTTTTCAAACAAATAAAAAAAATGGAGTTGGCATGATTAGCGAAAGGAATAAAAAAAAGGCAGGGAAT‑AAATTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCCTGATTTTTA‑CCCCAAAACCTGATGAAGTGGGGGGTAAAATAAAACAACTAAAAGAAGCCCAAAACTCGTC‑GGTGGGGGAAAATATTTa > 1:405616/1‑238 (MQ=255) cAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GAATTTTTTCAGACAAAAAAAAAAAATGGAGGTGGCATGATGAGCGGAAGTAAAAAACAAAAAGCAGAGAAT‑AAAATG‑ACAAAGATTGTCGGC‑AACTTT‑TACACCCTGATTTTTT‑CCCCGATGGCTCATGAAGTGGGGGGTAAAATAAAAAAACGAAAAGAGACCGAAAAGTCGCC‑GGTGGGGGAAATTATATAcc > 2:1389957/1‑239 (MQ=255) aaaaTATAAACCCAAATTTTAAGTGGTAGTTTGGGGCGGT‑AAATTTTCCCAAAAAAATAAAAAAACTGGATTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATa < 1:303345/239‑1 (MQ=255) aaTATAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GAATTTTTCCAGACAAATAAAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 1:856817/239‑1 (MQ=255) aaTAAAAAACCACAGTTATAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑AAATTTGCCAAGAAAAAAACAAAAACGGGAGTTGCAATGATGAGCAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCTCA‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 2:732931/239‑1 (MQ=255) ataAACCCAAATTTTGAGGGGTATTGTGTGGGGGT‑GAATTTTGCCAAAAAAATACAAAAACTGGATTTGCTATAAGGAGCGAAAGTAAAAAACAACAGGCAGTGAAA‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGAT‑ACCTTA‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATg < 2:1296097/239‑1 (MQ=255) taAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTGGAATTTTTCC‑GACAAAAAAAAAAAATGGAGTTGGCATGTTGGGGGGAAAAAATAAACAAAAAGCAGTGGAT‑AAAATT‑AAAGAAAATGTTGCT‑AAATTTAACCCCCAT‑ATTTTTA‑CCCCAATGCCCGATGACGGGGGGGGGAAAAAAAAAAAGCTAAAAGATGGCGGAACATCGGC‑GGTGGGGGAAAATATATAACATAcaaagt > 2:837292/1‑234 (MQ=255) caTTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GGATTTTTTCAGACAAAAACAAAAAATGGGGTTGCCATGATGAGGGAAAGAAATAAGCAACAGGCAGTGAAA‑AAATTG‑AAAGAGATTGTCTCT‑AACTTT‑ACCGCCCTGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGGTAAAATAAAAAAGCTAAAGGATGCCGAAAAGTCGTC‑GGTGGGGAAAATTATATAACATCAGATTTTCGacaac > 1:1188013/1‑239 (MQ=255) tgggattttGTGGGGGT‑GAATTTTTCCAGAAAAATAAAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTAAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCaaaa < 2:712410/232‑1 (MQ=255) ggttggggggggT‑AAATTTTACAAAAAAAATAAAAAACCTGGAGTTGCAATGATGAGCGAAATAAATAAGCACAAGGCAGTAAAT‑AAGTTG‑ACAGAGTTTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 2:425549/229‑1 (MQ=255) aGTGTGTGGTGGT‑GAATTTTTCCAAAAAAATACAAAAACTGGAGTTGCTATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACGGGAAGGTAAT‑AAGTTG‑AAATAGATTGTCGTT‑CACTTT‑TCCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 1:779026/239‑1 (MQ=255) gtgcatgtaaaTTTTACCAAACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTATAAAGCAACAGGCAGTAAAT‑AAGTTG‑AGAAAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGAc < 1:382967/230‑1 (MQ=255) ttccaaGAAAAATACAAAAATTGAAGTTGCAATGAGGGGAGAAAGAAAAAACCAACAGGCAGTGAAT‑AATTTG‑ACAGAGATTGTCCAT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctg < 1:579119/234‑1 (MQ=255) gACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTc > 2:679607/1‑239 (MQ=255) aaaaaaaaaaaaaCTGGAGTTGCAATGATGAGCAAAAGTAAAAAGCAAAAGGAAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcc < 2:1222728/222‑1 (MQ=255) aaaaaaTGGAGTTGCCATGATGAGCTAAAGTAATAAGCAACAGGAGGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGATATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCg < 2:82481/239‑1 (MQ=255) aaaCTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAg > 1:1222728/1‑230 (MQ=255) aaaCTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCggg > 1:951176/1‑239 (MQ=255) aaaCTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCggg > 1:819506/1‑239 (MQ=255) aaCTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGAAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGAT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgggg < 1:1465131/239‑1 (MQ=255) aaCTGGAGTTGCCAGGAGGAGCGAAAGAAAAAAGCAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑AAAGAGATGGCCGCT‑AACTTA‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgggg < 1:454149/239‑1 (MQ=255) aaCGGGAGTTGCAATGAGAAGGAAAAGTAATAAGCAACAGGCAGGGAAT‑AAGTTA‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgggg < 2:513765/239‑1 (MQ=255) aCTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCGTACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGga > 1:347329/1‑239 (MQ=255) aCTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGga > 1:1512087/1‑239 (MQ=255) gCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCACAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGt > 2:93872/1‑238 (MQ=255) gCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGt > 1:1294000/1‑238 (MQ=255) gCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGt > 2:1114524/1‑238 (MQ=255) gCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTAAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGTT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGtt < 1:463405/239‑1 (MQ=255) cATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGttct < 1:837292/239‑1 (MQ=255) cGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAg > 1:961929/1‑239 (MQ=255) cGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAg > 1:574027/1‑239 (MQ=255) cGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAg > 1:175359/1‑239 (MQ=255) aaaaGTAAAAAGAAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑AAGGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTaaa < 2:405616/236‑1 (MQ=255) aGTAATAAGCAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCgg > 1:958413/1‑239 (MQ=255) aaGCAACAGGCAGGAAAA‑AAGTTG‑AAAGATATTGCCGCT‑AAATTC‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCg < 2:306282/239‑1 (MQ=255) aaCAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑CCCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCt < 1:91766/237‑1 (MQ=255) cAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctg > 2:1010147/1‑184 (MQ=255) cAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGCGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTccc > 1:303793/1‑239 (MQ=255) cAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGAtt > 2:264252/1‑207 (MQ=255) cAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTccc > 2:918417/1‑239 (MQ=255) cAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTccc > 2:1367610/1‑239 (MQ=255) cAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTccc > 2:172669/1‑239 (MQ=255) cAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATACCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGCGGAGATTATGTTCTTCGTTACAGTCGGTTCCCGCTTccc > 1:1526525/1‑239 (MQ=255) cAGGCAGTAAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AGCTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctg < 1:1010147/184‑1 (MQ=255) cAGGCAGTAAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGAtt < 1:264252/207‑1 (MQ=255) gggaatagAAT‑AAGTTG‑AAAGAGAGTGCCACT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCCa < 1:864913/232‑1 (MQ=255) aGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCaa > 1:1438642/1‑154 (MQ=255) aGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCCACt > 1:98148/1‑237 (MQ=255) t‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTA‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCCACTGCTTGGCg < 1:845919/239‑1 (MQ=255) aaggTTG‑AAGGAGTTTGTCGCT‑ATGTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCCACTGCTTGGCg < 2:322038/236‑1 (MQ=255) atttG‑AAAAAGTTTGTCGTT‑AAGTTA‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCCACTGCTTGGCGAg < 2:958413/237‑1 (MQ=255) aggtG‑ACAGATATTGTCGCT‑ATCTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCCACTGCTTGGCGAg < 2:548462/236‑1 (MQ=255) g‑ACAGAGTTGGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCCACTGCTTGGCGAGCTGc < 1:766642/239‑1 (MQ=255) g‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCCACTGCTTGGCGAGCTGc > 2:257644/1‑239 (MQ=255) g‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCCACTGCTTGGCGAGCTGc > 2:1399969/1‑239 (MQ=255) g‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCCACTGCTTGGCGAGCTGc > 1:1185212/1‑239 (MQ=255) g‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGACTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCTCACTGCTTGGCGAGCTGc > 1:1132289/1‑239 (MQ=255) g‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGGGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCCACTGCTTGGCGAGCTGc > 2:1261735/1‑239 (MQ=255) cAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGa > 2:440884/1‑105 (MQ=255) cAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGa < 1:440884/105‑1 (MQ=255) | TGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGT‑GAATTTTTCCAGACAAATACAAAAACTGGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGTAATAAGCAACAGGCAGTGAAT‑AAGTTG‑ACAGAGATTGTCGCT‑AACTTT‑ACCGCCATGATTTCTA‑CCCGAATGCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATGCCGAAACGTCGTC‑GATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCCACTGCTTGGCGAGCTGC > NC_000913/3206274‑3206742 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |