| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,675,489 | T→G | 16.0% | V235G (GTG→GGG) | yhjE → | putative MFS transporter; membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,675,489 | 0 | T | G | 16.0% | 373.8 / 10.7 | 136 | V235G (GTG→GGG) | yhjE | putative MFS transporter; membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/76); new base G (23/2); total (58/78) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.11e-08 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
CCGCGCAAACGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTATCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCG‑CTGCATG‑AGTCGCCGGTG‑TTT‑GAGAAA‑GTCGCTAAAGCGAAAAAACAGGTGAAGATCCCGCTGGGTACGCTGCTGACCAAAC‑ATGTTCGCGT‑AACCGTACTGGGTACGTTCATTATGCTGGCAACCTATACGCTGTTTTACATCATGACGGTCTACTCTATGACCTTTAGTACCGCCGCCGCGCCAGTTGGGCTTGGCCTGCCGCGTAACGAAGTGTTGTGGATGTTGATGATGGCAGTTATTGGTTTTGGCGTGATGGTGCCAGTCGCTGGATTAC > NC_000913/3675251‑3675716 | aCGTGCACTGTATGGCTCCTTTCCGCAGCTGGGCGCACCGATTGGCTTCTTCTTTGCCAATGGCACTTTCTTGCTGCTTTCCTGGCTACTGACCGACGAGCAGTTTATGAGCTGGGGCTGGCGTGTGCCATTTATCTTCTCGGCGGTGCTGGTCATTATCGGCCTGTATGTTCGCGTGTCG‑CTGCCTG‑AGTTGCCGGTG‑TTT‑GAGAAA‑GTCGCTAAAGCGCAAAAAAAGGGGAAGATc > 1:1094559/1‑238 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |