| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,145,071 | A→C | 8.8% | Q359H (CAA→CAC) | pflD → | putative glycine radical domain‑containing pyruvate formate‑lyase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,145,071 | 0 | A | C | 8.8% | 505.5 / 3.5 | 186 | Q359H (CAA→CAC) | pflD | putative glycine radical domain‑containing pyruvate formate‑lyase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (105/55); new base C (3/22); total (109/77) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.94e-07 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
CATCATTAACCCAGGGCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCTTGCATGACATCGCGATGTTTAAT > NC_000913/4144839‑4145308 | catTAACCCAGGGCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTc > 1:669536/1‑239 (MQ=255) ttAACCCAGGGCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCg > 1:1614466/1‑238 (MQ=255) ttAACCCAGGGCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCg > 1:1262393/1‑238 (MQ=255) cccAGGGCGAAGATGCGGCGTCCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTg < 2:350608/239‑1 (MQ=255) cAGGGCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTgcg < 1:1224800/239‑1 (MQ=255) gggCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTTCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCCATTACCCCCACCGAACCTCGGCGTgcgc > 2:26014/1‑238 (MQ=255) gggCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTTCCGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCCGCGTgcgc > 2:311223/1‑238 (MQ=255) gggCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTgcgc > 2:510424/1‑238 (MQ=255) gggCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTgcgc > 1:1518860/1‑238 (MQ=255) gggCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTgcgc > 1:1385850/1‑238 (MQ=255) gggCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTAAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCCTGCAATTGCCGCAACCGAACCTCGGGGGGCGCa > 2:1500157/1‑239 (MQ=255) ggCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCGACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTg > 1:488155/1‑234 (MQ=255) ggCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCGACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTg < 2:488155/234‑1 (MQ=255) ggCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑CAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTgcgc > 1:603644/1‑237 (MQ=255) ggCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTgcgcca > 1:511462/1‑237 (MQ=255) ggCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGGgcgc > 1:110642/1‑237 (MQ=255) ggCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGGGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGCCGTgcgc > 1:1285679/1‑237 (MQ=255) gAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTaa < 1:1502156/239‑1 (MQ=255) tGCGGCGGTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGcc < 2:738768/238‑1 (MQ=255) gcggcgTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCGCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCtt < 1:1283262/239‑1 (MQ=255) cggcgTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCt > 1:749096/1‑237 (MQ=255) cggcgTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTg > 2:756762/1‑239 (MQ=255) tccgtaaaGAACTGCTCTAGTCTTTAGGGGTAAATTGCAACGACAGCCGGCTGTTGCGCTCCGCCAGTAGCGCGCGTTTTTTCCCCGGTTTCGCGACCGGCTATACCGCATTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTAAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGGGTGCGCACTAA‑CGCCTTGAACGa < 2:943690/233‑1 (MQ=255) ccTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGCTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTTC‑AGCCTTGATCGac > 1:333693/1‑238 (MQ=255) aCTGCTGGATTCTTTATGGGTGAATTGCAACGCAACCGGGCTGTTGCGCCCCACCGGGAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCCTTGCTCGGCGGGTTAACCGAGACCGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTGGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGACCCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTcc < 2:1357881/239‑1 (MQ=255) aCTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCGCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTTACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTCCCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTc < 1:1556648/238‑1 (MQ=255) cGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGa > 1:1673606/1‑222 (MQ=255) cGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGa < 2:1673606/222‑1 (MQ=255) tATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTg < 2:171032/194‑1 (MQ=255) gTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGaaa > 1:877773/1‑238 (MQ=255) gAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGCTCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCa > 1:894526/1‑239 (MQ=255) aaaTGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCAt > 1:296770/1‑239 (MQ=255) attGCACCGACATCGTTCTGTTGCCCTCCCCCGGTGGCGCGCGTTTTTTCGCGGTTTTCCCGACCGGCTATCCCGCATTGCTCGGGGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATA‑AAGGCGTGCAATTACCGCACCCGAACCTCGGCGTGCCCACTAC‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCAtt < 2:1398730/237‑1 (MQ=255) aTGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGCTCGCCACGCCGTTCCTGATGAAAACCCCCGAAACCAtt > 2:112900/1‑238 (MQ=255) gtCGTGCGGTTGCGCGCCACCGGTGGGCCGGTTAATTCCGCCGGTTCCCCGACGGCCTATACCGCCTTGCTCGGCGGGTTACCCGGGACCGGCCGTAGCGCGGTGACCGGGCTTTCGTTCTTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGAAATTACCGCAACCGACCCGCGGCGTGCGCCCTAC‑CCCCTTGTTCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTAc < 2:859455/238‑1 (MQ=255) tCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTAcc > 1:729736/1‑239 (MQ=255) tGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGt > 2:1503767/1‑239 (MQ=255) tGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTcc > 1:536239/1‑238 (MQ=255) cTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGCCGCAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCATCCGTACCTCCGCCCGCGCCATAA‑CGCCTTGTTCGAAACGCCTCTCCTGTTTAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGGACCCTTATTCCTCaaa > 2:539189/1‑239 (MQ=255) cTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACCCGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCaaa > 2:1236369/1‑239 (MQ=255) aGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGACCCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACg < 1:707646/238‑1 (MQ=255) gcgcgcGTTATTTCGCCGGTCTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGAAGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTCA‑CGCCTTGATCGACACGCCGCTCCTGATGAAAACCGCCGACACCATTCGCCTCGGCACCGGCATTCCGCCAATCTTTCAcaga > 2:1507/1‑236 (MQ=255) gcgcgTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGa > 1:578473/1‑239 (MQ=255) gcgcgTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCCTGATCGACACGCCGGTCCTTATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCCGTACCGGTATTCCGCCAATCTTTAAAGATGa > 2:384830/1‑239 (MQ=255) cgcgTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGCTAACCGAGAACGGTCCTAGCTCGGTGAACGTTCTTTCGTTCCTTTTCCTTTACGGCTTTC‑CAAGCGTGCCATTACCGCAACCGCACCTCTGCGTGCGGCCTAA‑TCCCTTGATACAAACGCCGTTCCTGATTACAACACCCGGAACCATTCTCTTCGGTACCCGTATTCCGGACATCTTTaaacgatc > 2:1104664/1‑232 (MQ=255) gcgTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGTTATACCGCACTGCGCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGTGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGACCCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGaa < 1:1542178/238‑1 (MQ=255) ggttttCCCGCCGGGCTATACCGCACTGCTGGGCGGGTTACCCGAGAACGGACGGCGCGGGGTGAAGTTGCTTTCTTTCCTTTCCCTGAACGCCTACA‑AAGGCTTGAAATTCCCGCACCCGAACCTCGGCGTGCGCCCAAA‑CGCCTTGTTCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAg < 2:415469/236‑1 (MQ=255) cgttttCCCGACCGGCTATCCCGCACTGCTCGGCGGTTTAACCGAGACCGGACGTAGCGGGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTGGCCTTGCCGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTCCCGCACCCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAg < 2:1518860/236‑1 (MQ=255) cGGTTTCCCGACCGGTTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTACCCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAg < 1:1354468/239‑1 (MQ=255) cGGTTGCCCGACCGGCTATCCCGCCTTGCCGGGCGGGTTACCCGAGACCGGACGTGGCGGGGTAAACGTGCTTTCGTTCCTTGGCCTGGACGCCTATA‑AAAGCGTGCAATTCCCGCAACCGAACCCGGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTGAATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAg < 2:638379/239‑1 (MQ=255) cGGTTCCCCGACCGGTTATCCCGACCTGCTCGCGGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCTTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAGGCGTGAAATTCCCGCACCCGAACCTCGGCGTGCGCACTAC‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAg < 2:1001527/239‑1 (MQ=255) tCCCGACGGGCTATACCGCGCTGCTCGGGGGGTTAGCCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTGGCCTTGACGCCTATC‑AAGGCGTGCAATTCCCGCACCGGACCCTCGGCGTCCGCACTAC‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTc < 2:274811/239‑1 (MQ=255) cccggacgtgCTATCCCGCTTTGCTCGGGGGGTTACCCAAGAACGGCCGTAGCGGGGTAACCGTCTTTTGGTCCCTTGCCCTTCCCGCCTACC‑AAGGCGGGAAATTCCCGCACCGGACCCCCGGCGGCCGCCCAAC‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTc < 2:709585/230‑1 (MQ=255) ggCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGAAGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTTATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCg > 1:1005283/1‑239 (MQ=255) ggCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAAAGGTCGTAGCGCAGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGACTTGACGCTTATC‑AAAGCGTGTACTTACCGCAACCGAACCTAGGCGTGCGCAATAA‑CGACTTGATCGACACACCGTTCCTGATGACAACCGCCGAACCCATTCACTTCGGTACCGGTATTCCGCTAATCTTTAACGATGAAGTGGGCGTGCCCTCCTTCCTCAACCg > 2:597589/1‑239 (MQ=255) ataCCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGc > 2:13164/1‑239 (MQ=255) tcccGCACTGCTCGGCGGGTTAGCCGAGACCGGACGTAGCGCGGTTAACGTGCTTTCGTCCCTTTGCCTCGCCGCCTCTC‑AACGCGTGCAATACCCCCACCCGACCCTGGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCg < 2:47352/237‑1 (MQ=255) cACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTc > 1:455393/1‑238 (MQ=255) acgtcTCGGGGGGTTACCAGAGGACGCGCGTAGCGCGGTGAACGTTTTTTCTTTCTTTGGCCGTGACGCCTACC‑AAAGCGTGAATTTCCCGCACCCTAACCTCGGCGTGCGCCCGAC‑CGCTTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGc < 2:1262393/235‑1 (MQ=255) aCTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTc > 1:143622/1‑237 (MQ=255) cTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTc > 1:273591/1‑236 (MQ=255) cTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑CAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACCCCGTTCCTGATGAACACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTCTTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGGGCCACCGTTCCTCAACCGTCGCGTTTCCCCGGa > 2:1566609/1‑239 (MQ=255) cTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGCACCTCGGCGCGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGGCACGCCGTTCCTGCTGAAAACAGCCGACACCATTCGCTTCGGTACCGGCATTCCGCAAATCTTTAACGAGGAAGTGGTGGGGCCAGGGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGa > 2:1385319/1‑239 (MQ=255) cTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCCTTCCCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGAGGTGGGGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGa > 2:1251425/1‑239 (MQ=255) cTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGa > 1:49772/1‑239 (MQ=255) gttaccgcagagCGGAGGTGGCGCGCTGACGATGCTTTCGTCCCTTTGCTGGGCCGTAGATC‑AAAGGGTGAAATTACCGCAACCGATCCGAGGCGGGCGAACGAA‑CCCTTTGATCGACAAGCCGTGCCTGTTGAAAACAGACGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATgcg < 2:1067660/230‑1 (MQ=255) agaCGGACGTAGCGCGGTGCACGGGCTTTCGTTCCTTTGCGTTGACGCCTACA‑AAAGGGGGAAATTGCCCCAACCGACCCCGGGGGGGGACAATAA‑CGCCTTGAGCGGCACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTAtt < 2:1197722/237‑1 (MQ=255) aaaCGGACGTAGCGCGTGGAACGTGCTTTCGTTCCGTTGCCTTGACGCCTATC‑AAGGCGTGCAATTACCGCAACCGACCCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCTTTGCCCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTAtt < 1:1094270/238‑1 (MQ=255) aacgaacgTAGCCGGGTAACCGTGCTTTCGTCCGTTGCCCTTGTGGCTTAGG‑AAGGCTGAAAATTCCCCCACCCGACCCGGAGCGGCCGCACTAC‑CGCTTGGACCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTAtt < 2:333693/238‑1 (MQ=255) aaCGTACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTGGCCTTGACGCCTATC‑AACGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGGGCGCCCTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTAtt < 2:770037/238‑1 (MQ=255) aaCGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCTAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGcc < 2:182794/99‑1 (MQ=255) aaCGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGcc > 1:182794/1‑99 (MQ=255) aCGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTAtt < 1:1236369/237‑1 (MQ=255) aCGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAg > 1:676025/1‑239 (MQ=255) aCGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACATCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAg > 2:911598/1‑239 (MQ=255) aGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAATCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTggg < 1:26014/239‑1 (MQ=255) ggaaaCGGGCTTGCGTTCCTTTGCCTCGACCCCGAGC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCACGGCGGGCGCACAAA‑CGCCTGGAGCGACACGCCGTTCCGGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCtgtg < 2:729736/235‑1 (MQ=255) gTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCtgtgt > 1:1735323/1‑239 (MQ=255) gTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCtgtgt > 2:895755/1‑239 (MQ=255) tcGTGCTTTCG‑TCCTTTGCCCGTACCCCCTCCAAAAGCGTGCAATTCCCGCACCCGACCCTCGCCGTGCGCACAAC‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGa < 2:955737/237‑1 (MQ=255) gtttCTTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAACCGTGCAATTACCGCAACCGAACCGCGG‑GCTCGCCCCAACCGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTAtt < 2:1020600/237‑1 (MQ=255) ttCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATTAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGCAGTGGTGGTGCCATCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGATTTATCTATTc > 1:1714385/1‑238 (MQ=255) ttCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGCGTGGAATTATCTATTc > 1:394920/1‑238 (MQ=255) tctgttGCCTTGACGCCTATC‑AAGGCGTGCAATTGCCGCAACCGAACCTCGCCGTGCGCACAAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTccc < 2:578473/235‑1 (MQ=255) ttGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTCCCGCACCCGAACCTCGGCGTGCGCCCGAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCa < 1:1041901/239‑1 (MQ=255) ttGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCa > 1:1690130/1‑239 (MQ=255) gCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGaaa > 1:685087/1‑99 (MQ=255) gCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGAAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCTTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGaaa < 2:685087/99‑1 (MQ=255) aCGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTAc > 1:419383/1‑239 (MQ=255) ccccTATC‑AAGGCTGGCAATTCCCGCACCGGACCCTCGGCGTGCCCACTAA‑CGCTTTGTCCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACg < 1:563868/237‑1 (MQ=255) cttagc‑AAAGGGTGCAATTCCCGCACCCGAACCTCGGTTGGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACCCGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTGCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGc < 1:1383209/234‑1 (MQ=255) cTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCCGGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGc < 1:835471/238‑1 (MQ=255) tATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTggg > 1:849723/1‑200 (MQ=255) caaaccggccAATTACCGCAACCGAACCACGGCGTCCGACCTAA‑CGCTTTGAGCGACACGCCGTTCCTGAAGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCTTGCa < 2:23631/230‑1 (MQ=255) aGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCTTGCATg > 1:974302/1‑238 (MQ=255) gTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCTTGCATGACa > 1:763847/1‑238 (MQ=255) gCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCTTGCATGACATc > 1:1179374/1‑238 (MQ=255) atttACCGCACCCGACCCCCGGCTTGCCCACAAA‑CGCTGTAATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCTTGCATGACATcgc < 1:1507/236‑1 (MQ=255) aaTTCCCACAACCGAACCGCGGGGTGCGCACTAC‑CGCTTTATGCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCTTGCATGACATcgc < 2:1487455/238‑1 (MQ=255) cAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCCCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCTTGCATGACATCGCGCTGTTTaa > 2:665074/1‑239 (MQ=255) | CATCATTAACCCAGGGCGAAGATGCGGCGTTCCTGAAAGAACTGCTCGAATCTTTATGGGTGAAATGCAACGACATCGTGCTGTTGCGCTCCACCAGTAGCGCGCGTTATTTCGCCGGTTTCCCGACCGGCTATACCGCACTGCTCGGCGGGTTAACCGAGAACGGACGTAGCGCGGTGAACGTGCTTTCGTTCCTTTGCCTTGACGCCTATC‑AAAGCGTGCAATTACCGCAACCGAACCTCGGCGTGCGCACTAA‑CGCCTTGATCGACACGCCGTTCCTGATGAAAACCGCCGAAACCATTCGCTTCGGTACCGGTATTCCGCAAATCTTTAACGATGAAGTGGTGGTGCCAGCGTTCCTCAACCGTGGCGTTTCGCTGGAAGATGCGCGCGACTATTCCGTAGTGGGCTGTGTGGAATTATCTATTCCCGGCAGAACCTACGGCTTGCATGACATCGCGATGTTTAAT > NC_000913/4144839‑4145308 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |