| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,258,996 | T→G | 19.1% | V69G (GTG→GGG) | ychH → | DUF2583 family putative inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,258,996 | 0 | T | G | 19.1% | 137.5 / 2.5 | 77 | V69G (GTG→GGG) | ychH | DUF2583 family putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (26/32); new base G (14/3); total (42/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.14e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGTTACAACCCAGAAAGTTCCGGAGGTGACATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑CGCCGCGCGACGATTCGGGAAGAAC‑GCCAGGCGTCCCGGGATCGGTTGAATGCCAGCGCGAGCCATAGTGCGCAGTGGCTGGAATTCCACGT > NC_000913/1258759‑1259230 | tGTTACAACCCAGAAAGTTCCGGAGGTGACATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGgtg > 1:534794/1‑239 (MQ=255) aCAACCCAGAAAGTTCCGGAGGTGACATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCg < 1:1079584/239‑1 (MQ=255) ccAGAAAGTTCCGGAGGTGACATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGt < 1:1088239/239‑1 (MQ=255) aaGTTCCGGAGGTGACATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACtg < 1:663459/239‑1 (MQ=255) ccGGAGGTGACATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATTAACAGGGGGGCGACCGTTTCTTGTggg > 1:920072/1‑239 (MQ=255) ccGGAGGTGACATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTggg < 2:173120/239‑1 (MQ=255) ccGGAGGTGACATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGGGCCCGTGTTTGCGGGCATACACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTggg > 2:377152/1‑239 (MQ=255) gACATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGGCCGGGTTGGGGGGCCTGGACCGGGGGGCGGCCCTTACTGGGGGGGTCGCCa > 2:1104103/1‑238 (MQ=255) cAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGGTGGGGGGGATGATAAGGTGTGCGGCCCGTACTGGGGGGTTCGCCGCTAGGAC‑AAACGtt > 2:607504/1‑239 (MQ=255) gcttctgtgtgcGGTAACGTGCTCAGGGGGTTGGGTCTGGTGGTAAGGGTGGTCGGCGTGGGTTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACGGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCAGGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGccgccg < 2:527561/228‑1 (MQ=255) taggTAACGTGCTCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCTTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAAt < 1:210010/237‑1 (MQ=255) ggTAACGTGCTCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTTGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATc > 1:1026935/1‑238 (MQ=255) tGCTCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGGACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGGTCGCCACTATGAA‑AAACGTTGCCGCCGCAGCGATAATCGCCGTCAt > 1:908493/1‑239 (MQ=255) tCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGAACGTTACTGGGGGGGTCGGCACTATGAC‑AACAGTTTTCGCCGAAGCGCAAATCGcccgcaca > 1:253881/1‑231 (MQ=255) aTGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGGGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGGTCGCCACTCTGGC‑AAAACTTGCCGCCGTAGCGCTAATCGCCGTCATatcca > 2:594647/1‑235 (MQ=255) ggggTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGGCCGTTACTGGTGGGGTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGGTGCGATCATCGCCGTCATAGCTAAc > 1:327814/1‑239 (MQ=255) gggTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTa < 2:380776/236‑1 (MQ=255) tGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAaata < 1:127448/239‑1 (MQ=255) gggTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGGTAATCGCCGTCATAGCTAACAaataa > 1:1227233/1‑239 (MQ=255) cTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGc < 1:207940/238‑1 (MQ=255) ggtggtAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGGCCGGGGTGGCAGGGATGAAACGGGGTGCGGCCGGTTATGGGGGGGTCGCCACAAGGTCAAAACGTGGCCGCC‑TAGCGGTAAACCACGCCGTAGCTAacaaacaaatcaga > 2:602891/1‑233 (MQ=255) gtAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGc < 1:523981/174‑1 (MQ=255) tggtCGGCGTGGGGGATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCAAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGGGGCCCTGCTTGCGGGCATGAACCGGGGGGCGACCTGTAATGGTTGGCTCGCCACTATGAC‑AAAAGTTTCCCCCGGCGCGCTAACTTCCGGTACAGGTAACAACTAAAGCAG‑tcgtctggtcag > 2:98850/1‑228 (MQ=255) ggtCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACcag < 1:1029458/238‑1 (MQ=255) ggtCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGGGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGGGTGCGACCGTTACTGGTGGGGTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAAAAAAGCAG‑TTTTCTGACcag > 1:1192242/1‑238 (MQ=255) gtCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGGGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTTGCCACTTTGAC‑CAACGTTGACGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAAAAAATAATGCAG‑TTTGCTGACcagtc > 1:571937/1‑239 (MQ=255) ggCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTATCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGGATGAACAGGGGGGCGGCCGTTACTGGTGGGGTCGCCACTTTGAA‑AAACGTTGACGCCCGAGCGATAAATGCCGTCACAGCTAACAAAAAAGTCGG‑TTTGCttgcccagccgg > 2:810781/1‑228 (MQ=255) tGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCg > 1:261164/1‑193 (MQ=255) tGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCg < 2:261164/193‑1 (MQ=255) tgggTATTCATTCCTCAACCAGTGTCCATATTTTAATATGCCCCTGTATTTCGCTCATGTTGCAGTTCTAAGTATTATGGGCGGTGCCTTTCTCCGTCTTGC‑GGGTGTCCGTGTTGGCGGGCTTGAACAGGGGTGCCGCCGTTACTGGTGGGTGCGCCGCTATTAC‑AAACGTAGCCGCCCTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAAGGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTgc < 2:685690/237‑1 (MQ=255) gTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCt < 2:840785/238‑1 (MQ=255) gTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCGGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCt < 1:80949/238‑1 (MQ=255) actCAATCCTCAACCATTTACCACATTTTAATATGCCCCAGTATTTAGCACAGGGTGCAGTGCAAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCAGGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCAACTATGAG‑AAGCGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAGTAATGCAG‑TCTGCTGACCAGTCAGTGTGCGCTGa < 2:746201/236‑1 (MQ=255) aaTCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGt < 2:820283/239‑1 (MQ=255) aaTCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGGGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGt < 2:181735/239‑1 (MQ=255) tCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAAACGGGGTGCGGCCGTTACTGGGGGGTTCGCCACTATGAC‑ACACGTTGCCGCCGTAACGTTAATCCCCGTCCCAGCCTACAAATAATGCAG‑GTTGCTGCCCAACCCGTTTGCGCTGACCTGTCa > 2:767769/1‑239 (MQ=255) tCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCaa > 1:401999/1‑237 (MQ=255) aaCCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGGGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGGTAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTTCTGACCAGTCCGGTTGCGCTGACTGGGCAAtctc > 1:1156809/1‑239 (MQ=255) gTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAAAAGGTGTGCGGCCGTTACTGGTGGGGTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGGCGCCCTAGCGGTAATCGCCGGCATAGCTAAAAAATAAAGCAGTTTTGTTGCCCAGT‑AGTTTGCGCTGACTGGGCCATCCCgga > 2:347945/1‑235 (MQ=255) tACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACt < 1:969706/237‑1 (MQ=255) gTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGGCCGGGTTGGCGGGCATGAACAGGGGTGCGGCCGGTTCTGGGGGGGTCGCCCCTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGGAGCGGTAATTGCCCGCATAGCTTACAAATAATGCAG‑TTTGCTGTCCAGGCAGTTTGGGCTGGCTGGTGAATATCTGACTTTTAAATc > 2:718775/1‑238 (MQ=255) cccAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGCGGGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑cgcc > 1:392383/1‑238 (MQ=255) cccAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑cgccg > 1:523533/1‑238 (MQ=255) cccAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGGGGCCGGGTTGGCGGGGATTAACAGGGGTGCGACCGTTTATGGTGGGGTCGCCACTAAGAA‑CAAAGTTGCCGCCGGAGCGAGAAACGCCGGGCCAGCTAACAAATAATACCG‑TTTTCTGACACACCAATATGCGCTGGATGGGCAAACTCGCACTTGGAAATCCACCAC‑caccg > 2:295830/1‑238 (MQ=255) cccAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGGGCCCCTGTTGGCGGGCCTGAACCGGTGTGCGGCCGTTACTGGTGGGTTCGCCCCCATGAC‑AAACGGTGCCGCCCTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTTCTGACCAGTCAGTTTTCGGTCACTTGTCAATCTCGTACTTTTAAAACCCCCCT‑cccccc > 2:113632/1‑237 (MQ=255) aTTTCGCACATGGTGCGGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑CGCCGCGcgac < 2:633972/238‑1 (MQ=255) aTTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑CGCcgcgcg < 2:534794/236‑1 (MQ=255) aTGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGGGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCCTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTTACTGGGCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑CGCCGCGCGACGATTCGGgaa > 1:277615/1‑239 (MQ=255) gCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑CGCCGCGCGACGATTCGGGAAGAAC‑GCCAgg < 1:605446/239‑1 (MQ=255) aGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑CGCCGCGCGACGATTCGGGAAGAAC‑GCCACGCGt > 1:70804/1‑238 (MQ=255) aGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGGTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGGCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGATTGCGCTGACTGGGCAATCTCGTACTTATAAATACGCCAT‑CGCCGCGCGACGATTCGGGAAGAAC‑GCCAGGCgg > 1:1085777/1‑237 (MQ=255) aGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGGGGGGTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGGTAATCCCCGCCATATCTAAAAAAAAATGCAG‑TTTTCTGGCCAGTAAGGTTTCGCCGGCTGGGCAATCTCGTACTTCTTAATCCCCCAA‑CCCCCCGCCACGGATCGGGGAAGAC‑Gcccagccg > 2:975333/1‑232 (MQ=255) aGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGCGTGCGACCGTTACTGGGGGGGTCGCCCCTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGGAGCGATAATGGCCGGCCTAGCTAACAACTTAAACCG‑ATTGCTGACCCAGCAGTTTGCCCTGACTGGGCAATCTCGCACCTTAAAATCCGCCCTACGCCGCCGGCGGATGCGGG‑AGAAC‑Gcccgtggg > 2:571497/1‑232 (MQ=255) aGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGCGGGCGACCGGTACTGGTGGGTTCGCCCCTATGAC‑AAACGCTGCCGCCGCAGCGACAATCTCCGTCTTACCTAACAAATAATGAAG‑TTTTCTGCCCAGACACTTTGCGCTGACTGGGCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCCT‑CGCCGCGCGACGAATCGGGCAAAAC‑GCCAcgcgc > 2:399889/1‑237 (MQ=255) aGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGGGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAAAGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGGCCTAGCTAAAAAATAAAGCAG‑TTTGCTGACCAGTACGTTTGCGCTTACTGGTCAATCTCGTACTTTTAAATCCGCCCT‑CCCCCCGCGCCAGTTCGGGGAGGAA‑GCCAGGCGt > 2:888734/1‑238 (MQ=255) aGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGGGCCCGGGTTGGGGGGGATGAAGAGGTGGGCGACCGTTACTGGGGGGTTGGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGGAGCGATAATCTGCGTCATAGCCAACACAGCATGGAA‑GTTGCTGACCAGGTAGGTTTCGGTGACTGGGCAAATTCGTCCTTATAAATCCGCCAA‑CGCCGCGCGAGGAGTTGGGGAGTAc‑ccccgagcg > 2:1125457/1‑232 (MQ=255) aGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGGGCCCGGGTTGGCGGGCATGAACCGGGGTGCGGCCGTTTCTGGGGGGGTTGCCCCTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGCAGCGATAATCGCCGTCATAGGTCAAAAATAATGGCG‑TTTTGCGACCAGGCAGTTTTCGCTGACTGGGTACACTCGTCATTATAAATCACCCAC‑CGCCCCGCGACGCTTCTGGGAGAAC‑CCCCGGCGt > 2:97874/1‑238 (MQ=255) tttCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGGCCGTTACTGGTGGGGTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGGCAATCTCGTACTTATAAAACCGCCAT‑CGCCGCGCGACGATTTGGGAAGAAA‑GCCCGGCGGCCCggg > 2:71934/1‑239 (MQ=255) tttCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGGTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGGAGCGATAATCGCCGTCCTAGCTAACAAAAAATGCAG‑TTTGCTGGCCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑CGCCGCGCGCCGACTCGGGGAGAAC‑GCCAGGCGTCCCcgg > 2:84326/1‑239 (MQ=255) tttCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGGGCCCGTGTTGGCGGGCCTGAAAAGGTGGGCGAACGTTACTGGTGGGGTTGCCCCTATGAC‑AAAAGGTGCCGCCGGAGGGATAATTGGCGTCCTAGCTAACAAATTATGCAG‑TTTGGTGACCAGGCAGTTTGCGCTGACTGGTCACTCTCGGCCTTTTAAATCCGCACT‑CCCCGCGCGACGGTTCGGGAAGAACGGCCAGG‑GTTCCggg > 2:1060947/1‑239 (MQ=255) tcgtcgGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑CGCCGCGCGACGCTTCCGGAAGAAC‑GCCCGGCGTCCCgggg > 1:1024427/1‑237 (MQ=255) ggTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑CGCCGCGCGACGATTCGGGAAGAAC‑GCCAGGCGTCCCGGGATCGGtt < 1:768997/239‑1 (MQ=255) ggTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGGGTGCGACCGTTACTGGGGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGGTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑CGCCGCGCGACGATTCGGGAAGAAC‑GCCAGGCGTCCCGGGATCGGtt > 1:1222270/1‑239 (MQ=255) tGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTTGCGGGCCTGAAAAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGGTCGCCCCTATGAC‑AAAAGTTGCCGCCGCAGGGAAAATCGCCGGCAGAGGTAACAAAAAATACAG‑GTTGGTGGCCAGCCAGTTTGCCCCGACTGGTCAATATCGTACTTTTAAAACCGCCCT‑CGCCGCGCGGCGGTTCGGGGAGACC‑GCCCCGCGGCCCGGGATCGGGTgg > 2:406783/1‑238 (MQ=255) tctcTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTGGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑CGCCGCGCGACGATTCGGGAAGAAC‑GCCAGGCGTCCCGGGATCGGTTGAATGCCa < 2:1192242/239‑1 (MQ=255) tctGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑CGCCGCGCGACGATTCGGGAAGAAC‑GCCAGGCGTCCCGGGATCGGTTGAATGCCAgc < 1:210707/239‑1 (MQ=255) tctGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑CGCCGCGCGACGATTCGGGAAGAAC‑GCCAGGCGTCCCGGGATCGGTTGAATGCCAgc < 1:858322/239‑1 (MQ=255) tctGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑CGCCGCGCGACGATTCGGGAAGAAC‑GCCAGGCGTCCCGGGATCGGTTGAATGCCAgc < 1:1062067/239‑1 (MQ=255) tctGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGGGTGCGACCGTTACTGGGGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑CGCCGCGCGACGATTCGGGAAGAAC‑GCCAGGCGTCCCGGGATCGGTTGAATGCCAgc < 2:401999/239‑1 (MQ=255) ctggctggCGGGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑CGCCGCGCGACGATTCGGGAAGAAC‑GCCAGGCGTCCCGGGATCGGTTGAATGCCAgc < 2:392383/239‑1 (MQ=255) gTGCCCGGGTTGGCGGGCATGAACAGGGGTGCGACCGTTACTGGTGGGGTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCCCGTACTTATAAATCCGCCCT‑CCCCGCGCGACCAATCGGGAAGAAC‑GCCCGGCGTCCCGGGGTCGGTTGAATGCCACGCCGAGCCacaat > 2:470169/1‑235 (MQ=255) ccGTGTGGGGGGGCAGTAACAGGTGTGCGCCCGTTACGGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑CGCCGCGCGACGATTCGGGAAGAAC‑GCCAGGCGTCCCGGGATCGGTTGAATGCCAGCGCGAGCCATAGTgcgc < 2:1156809/239‑1 (MQ=255) gtTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑CGCCGCGCGACGATTCGGGAAGAAC‑GCCAGGCGTCCCGGGATCGGTTGAATGCCAGCGCGAGCCATAGTGCGCAGTg > 1:844323/1‑239 (MQ=255) tGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑CGCCGCGCGACGATTCGGGAAGAAC‑GCCAGGCGTCCCGGGATCGGTTGAATGCCAGCGCGAGCCATAGTGCGCAGTGGc < 1:232445/239‑1 (MQ=255) tGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑CGCCGCGCGACGATTCGGGAAGAAC‑GCCAGGCGTCCCGGGATCGGTTGAATGCCAGCGCGAGCCATAGTGCGCAGTGGc < 1:325441/239‑1 (MQ=255) tGGCGGGATTGAACAGGGGTTCTACCGTTACTGGGGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑CGCCGCGCGACGATTCGGGAAGAAC‑GCCAGGCGTCCCGGGATCGGTTGAATGCCAGCGCGAGCCATAGTGCGCAGTGGc < 2:1227233/239‑1 (MQ=255) aTGAACAGGTGTGCGACCTTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑CGCCGCGCGACGATTCGGGAAGAAC‑GCCAGGCGTCCCGGGATCGGTTGAATGCCAGCGCGAGCCATAGTGCGCAGTGGCTGGAATTc < 1:602891/239‑1 (MQ=255) aaGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGTTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑CGCCGCGCGACGATTCGGGAAGAAC‑GCCAGGCGTCCCGGGATCGGTTGAATGCCAGCGCGAGCCATAGTGCGCAGTGGCTGGAATTCCACGt < 2:277615/238‑1 (MQ=255) | TGTTACAACCCAGAAAGTTCCGGAGGTGACATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGC‑GGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGAC‑AAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAG‑TTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCTCGTACTTATAAATCCGCCAT‑CGCCGCGCGACGATTCGGGAAGAAC‑GCCAGGCGTCCCGGGATCGGTTGAATGCCAGCGCGAGCCATAGTGCGCAGTGGCTGGAATTCCACGT > NC_000913/1258759‑1259230 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |