| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2883761 | 57 (0.980) | 3 (0.050) | 3/510 | NT | 5.0% | coding (378/1509 nt) | casA | CRISP RNA (crRNA) containing Cascade antiviral complex protein |
| ? | NC_000913 | = 2883892 | 59 (1.030) | coding (247/1509 nt) | casA | CRISP RNA (crRNA) containing Cascade antiviral complex protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATAGACTCATTGGACTTGATAGGTTTAATCCAGGTAGGTTGGTTTTCCGTATGTGATTCATTAGGAAATTGTTTTTGAAGACGAGGTAATGTGAGGACATTGAGTAACACCGTTGAACGAAGATCGATCCCACGTACGAACGTTGTTACAGGTGTTCCTCCACGTAAACCGCTTTTAAAACCACCACCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAGCGGATTCATTATGCGATGTCGAAATTCAACGTCATCTTTTGCCGGGGCGATAATTTGCCCAATGCAAACCAGCAGTGCTAAAGCGGCCAGTTCCATATCGTCACGGGGCAAACTTAATCGCCACTGATCTCTA > NC_000913/2883477‑2884049 | ataGACTCATTGGACTTGATAGGTTTAATCCAGGTAGGTTGGTTTTCCGTATGTGATTCATTAGGAAATTGTTTTTGAAGACGAGGTAATGTGAGGACATTGAGTAACACCGTTGAACGAAGATCGATCCCACGTACGAACGTTGTTACAGGTGTTCCTCCACGTAAACCGCCTTTAAAACCACCACCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATtcg > 2:406088/1‑289 (MQ=255) 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gtaggtTGGTTTTCCGTATGTGATTCATTAGGAAATTGTTTTTGAAGACGAGGTAATGTGAGGACATTGAGTAACACCGTTGAACGAAGATCGATCCCACGTACGAACGTTGTTACAGGTGTTCCTCCACGTAAACCGCTTTTAAAACCACCACCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCa > 2:98281/1‑289 (MQ=255) tttgttTTCCGGATGTGATTCATTAGGAAATTGTTTTTGAAGACGAGGTAATGTGAGGACATTGAGTAACACCGTTGAACGAAGATCGATCCCACGTACGAACGTTGTTACAGGTGTTCCTCCACGTAAACCGCTTTTAAAACCACCACCAAAACCTGGTGACTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTg < 2:517782/284‑1 (MQ=255) aTTCATTAGGAAATTGTTTTTGAAGACGAGGTAATGTGAGGACATTGAGTAACACCGTTGAACGAAGATCGATCCCACGTACGAACGTTGTTACAGGTGTTCCTCCACGTAAACCGCTTTTAAAACCACCACCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCttt > 2:481533/1‑289 (MQ=255) tAGGAAATTGTTTTTGAAGACGAGGTAATGTGAGGACATTGAGTAACACCGTTGAACGAAGATCGATCCCACGTACGAACGTTGTTACAGGTGTTCCTCCACGTAAACCGCTTTTAAAACCACCACCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACCTCATTTGCTTTGaca > 1:237023/1‑287 (MQ=255) gttggAAGACGAGGTAATGTGAGGACATTAAGTAAAACCGTTGAACGAAGATCGATCCCACGTACGAACGTTGTTACAGGTGTTCCACCACGTAAACCGCTTTTTAAACCACCACCAAAATCTTGTGCCTGATTCTCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGACTGCa < 2:358175/285‑1 (MQ=255) ttGAAGACGAGGTAATGTGAGGACATTGAGTAACACCGTTGAACGAAGATCGATCCCACGTACGAACGTTGTTACAGGTGTTCCTCCACGTAAACCGCTTTTAAAACCACCACCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATa < 2:460806/289‑1 (MQ=255) 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aCATTGAGTAACACCGTTGAACGAAGATCGATCCCACGTACGAACGTTGTTACAGGTGTTCCTCCACGTAAACCGCTTTTAAAACCACCACCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTa < 1:481533/288‑1 (MQ=255) aTTGAGTAACACCGTTGAACGAAGATCGATCCCACGTACGAACGTTGTTACAGGTGTTCCTCCACGTAAACCGCTTTTAAAACCACCACCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAgg < 2:152100/289‑1 (MQ=255) aaCACCGTTGAACGAAGATCGATCCCACGTACGAACGTTGTTACAGGTGTTCCTCCACGTAAACCGCTTTTAAAACCACCACCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGaa < 1:188804/287‑1 (MQ=255) 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aaTCGAAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAGCGGATTCATTATGCGATGTCGAAATTCAACGTCATCTTTTGCCGGGGCGATAATTTGCCCAATGCAAACcag < 1:110082/288‑1 (MQ=255) tCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAGCGGATTCATTATGCGATGTCGAAATTCAACGTCATCTTTTGCCGGGGCGATAATTTGCCCAATGCAAACCAGCAGTGCTAAAGCg > 1:52361/1‑289 (MQ=255) caccacATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAGCGGATTCATTATGCGATGTCGAAATTCAACGTCATCTTTTGCCGGGGCGATAATTTGCCCAATGCAAACCAGCAGTGCTAAAGCGGc < 1:206623/289‑1 (MQ=255) caccacATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAGCGGATTCATTATGCGATGTCGAAATTCAACGTCATCTTTTGCCGGGGCGATAATTTGCCCAATGCAAACCAGCAGTGCTAAAGCGGc < 2:389655/289‑1 (MQ=255) ccacATAATGCTTCACCCTGCTCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGTGTGATAAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACCCATCTTCAGTGAGCGGTTTCATTATGCGATGTGGAATTTCAACGTCATCTTTTGCAGGGGCGTTAATTCGCCCATTGCAAACCAGCCGTGCTAAAGCGGcta > 2:84989/1‑287 (MQ=255) aaTGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAGCGGATTCATTATGCGATGTCGAAATTCAACGTCATCTTTTGCCGGGGCGATAATTTGCCCAATGCAAACCAGCAGTGCTAAAGCGGCCAGTTCCa > 1:453858/1‑289 (MQ=255) cACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTTGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAGCGGAt < 1:200413/192‑1 (MQ=255) cACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTTGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAGCGGAt > 2:200413/1‑192 (MQ=255) attgaCAAATGCCCAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCCGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAGCGGATTCATTATGCGATGTCGAAATTCAACGTCATCTTTTGCCGGGGCGATAATTTGCCCAATGCAAACCAGCAGTGCTAAAGCGGCCAGTTCCATATCGTCACGGGGCAAACTTAAt < 1:437308/289‑1 (MQ=255) gaCAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAGCGGATTCATTATGCGATGTCGAAATTCAACGTCATCTTTTGCCGGGGCGATAATTTGCCCAATGCAAACCAGCAGTGCTAAAGCGGCCAGTTCCATATCGTCACGGGGCAAACTTAATCGc < 1:323947/289‑1 (MQ=255) cAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAGCGGATTCATTATGCGATGTCGAAATTCAACGTCATCTTTTGCCGGGGCGATAATTTGCCCAATGCAAACCAGCAGTGCTAAAGCGGCCAGTTCCATATCGTCACGGGGCAAACTTAATCGCCa < 2:52361/289‑1 (MQ=255) gCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAGCGGATTCATTATGCGATGTCGAAATTCAACGTCATCTTTTGCCGGGGCGATAATTTGCCCAATGCAAACCAGCAGTGCTAAAGCGGCCAGTTCCATATCGTCACGGGGCAAACTTAATCGCCACTGAt < 2:195185/289‑1 (MQ=255) caATTCCTGGCCCCGCTTAGCCCAGTCAACAGTTTTTCCACTTGAGTCACATCATCTGCTTGAAGACCTTTGGTGTGCATAAAGGGAAGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAGCATATCTATCCACGGTGTGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAGCGGCTTCATTATGCGCTGTCGAAATTCAACGTCAGGTTTTGCCGGGGCGATAATTTGCCCAATGCAAAACAGCAGTGCTAAAGCGGCCAGTTCCATATCGTCACGGGGCAAACTTAATCGCCACTGAtctc < 2:500367/289‑1 (MQ=255) aTTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAGCGGATTCATTATGCGATGTCGAAATTCAACGTCATCTTTTGCCGGGGCGATAATTTGCCCAATGCAAACCAGCAGTGCTAAAGCGGCCAGTTCCATATCGTCACGGGGCAAACTTAATCGCCACTGATCTCTa < 1:13678/289‑1 (MQ=255) | ATAGACTCATTGGACTTGATAGGTTTAATCCAGGTAGGTTGGTTTTCCGTATGTGATTCATTAGGAAATTGTTTTTGAAGACGAGGTAATGTGAGGACATTGAGTAACACCGTTGAACGAAGATCGATCCCACGTACGAACGTTGTTACAGGTGTTCCTCCACGTAAACCGCTTTTAAAACCACCACCAAAACCTGGTGCCTGATTCGCCTGGTTGAATAACGCAATCGCAGTGCATCCACCACATAATGCTTCACCCTGCCCCGGTTGATTGACAAATGCACAATTCGTCGCGCCGCTTACCCCAGCCAACAGTTTTTCCATTGGAGTCACATCATTTGCTTTGACACCTTTGGTCTGCATAAAGGGATGTTCTGCGTGATTAAGGTAGAACATATCTATCCACGGCGCGATGAGTTGTTGAAACTCATCTTCAGTGAGCGGATTCATTATGCGATGTCGAAATTCAACGTCATCTTTTGCCGGGGCGATAATTTGCCCAATGCAAACCAGCAGTGCTAAAGCGGCCAGTTCCATATCGTCACGGGGCAAACTTAATCGCCACTGATCTCTA > NC_000913/2883477‑2884049 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |