| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,110,159 | IS2 (–) +5 bp | 32.3% | coding (825‑829/1536 nt) | opgG → | OPG biosynthetic periplasmic beta‑1,6 branching glycosyltransferase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1110159 = | 42 (0.740) | 12 (0.210) | 12/516 | NT | 21.9% | coding (825/1536 nt) | opgG | OPG biosynthetic periplasmic beta‑1,6 branching glycosyltransferase |
| ? | NC_000913 | = 1469240 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1110163 | 42 (0.740) | 28 (0.480) | 24/516 | NT | 39.5% | coding (829/1536 nt) | opgG | OPG biosynthetic periplasmic beta‑1,6 branching glycosyltransferase |
| ? | NC_000913 | = 1651548 | NA (NA) | noncoding (706/706 nt) | IS2 | repeat region | |||||
CGGGTGAAGAATTTCCGCGCTTCAAAGAGTTCTGGATCGAGCGTCCAAAACCGACTGATAAACGTTTAACCATCTATGCATTGCTTGACTCGCCGCGTGCGACAGGTGCTTACAAATTCGTGGTTATGCCAGGGCGTGACACGGTTGTGGATGTGCAGTCGAAAATCTATCTGCGCGATAAAGTCGGCAAACTGGGGGTTGCACCGTTAACCAGTATGTTCCTGTTTGGGCCGAACCAACCGTCGCCTGCAAATAACTATCGTCCGGAGTTGCACGACTCTAACGGTCTCTCTATCCATGCCGGTAATGGCGAATGGATCTGGCGTCCGTTGAATAACCCGAAACATTTAGCGGTCAGCAGCTTCTCCATGGAAAACCCGCAAGGCTTTGGTCTGTTGCAGCGCGGTCGTGATTTCTCCCGCTTTGAAGATCTCGATGATCGTTACGATCTCCGTCCAAGCGCATGGGTGACTCCGAAAGGGGAGTGGGGTAAAGGCAGC‑GTTGAGCTGGTGGAAATTCCAACCAACGATGAAACCAACGATAACATCGTCGCTTACTGGAC > NC_000913/1109876‑1110437 | tccggcggcgacagcagtaagacttccttcctggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctgtagattcagggggccagtctaCGGtct > 1:24300‑M1/284‑289 (MQ=255) tttCCGCGCTTCAAAGAGTTCTGGATCGAGCGTCCAAAACCGACTGATAAACGTTTAACCATCTATGCATTGCTTGACTCGCCGCGTGCGACAGGTGCTTACAAATTCGTGGTTATGCCAGGGCGTGACACGGTTGTGGATGTGCAGTCGAAAATCTATCTGCGCGATAAAGTCGGCAAACTGGGGGTTGCACCGTTAACCAGTATGTTCCTGTTTGGGCCGAACCAACCGTCGCCTGCAAATAACTATCGTCCGGAGTTGCACGACTCTAACGGTCtggatttgcccc < 1:449226‑M1/289‑13 (MQ=255) ttCAAAGAGTTCTGGATCGAGCGTCCAAAACCGCCTGATAAACGTTTAACCATCTATGCATTGCTTGACTCGCGGCGTGCGACAGGTGCTTACGAATTCGTGGTTATGCCAGGGCGTGACACGGTTGTGGATGTGCAGTCGAAAATCTATCTGCGCGATAAAGTCGGCAAACTGGGGGTTGCACCGTTAACCAGTATGTTCCTGTTTGGGCCGAACCAACCGTCGCCTGCAAATAACTATCGTCCGGAGTTGCACGACTCTAACGGTCTCTCTATCCATGCCGGTAATg < 2:241913/289‑1 (MQ=255) agagTTCTGGATCGAGCGTCCAAAACCGACTGATAAACGTTTAACCATCTATGCATTGCTTGACTCGCCGCGTGCGACAGGTGCTTACAAATTCGTGGTTATGCCAGGGCGTGACACGGTTGTGGATGTGCAGTCGAAAATCTATCTGCGCGATAAAGTCGGCAAACTGGGGGTTGCACCGTTAACCAGTATGTTCCTGTTTGGGCCGAACCAACCGTCGCCTGCAAATAACTATCGTCCGGAGTTGCACGACTCTAACGGTCTCTCTATCCATGCCGGTAATGGCGaa < 2:141551/289‑1 (MQ=255) tggtattgcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCGGTCTCTCTATCCATGCCGGTAATGGCGAATGGa < 2:317031‑M1/35‑1 (MQ=255) gcttacgccagagaaataactggctggctgctacaccatgttgccgggcaacgagggagaccgtcatccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCGGTCTCTCTATCCATGCCGGTAATGGCGAATGGATCTGGCGt < 1:101706‑M1/43‑1 (MQ=255) aGCGTCCAAAACCGACTGATAAACGTTTAACCATCTATGCATTGCTTGACTCGCCGCGTGCGACAGGTGCTTACAAATTCGTGGTTATGCCAGGGCGTGACACGGTTGTGGATGTGCAGTCGAAAATCTATCTGCGCGATAAAGTCGGCAAACTGGGGGTTGCACCGTTAACCAGTATGTTCCTGTTTGGGCCGAACCAACCGTCGCCTGCAAATAACTATCGTCCGGAGTTGCACGACTCTAACGGTCtggatttgcccctatctttccagacatcctttatcactta > 2:208004‑M1/1‑249 (MQ=255) 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catccccggttcaaagctctgctgaacaattgcgatcttttcctgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaCGGTCTCTCTATCCATGCCGGTAATGGCGAATGGATCTGGCGTCCGTTGAATAACCCGAAACATTTAGCGGTCAGCAGCTTCTCCATGGaaa > 2:31038‑M1/182‑273 (MQ=255) gggcgtACCAATTCGTGGGTATGCCAGGGCGTGACACGGTTGTGGATGTGCAGTCGAAAATCTATCTGCGCGATAAAGTCGGCAAACTGGGGGTTGCACCGTTAACCAGTATGTTCCTGTTTGGGCCGAACCAACCGTCGCCTGCAAATAACTATCGTCCGGAGTTGCACGACTCTAACGGTCTCTCTATCCATGCCGGTAATGGCGAATGGATCTGGCGTCCGTTGAATAACCCGAAACATTTAGCGGTCAGCAGCTTCTCCATGGAAAACCCGCAAGGCTTTGGt < 2:142535/282‑1 (MQ=255) tGCTTACAAATTCGTGGTTATGCCAGGGCGTGACACGGTTGTGGATGTGCAGTCGAAAATCTATCTGCGCGATAAAGTCGGCAAACTGGGGGTTGCACCGTTAACCAGTATGTTCCTGTTTGGGCCGAACCAACCGTCGCCTGCAAATAACTATCGTCCGGAGTTGCACGACTCTAACGGTCtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcg < 1:68148‑M1/285‑104 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |