| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 234,230 | T→C | 9.7% | I185V (ATA→GTA) | gloB ← | hydroxyacylglutathione hydrolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 234,230 | 0 | T | C | 9.7% | 126.4 / 3.6 | 41 | I185V (ATA→GTA) | gloB | hydroxyacylglutathione hydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (20/17); new base C (2/2); total (22/19) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
TTTTGCCTTCATGTGTGTGTCAATAGTTGCTTAAAAGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTACGATAATAATCATTTATGGACAAATCGTGCGGAAGAATACTCAAAGCAAACTTCATATTTGATAAGGTATATTCATGAGCACAACATACCAATGTATCGTCAGGTAACGCACTTAACTTTTTAAGTGATTGATACATTTGTGATGCTGTCCCTTCAAACAACCGACCACACCCACCAGAAAACAGTGTGTCGCCGCAAAATAGATAAGGTTTACTGAAGTAACAGATATGTCCTAAAGTGTGACCCGGCGTAGCAATTACACTAAATTCATGCCCCAAAACGAAGGCAGTTTCGCCATCTTT > NC_000913/233944‑234515 | ttttGCCTTCATGTGTGTGTCAATAGTTGCTTAAAAGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTACGATAATAATCATTTATgg > 1:36896/1‑289 (MQ=255) 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TTTTGCCTTCATGTGTGTGTCAATAGTTGCTTAAAAGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTACGATAATAATCATTTATGGACAAATCGTGCGGAAGAATACTCAAAGCAAACTTCATATTTGATAAGGTATATTCATGAGCACAACATACCAATGTATCGTCAGGTAACGCACTTAACTTTTTAAGTGATTGATACATTTGTGATGCTGTCCCTTCAAACAACCGACCACACCCACCAGAAAACAGTGTGTCGCCGCAAAATAGATAAGGTTTACTGAAGTAACAGATATGTCCTAAAGTGTGACCCGGCGTAGCAATTACACTAAATTCATGCCCCAAAACGAAGGCAGTTTCGCCATCTTT > NC_000913/233944‑234515 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |