| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 129 total aligned reads displayed.
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cTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGAATTTGCGATGCGCGGGAACGTGGTGGATTTGGCGGTGGGTGTCATTATCGGTGCGGCATTCGGGAAGATTGTCTCTTCACTGGTTGCCGATATCATCATGCCTCCTCTGGGCTTATTAATTGGCGGGATCGATTTTAAA‑CAGTTTGCTGTCACGCTACGCGATg < 1:351195/238‑1 (MQ=255) ttAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGTATTTCGCGAATTTGCGATGCGCGGGAACGTGGTGGATTTGGCGGTGGGTGTCATTATCGGTGCGGCATTCGGGAAGATTGTCTCTTCACTGGTTGCCGATATCATCATGCCTCCTCTGGGCTTATTAATTGGCGGGATCGATTTTAAA‑CAGTTTGCTGTCACGCTACGCGATgcg < 1:882174/239‑1 (MQ=255) tAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGAATTTGCGATGCGCGGGAACGTGGTGGATTTGGCGGTGGGTGTCATTATCGGTGCGGCATTCGGGAAGATTGTCTCTTCACTGGTTGCCGATATCATCATGCCTCCTCTGGGCTTATTAATTGGCGGGATCGATTTTAAA‑CAGTTTGCTGTCACGCTACGCGATgcgc < 2:1098636/239‑1 (MQ=255) 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> NC_000913/3437961‑3438428 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |