| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,070,450 | T→C | 7.0% | intergenic (‑49/+65) | yihR ← / ← yihS | putative sulphoquinovose mutarotase/sulphoquinovose isomerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,070,450 | 0 | T | C | 7.0% | 532.6 / 5.4 | 174 | intergenic (‑49/+65) | yihR/yihS | putative sulphoquinovose mutarotase/sulphoquinovose isomerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (102/54); new base C (2/13); total (104/70) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.15e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
GTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGACTTTGGTGGTGACCTTATTGTCCGCATCCAGCTCCTGCCACCAGGAACCATTTTCATAGTCCATCAGGTACTTAATGCAGTACTCCCACCATGTTTGATACC > NC_000913/4070165‑4070738 | gTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAACAACTGCA‑C‑CGGACGGTcc > 1:119696/1‑288 (MQ=255) aCAGCCGCTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCt > 1:25897/1‑288 (MQ=255) cAGCCGTTGGCGATCCGGGTCGGCCACGGAATAAGCCCTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCg < 2:25897/289‑1 (MQ=255) cGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCg < 1:751275/285‑1 (MQ=255) cGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGcc < 1:698526/287‑1 (MQ=255) cGTTGGCGATCCGGTGCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAGCCCTGCAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCg < 2:2149632/285‑1 (MQ=255) tGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTTATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGTTTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAACCCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCttt > 1:2732251/1‑289 (MQ=255) atccccgtCGGCCACGGAATAAGCACTTTCCCCAGATGCGCCAGCGGCCTCTCATCGGGTGTGGGCGGGATGACTATATGAAAGCCCTGAAAGGTTAATTCCGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCTCGTGATAATCCCCCGCGACAAGGGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGAACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGGCGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGga < 2:2732251/282‑1 (MQ=255) tCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCGGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGgag < 1:1697409/289‑1 (MQ=255) tCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGgag > 2:1605794/1‑289 (MQ=255) tCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGga < 2:996378/288‑1 (MQ=255) tCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGga < 1:1894524/288‑1 (MQ=255) ccGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGgaga < 2:1135468/289‑1 (MQ=255) cTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGga > 1:485641/1‑264 (MQ=255) cTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGga > 2:153816/1‑264 (MQ=255) cTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGga < 2:485641/264‑1 (MQ=255) ttACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTACACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGATCCCCTCGCCTCATTGGGGAGAGGGTCAGGGAGAGGGGAAAACCCGc > 2:384068/1‑289 (MQ=255) cccGGATGCGCCAGCGGCTTCTCTTCGGGTTTGTGGGGAATGACAAAATGACAACCCTGAAAGGTAAATTCGGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTAATAATCCCCCGCGGAAAGGGAAACGGCCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTAAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCTCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCAcc < 2:912273/289‑1 (MQ=255) gATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAAAGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTACCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGTAGAGGGGAAAACCCGCTCCCTAt > 1:2291730/1‑289 (MQ=255) tGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTAttt > 1:450016/1‑289 (MQ=255) tgtgCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGga > 1:1600021/1‑228 (MQ=255) tgtgCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGga < 2:1600021/228‑1 (MQ=255) tgCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGga < 2:299204/226‑1 (MQ=255) tgCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAatat > 1:1800498/1‑288 (MQ=255) aaCCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCg < 1:1065577/195‑1 (MQ=255) aaCCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCg > 2:1065577/1‑195 (MQ=255) cccTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCCGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCATCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCCCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAAAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGACTAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGcctaacccg > 2:1014778/1‑280 (MQ=255) aaaGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGga < 2:1436056/200‑1 (MQ=255) ttAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCg < 2:406066/183‑1 (MQ=255) ttAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCg > 1:406066/1‑183 (MQ=255) tAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCg > 1:1119068/1‑182 (MQ=255) tAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCg < 2:1119068/182‑1 (MQ=255) tAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTa < 1:372449/202‑1 (MQ=255) tAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTa > 2:372449/1‑202 (MQ=255) aaTTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGga > 1:1823821/1‑193 (MQ=255) aaTTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGga < 2:1823821/193‑1 (MQ=255) ccAGACCAGCACGGACGGTCACAATTGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAATGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCg < 2:2528445/174‑1 (MQ=255) aCCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTggg > 1:2528445/1‑174 (MQ=255) aCCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATAc > 1:2225479/1‑289 (MQ=255) aCGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTAtt > 1:883285/1‑222 (MQ=255) aCGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCGG‑ATGTCAAACCCACAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGTTTAGGGTGAGGGGAAAACCCGCCCCCTATTTTCAGATAACTTATTTCGCATTAATACCCATCAGACCCGCTGCCACCGCTGGCGCCACGCCGGGCGATCAGGGGATAcgacg > 2:2145008/1‑286 (MQ=255) cgcgTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAAt > 1:307296/1‑289 (MQ=255) cgTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCtt > 2:1783959/1‑150 (MQ=255) cgTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCtt < 1:1783959/150‑1 (MQ=255) cgTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGga > 2:1867089/1‑156 (MQ=255) cgTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGga < 1:1867089/156‑1 (MQ=255) tGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGCGCAATGCCGGGCGCTAACGGGATAAGCGGGCTCAC‑CAGGCAATgca > 2:573439/1‑288 (MQ=255) cccGCGGCAATTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATa > 1:1015965/1‑289 (MQ=255) cccGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATa > 1:2388450/1‑289 (MQ=255) ccGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAatat > 1:1165592/1‑206 (MQ=255) cgGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGcc < 2:784183/131‑1 (MQ=255) cgGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGcc > 1:784183/1‑131 (MQ=255) ttataagggaccgccATTTTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTATTTAACGACATACACCCCCCCGTGGGGCTG‑TGGCCAAACCCAAAACCGGCC‑C‑CGGCCGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCa < 2:1725147/275‑1 (MQ=255) tGTCCACTGCAATGCATTTGGGTGATTTGCAAAAAAGGCCCCTTAATTACCGACAGACATCCTCCCGGGGGGCTG‑AGAGCAAACCCAAAAACGCCA‑C‑CGGACGTCCCCCTCGCCCGTTGGGGAGGAGGGTGGGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCa < 1:2252770/289‑1 (MQ=255) tGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGcc > 1:623004/1‑114 (MQ=255) tGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGcc < 2:623004/114‑1 (MQ=255) tGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTAtttt > 1:127832/1‑161 (MQ=255) tGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCaa > 1:159351/1‑204 (MQ=255) ccACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCGAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATGCTGTTTGCCGTCCCAGaa > 1:429030/1‑288 (MQ=255) tGCAATGAATTTGAGTGATTTGCATAACAGGCACCTTAATTACCCACATACAGCCTCCCGTGGGGCTG‑ATTTCAAACCCAAAAAC‑GCAGC‑CGTACGGTCCCCGCGCCCCATGGGGGAGAGGGTGAGGGAGAGTGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGACTTtg < 2:307296/289‑1 (MQ=255) caagtaatatTGGTGTTTGGAATAAAATTCACCTAAATGAACGAAATACCCCCCCCCGTGGGGCTT‑ATGTAAAACCAAAAACCGACC‑C‑GGGACGGCCCCCGCGCCCCTTTGGGGGGAGGTTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAg < 2:2286361/149‑1 (MQ=255) tGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAgg > 1:163123/1‑239 (MQ=255) tGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGACTTTggtggt > 1:294184/1‑289 (MQ=255) tGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCAAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGGGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGACTTTgggggt > 1:138912/1‑289 (MQ=255) aatatTGGTGATTTCCAAACAAGACACCTTAATTAACGACACCCAGCCCCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACGGCA‑C‑CGGACGGCCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGGGGTTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCAcc < 2:756636/139‑1 (MQ=255) atTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGc > 1:2207698/1‑265 (MQ=255) tGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCCCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAACACCCGCACCCTATTTTCAg > 1:558596/1‑145 (MQ=255) aTTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCtt > 2:2019303/1‑94 (MQ=255) aTTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCtt < 1:2019303/94‑1 (MQ=255) aTTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGAt > 1:890455/1‑142 (MQ=255) aTTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGACTTtggtg > 1:1725147/1‑275 (MQ=255) aTTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGACTTTGGTGGTGACCTTATTGt > 1:1546875/1‑288 (MQ=255) aTTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCAGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGCGCTACATATCCTGTTTGCTGTCCCAGACGTTGGTGGTGACCTTAtttt > 2:223597/1‑286 (MQ=255) aTTTGCATACAAGGCAACTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGCGAGGCTG‑ATTTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGCACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCCCCCTATGTCCACATCATTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACACCCGGCAACCGCTGGAGCCATTCCGGCAGCTAACGCGCTCCTCGCGA‑CACACATTCCATGCATCCCCTGACGCACAGCCCGTTTTCCGTTCCATACTTTTGTGGTTACCTTATTGt > 2:1552662/1‑288 (MQ=255) tACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGTGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAg > 1:2637651/1‑133 (MQ=255) ggCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGACTTTGGTGGTGACCTTATTGTCCGCATCCAGCt > 1:2367397/1‑288 (MQ=255) ccTTAATTAACACCATACCGCCCCCCGGGAGGTGG‑AGGTGAAACCAAAAAACGGCC‑C‑CGACCGGCCCCCTCGCCCCGTGGGGGGGAGGGTTAGGAGAAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTGTGCCGTCCCAGACTTTGGTGGTGACCTTATTGTCCGCATCCAGCTCCTGc < 2:1471468/289‑1 (MQ=255) cTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGACTTTGGTGGTGACCTTa > 1:2154737/1‑267 (MQ=255) gACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGACTTTGGTGGTGACCTTATTGTCCGCATCCAGCTCCTGCCACCAGGAAcc > 1:1456969/1‑289 (MQ=255) caatccacccacccGTGAGCGTG‑ATAGCAAACCCAAACACTGCA‑C‑CAGGCGCTCCCCCCGCCCCTTTGGTGAGGGGGTTAGGGGGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGTTACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGACTTTGGTGGTGACCTTATTGTCCGCATCCAGCTCCTGCCACCAGGAACCa < 2:1824971/278‑1 (MQ=255) cATACAGACTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTCCA‑C‑CGGACGTGCCCCTCGCCCCGTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGGGTGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGACTTTGGTGGTGACCTTATTGTCCGCATCCAGCTCCTGCCACCAGGAACCAt < 1:2654430/289‑1 (MQ=255) ccTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGACTTTGGTGGTGACCTTATTGTCCGCATCCAGCTCCTGCCACCAGGAACCATTTTCATa > 1:418881/1‑289 (MQ=255) ccccGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAACCTGCC‑C‑CGGACGGCCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTGGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGACTTTGGTGGTGACCTTATTGTCCGCATCCAGCTCCTGCCACCAGGAACCATTTTCATAGt < 2:2367397/288‑1 (MQ=255) cccGTGATGCTGAAGGTCAACCCCACAACCGCCA‑C‑CGGCCGTCCCCCCCGCCCCTTTGGGGGGAGGGTAAGGGGGGGGGAAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGACTTTGGTGGTGACCTTATTGTCCGCATCCAGCTCCTGCCACCAGGAACCATTTTCATAGt < 1:1014778/289‑1 (MQ=255) cccGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGgaga < 1:520863/63‑1 (MQ=255) cccGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGgaga > 2:520863/1‑63 (MQ=255) cccGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGACTTTGGTGGTGACCTTATTGTCCGCATCCAGCTCCTGCCACCAGGACCCATTTTCATAGt > 2:1124257/1‑288 (MQ=255) ccGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACGGCG‑C‑CGGACGGCCCCCTCGCCCCTTTGGGGGGAGGGTTAGGGGGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGACTTtggtgg < 2:2052900/236‑1 (MQ=255) tgCTG‑ATGTC‑AACCCAGAAACTGAA‑CACGGACGCGCCCACCTCCCTTGTGGGTAGGGGGTTTGGAAGCGGAGAACACCCGCACCCTATTTTCACATCAGTTATTTCGCATGAATATCCCGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGCGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGACTTTGGTGGTGACCTTATTGTCCGCATCCAGCTCCTGCCACCAGGAACCATTTTCATAGTCCATCAg < 2:138912/287‑1 (MQ=255) ggCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGAAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGACTTTGGTGGTGACCTTATTGTCCGCATACAGCTCCTGCCACCAGGAACCATTTTCATAGTCCATCAgg > 1:585102/1‑289 (MQ=255) gtcggatttaaaaCCCAAAAACTGAA‑C‑CGGACGGCCCCACCCCCCCTTTGGGGAGGGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGACTTTGGTGGTGACCTTATTGTCCGCATCCAGCTCCTGCCACCAGGAACCATTTTCATAGTCCATCAg < 1:1507191/278‑1 (MQ=255) gCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAACACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGATATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGACTTTGGTGGTGACCTTATTGTCCGCATCCAGCTCCTGCCACCAGGAACCATTTTCATAGTACATCAgg > 1:1425126/1‑288 (MQ=255) aggccAAACCCACAACGTCCT‑C‑CGGCCGTTCCGCCCCCCCCTTTGGGGATGGGGTTAGGGGAAGGGAAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGACTTTGGTGGTGACCTTATTGTCCGCATCCAGCTCCTGCCACCAGGAACCATTTTCATAGTCCATCAGGTACt < 1:1322681/284‑1 (MQ=255) gaaaaCCCAAAAACGGCG‑C‑CGGACGGTCCCCTGGCCCCTTTGGGGGGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGACTTTGGTGGTGACCTTATTGTCCGCATCCAGCTCCTGCCACCAGGAACCATTTTCATAGTCCATCAGGTACTTaa < 1:2459984/286‑1 (MQ=255) ccAAACACTGCA‑C‑CGGTCGGTCCACTCGCCCATTTGGGGATAGGGTTAGGGAGAGCGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAACATCCCGCAGACCCGCTGCAACCACTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATTTCCTGTTTGCCGTCCCAGACTTTTGTGGTGACCTTATTGTCCGCATCCAGCTCCTGCCACCAGTAACCATTTTCATAGTCCATCAGGTACTTAATGCAGTa < 2:119696/289‑1 (MQ=255) cA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGCCCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGACTTTGGTGGTGACCTTATTGTCCGCATCCAGCTCCTGCCACCAGGAACCATTTTCATAGTCCATCAGGTACTTAATGCAGTACTCCCACCAt > 1:2064890/1‑289 (MQ=255) cA‑C‑CGGACGGCCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGAccc > 1:697883/1‑103 (MQ=255) gACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGACTTTGGTGGTGACCTTATTGTCCGCATCCAGCTCCTGCCACCAGGAACCATTTTCATAGTCCATCAGGTACTTAATGCAGTACt > 1:2317806/1‑276 (MQ=255) tCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGCCTTTGGTGGTGACCTTATTGTCCGCATCCAGCTCCTGCCACCAGGAACCATTTTCATAGTCCATCAGGTACTTAATCCAGTACTCCCACCATGTTTGATaac > 1:2497957/1‑287 (MQ=255) tCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGACtt < 2:828119/190‑1 (MQ=255) | GTAACAGCCGTTGGCGATCCGGTTCGGCCACGGAATAAGCACTTTACCCAGATGCGCCAGCGGCATCTCTTCGGGTTTGTGCGGGATGACTAAATGACAACCCTGAAAGGTTAATTCAGCCAGACCAGCACCGACGGTCACAATGGTCGCGTGATAATCCCCCGCGGCAAGTGAAACGGTCTGTCCACTGCAATGCATATTGGTGATTTGCATACAAGGCACCTTAATTAACGACATACAGCCTCCCGTGAGGCTG‑ATGTCAAACCCAAAAACTGCA‑C‑CGGACGGTCCCCTCGCCCCTTTGGGGAGAGGGTTAGGGAGAGGGGAAAACCCGCACCCTATTTTCAGATCAGTTATTTCGCATTAATATCCAGCAGACCCGCTGCAACCGCTGGAGCCATGCCGGGCGCTAACGGGATACGCGGGATCAC‑CAGGCAATGCAGCAGGTGATAAATATCCTGTTTGCCGTCCCAGACTTTGGTGGTGACCTTATTGTCCGCATCCAGCTCCTGCCACCAGGAACCATTTTCATAGTCCATCAGGTACTTAATGCAGTACTCCCACCATGTTTGATACC > NC_000913/4070165‑4070738 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |