| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4430454 | 193 (1.200) | 4 (0.030) | 4/490 | NT | 2.1% | coding (591/1413 nt) | cycA | D‑alanine/D‑serine/glycine transporter |
| ? | NC_000913 | = 4430465 | 191 (1.230) | coding (602/1413 nt) | cycA | D‑alanine/D‑serine/glycine transporter | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
CACCGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCCCGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCCATTGTGTCGCTGATTGTCGTCGGCCTGGTCATGGTGGCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTTGTGGAATGACGGCGGCTGGTTCCCGAAAGGTTTAAGTGGCTTCTTTGCCGGATTCCAGATAGCGGTTTTCGCTTTCGTGGGGATTGAGCTGGTAGGTACAACAGCTGCGGAAACCAAAGATCCAGAGAAATCACTGCCA‑‑CGCGCGATTAACTCCATTCCGATCCGTATCATTATGTTCTACGTCTTCGCGCTGATTGTGATTATGTCCGTGACGCCGTGGAGTTCGGTAGTCCCGGAGAAAAGCCCGTTTGTTGAACTGTTCGTGTTGGTAGGGC > NC_000913/4430169‑4430737 | gcggcgtgACGTAATGGTTCTGCTGGGTTGTAACCTGTATGGCAGGCGTGGTAGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTTGTTCCCCGATCTCTCCAACTGGTTCGCCTCGCGGGCGGTGGTAGTGCTGCTGCTGACGCTGAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGATTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCCATTGTGTCGCTGATTGTCGTCGGCCTGGTCATGGTGGCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCa < 2:1234847/282‑1 (MQ=255) cGGCTGGACTTACTGGTTCTGCTGGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCCCGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCCATTGTGTCGCTGATTGTCGTCGGCCTGGTCATGGTGGCGATGCTCTTTCAGTCACCGACCGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCAt > 1:734851/1‑289 (MQ=255) ctgGGTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCCCGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCCATTGTGTCGCTGATTGTCGTCGGCCTGGTCATGGTGGCTATGCCCTTTCAGTACCCGACTGGTGTGTAAGCGTAATTCTCGCATATGTGGAATTACGGCTGCTgg > 2:429909/1‑289 (MQ=255) tgtgTTGTAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATTACGGTTTATTCTCAGTTCGGGTTCCCCGATCTCGCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGTTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCCATTGTGTCGCTGATTGTCGTCGGCCTGGTCATGGTGGCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCAGTCGCGCATTTGTGgaatgacgcttccacac > 2:1304854‑M2/1‑272 (MQ=255) tAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCCCGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCC‑TTGTGTCGCTGATTGTCGTCGGCCTGGTCATGGTGGCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTTGTGGAATGACGGCGGCTGGTTCCCg > 1:1113898/1‑286 (MQ=255) tAACCGGTATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCCCGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCC‑TTGTGTCGCTGATTGTCGTCGGCCTGGTCATGGTGGCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTTGTGGAATGACGGCGGCTGGTTCCCg < 2:1113898/286‑1 (MQ=255) tATGGCAGACGTGGTGGCGATCACGGCTTATGCTCAGTTCTGGTTCCCCGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCCATTGTGTCGCTGATTGTCGTCGGCCTGGTCATGGTGGCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTTGTGGAATGACGGCGGCTGGTTCCCGAAAGGTTTa > 1:1219499/1‑289 (MQ=255) 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ccccGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCCATTGTGTCGCTGATTGTCGTCGGCCTGGTCATGGTGGCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTTGTGGAATGACGGCGGCTGGTTCCCGAAAGGTTTAAGTGGCTTCTTTGCCGGATTCCAGATAGCGGTTTTCGCTTTCTTg > 2:1137214/1‑289 (MQ=255) ccGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCCATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCCCCATTGTGTCGCTGATTGTCGTCGGCCTGGTCATGGTCGCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGCAGCGTCATTCCCGCATTTGTGGAATGACGGCGGCTGGGTCCCGAAAGGCTTCAGTGGCTTTTTTTCCGGGTTCCCGATTCTGGTTCTCGCTTTCGTggg > 2:572574/1‑289 (MQ=255) ccGATCTCTCCGACTGGGTCGCCTCGCTGGCGGTGATAGTGCTGCTGCTGACGCTCAATCTCGCCACCGTGAAAATGTTCGGTGAGATGGAGTTCTGGTTTGCGATGATCAAAATCGTCGCCATTGTGTCGCTGATTGTCGTCGGCCTGGTCATGGTGGCGATGCACTTTCAGTCACCGACTGGTGTGGAAGCGTCATTCGCGCATTTGTGGAATGACGGCGGCTGGTTCCCGCAAGGTTTAAGTGGGTTCTTTGCCGGATTCCAGATAGCGGTTTTCGCTTTCGTggg > 1:311207/1‑289 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |