| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3992522 = | 268 (1.670) | 7 (0.040) | 7/492 | NT | 2.6% | coding (1370/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase |
| ? | NC_000913 | = 3992516 | 263 (1.680) | coding (1364/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 307 total aligned reads displayed.
GGGACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAG‑GCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTG‑ACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGATCATCAGCCATCAGCCGCTGGAATATAACCGTTACCTGAATAAACTGGTGGCGTGGGCATGGTTTAACGGCCTGCTGACCTCGCGCACCCGTTTGTATATTAAAGGTAACGGCATTGTCGATTTGCCTAAGTTGCAGGAGATGGTCGCCGACGTGTCGCACCATTTCCCGCTGCGCTTACCTGCACCGACACCGAAGGCGCTCTACAGCCCGTGTGAGATCCGCC > NC_000913/3992231‑3992803 | gggACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAG‑GCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTG‑ACCTTTATTTATGTGCCgcc < 1:1452494‑M2/289‑4 (MQ=255) ggACGAAGCTCGTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAG‑GCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGGTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCAACCGATCTCTCGGAACCGAATTTGCACCTTT‑TTTATGTGCCgccg < 2:1357821‑M2/289‑5 (MQ=255) gTCTGGCAATGCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAG‑GCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTG‑ACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTaa > 2:691413/1‑289 (MQ=255) gCTCGATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAG‑GCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAAACCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTG‑ACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGt > 1:394779/1‑289 (MQ=255) gATAACCGCGGTACCTGGAAGATTGATAAGGTGGTTTGG‑GCGAAGAAGGAGGTGCTCGAAGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCTTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGTTATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTG‑ACCTTTATTGATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGt < 2:1334795/289‑1 (MQ=255) gATAACCGCGCTAACTGGAAGATTTATCAGGGGCGGGAG‑GCGCAAAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTG‑ACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGt < 2:486535/289‑1 (MQ=255) gATAACCGCGCTAACTGGAAGATTGATCAGGTGCGTGAG‑GCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTG‑ACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGt < 1:691413/289‑1 (MQ=255) aTACCCGCGCTACCTGGAAGATTATGCAGGTGCGGGAG‑GCGAACAACGGGTTGCTCGACGCGAGGATGCAGGGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGGGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTG‑ACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGt < 2:696413/288‑1 (MQ=255) tAACCGCGCTAACTGGAAGATTAATCAGGTGCGTGGG‑GCGAACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTG‑ACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTAt < 1:490061/289‑1 (MQ=255) tAACCGCGCGAACTTGAAGATTGATCAGGAG‑GTTAGAGCGCACTACGAGCTGGTCGAAGCGATGATGCACAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTGGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCTGACGGGTCTCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGTAACTGAATCTG‑ACCTTTATTTATGTGCCGCCTGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTAt < 2:749385/289‑1 (MQ=255) aGATTGATCAGGTGCGTGAG‑GCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTG‑ACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGcc < 1:867759/289‑1 (MQ=255) aGATTGATCAGGTGCGTGAG‑GCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTG‑ACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGcc < 1:185938/289‑1 (MQ=255) aGATTGATCAGGTGCGTGAG‑GCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTG‑ACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGcc < 1:1443149/289‑1 (MQ=255) 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tGAG‑GCGCACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATGACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTG‑ACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGatc > 1:1502118/1‑289 (MQ=255) gcgtgaggcgcacaacgagttgctcgacgcgatgatccagagctaccgtaatctgatccgctttgcgcgtcgcaataaccttagcgtctccgccagtccgcaggatatcggcgtgctgacgcgtaagctgtatgccgcgtttgaagcattaccaggtaaagtgacgctggtaaacccgcaTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTG‑ACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGatca > 2:610692‑M2/181‑289 (MQ=255) cgcACAACGAGTTGCTCGACGCGATGATGCAGAGCTACCGTAATCTGATCCGCTTTGCGCGTCGCAATAACCTTAGCGTCTCCGCCAGTCCGCAGGATATCGGCGTGCTGACGCGTAAGCTGTATGCCGCGTTTGAAGCATTACCAGGTAAAGTGACGCTGGTAAACCCGCAGATTTCACCCGATCTCTCGGAACCGAATCTG‑ACCTTTATTTATGTGCCGCCGGGCCGGGCTAACCGTTCAGGTTGGTATCTGTATAACCGCGCGCCAAATATTGAGTCGAtcatca > 1:111867/1‑288 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |