| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 201043 = | 84 (1.370) | 3 (0.050) | 3/478 | NT | 3.4% | coding (73/1026 nt) | lpxD | UDP‑3‑O‑(3‑hydroxymyristoyl)‑glucosamine N‑acyltransferase |
| ? | NC_000913 | 201342 = | 87 (1.470) | coding (372/1026 nt) | lpxD | UDP‑3‑O‑(3‑hydroxymyristoyl)‑glucosamine N‑acyltransferase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CCATGCAATCTGCACAAACAGGTCACATTACGTTCATGGTTAACCCAAAATACCGTGAGCATTTAGGCTTGTGCCAGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACTGGGCGATAACGTGATTATCGGTGCCGGTTGCTTCGTAGGTAAAAACAGCAAAATCGGTGCAGGTTCGCGTCTCTGGGCGAACGTAACCATTTACCATGAGATCCAGATCGGTCAGAATTGCCTGATCCAGTCCGGAACAGTGGTAGGCGCAGACGGCTTTGGTTATGCCAACGATCGTGGTAACTGGGTGAAGATCCCACAGATTGGTCGCGTAATTATTGGCGATCGCGTGGAGATCGGTGCCTGCACAACCATCGATCG > NC_000913/201059‑201620 | ccATGCAATCTGCACAAACAGGTCACATTACGTTCATGGTTAACCCAAAATACCGTGAGCATTTAGGCTTGTGCCAGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTc < 2:108887/289‑1 (MQ=255)ccATGCAATCTGCACAAACAGGTCACATTACGTTCATGGTTAACCCAAAATACCGTGAGCATTTAGGCTTGTGCCAGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTc < 2:506156/289‑1 (MQ=255) ggTCACATTACGTTCATGGTTAACCCAAAATACCGTGAGCATTTAGGCTTGTGCCAGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACTGGGCGATa > 2:95667/1‑289 (MQ=255) aCGTTCATGGTTAACCCAAAATACCGTGAGCATTTAGGCTTGTGCCAGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTACCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGCGTCCGGCGGTCACCTGGGCGATAACGTGATTa > 2:407246/1‑289 (MQ=255) gTTCATGGTTAACCCAAAATACCGTGAGCATTTAGGCTTGTGCCAGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACTGGGCGATAACGTGAGTATc > 2:231246/1‑289 (MQ=255) cATGGTTAACCCAAAATACCGTGAGCATTTAGGCTTGTGCCAGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACTGGGCGATa < 1:180342/275‑1 (MQ=255) cATGGTTAACCCAAAATACCGTGAGCATTTAGGCTTGTGCCAGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACTGGGCGATa > 2:180342/1‑275 (MQ=255) aCCCAAAATACCGTGAGCATTTAGGCTTGTGCCAGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACTGGGCGATAACGTGATTATCGGTGCCGGtt > 1:480200/1‑288 (MQ=255) aTACCGTGAGCATTTAGGCTTGTGCCAGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACTGGGCGATAACGTGATTATCGGTGCCGGTTGCTTCGTa > 2:439438/1‑289 (MQ=255) gTGAGCATTTAGGCTTGTGCCAGGCGTCCGCGGTTGTCATGACCCAGGACGATCTTCCTTTCGCGAAAAGTGCCGCACTGGTAGTGAAGAATCCCTACCTGACTTACGCGCGCATGGCGCAAATTTTAGATACCACGCCGCAGCCCGCGCAGAACATTGCACCCAGTGCGGTGATCGACGCGACGGCGAAGCTGGGTAACAACGTATCGATTGGCGCTAACGCGGTGATTGAGTCCGGCGTTGAACTGGGCGATa < 1:407035/255‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |