Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 1,293,032 | IS1 (–) +8 bp | intergenic (‑110/‑488) | hns ← / → tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | 1293032 = | 0 (0.000) | 117 (1.240) | 77/520 | 0.1 | 100% | intergenic (‑110/‑495) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
TCTGTTGACCTCCAGGAGATAGTGCAATACTAAGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1293300‑1293032 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCGCTATCTCTGCTCTCACTGCCGTAAAACATGGCAACTGCAGTTCACTTACACCGCTTCTCAACCCGGTACGCACCAGAAAATCATTGATATGGCCATGAATGGCGTTGGATGCCGGGCAACAGCCCGCATTAT < NC_000913/1979270‑1978998 TCTGTTGACCTCCAGGAGATAGTGCAATACTAAGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGAT > 1:341745/1‑275 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ATAGTGCAATACTAAGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 2:768266/275‑1 ATAGTGCAATACTAAGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATT < 2:152030/275‑1 AGTGCAATACTAAGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA > 2:671844/1‑275 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TACTAAGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATG > 2:570532/1‑275 AGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACCAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG > 1:336085/1‑274 AGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG > 1:440459/1‑274 AGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG > 2:269030/1‑274 AGTCCATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGG > 1:136565/1‑274 ATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGCAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGGGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGCGTATGATGGTGTTTT > 2:752101/1‑275 ATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGTTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCGGCCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCCAAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTTTATGATGGTGTTTT > 2:749895/1‑275 ATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTTTTTT > 2:345020/1‑275 ATGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT > 1:318137/1‑275 TGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCAGCACAAGGTGATGCTCCCAACTTACAGATTTATTGTATGATGGTGTTTTT > 2:800436/1‑275 TGCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTAGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATCTGCCGAGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGTTATTTCTTGGCGGCACAAGGTCATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT > 1:115395/1‑275 GCTCTTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTT > 1:52542/1‑274 TTATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTA < 1:580741/244‑1 TATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTG < 2:603643/275‑1 TATTGCGACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA > 2:314733/1‑271 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ACTGTTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGGTTTTGAGGTGCTC > 1:763343/1‑271 TTCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAGTTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC > 1:355036/1‑274 TCTACTTTTCATCATTCGCTTAATAGGGAATTCTCGTAAACACAACTAATACAGAAGACTGAAAGGTCGTCAGCCTACGATAATCTCCCCATAAAATGTGACATGAATCAGGAAGTTTTAACCTCACGTGCTGCGAAATCATCGGTGTAAATAGGGCTATATGCCGCGTCTTTTCTGGCTAATTTTATGAAAAGATATTTATTGGCGGCACAAGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTT < 1:269030/275‑1 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |