New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3973849 = | 73 (0.770) | 3 (0.030) | 3/512 | 9.8 | 4.0% | coding (242/882 nt) | rffH | glucose‑1‑phosphate thymidylyltransferase |
? | NC_000913 | 3973867 = | 72 (0.780) | coding (260/882 nt) | rffH | glucose‑1‑phosphate thymidylyltransferase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
TCAGCGGAGGCAAACATGAAAGGTATTATCCTGGCGGGCGGTTCCGGCACCCGATTGCATCCGATTACGCGCGGCGTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCGCTGGAAGAAAAGCCAAAACAGCCGAAGTCAAACTGGGCGGTGACCGGGCTTTATTTCTACGACAG > NC_000913/3973593‑3974140 | tCAGCGGAGGCAAACATGAAAGGTATTATCCTGGCGGGCGGTTCCGGCACCCGATTGCATCCGATTACGCGCGGCGTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑gc < 1:366302/275‑1 (MQ=255) cAGCGGAGGCAAACATGAAAGGTATTATCCTGGCGGGCGGTTCCGGCACCCGATTGCATCCGATTACGCGCGGCGTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑gcg < 2:879805/275‑1 (MQ=255) aGCGGAGGCAAACATGAAAGGTATTATCCTGGCGGGCGGTTCCGGCACCCGATTGCATCCGATTACGCGCGGCGTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATTACTACGCCGGAAGATAAGGGTTATTTCCAGAGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTGGGTATCCAGCTGGACTATGACAGACAGCCCAGCCCGGACGGTACG‑gcgc > 1:864048/1‑275 (MQ=255) attatCCTGGCGGGCGGTTCCGGCACCCCATTGCATCCGATCACGCGCGGCGTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGACAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTCATGCTGGCCAGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAACAGCTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGCTGGTAGTGGGTTCTGTAGCCGGCCGGAATATGCTGAACCGCCCAGCCCGGACGGTCCG‑GCGCGGGCCTTTACCATCGGTGaaa > 2:480248/1‑274 (MQ=255) tttcccgggcggccgGTTCCGCCACCCGATGGCATCCGATTACGCGCGGCGTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAAGGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCGGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAAcc < 2:840977/268‑1 (MQ=255) ttatCCTGGCTGGCGGTTCCGGCACCCGATTGCATCCGATTACGCGCGGCGTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTCCGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTTCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAAcc < 1:630456/275‑1 (MQ=255) ttatCCTGGCGGGCGGTTCCGGCACCCGATTGCATCCGATTACGCGCGGCGTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTTCTGGCCGATGGTAGTGCGTTGGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGCCGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTTAAAcc > 2:67200/1‑275 (MQ=255) ttatCCTGGCGGGCGGTTCCGGCACCCGATTGCATCCGATTACGCGCGGCGTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAAcc < 1:315979/275‑1 (MQ=255) ttatCCTGGCGGGCGGTTCCGGCACCCGATTGCATCCGATTACGCGCGGCGTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCCCATCATCACTACGCCGGACGATACAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGTTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCCGCCCGGACGGCCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAAcc > 2:615604/1‑275 (MQ=255) ttatCCTGGCGGGCGGTTCCGGCACCCGATTGCATCCGATTACGCGCGGCGTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGACGGTATCCGCGAAATTCTCATCATACCTACGCCGGAAGTTAAAGGTTATTTCCAGCGCCTCCTGCGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCCACCCGTACGGGCTG‑GTCAAAGCATTTATAATCGGTGCAAcc > 1:494258/1‑275 (MQ=255) 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ggTTCCGGCACCCGATTGCATCCGATTACGCGCGGCTTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGa < 1:13475/275‑1 (MQ=255) gCACCCGATTGCATCCGATTACGCGCGGCGTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGCCCGGTATCCGCGAAATTCCCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATCTGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGTGCTG‑GCGCCGGCCTTCATCCTCGGGGAAACCTTCCTGATTGGTGATCcttc > 2:615975/1‑274 (MQ=255) ccGATTACGCGCGGCGTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTTGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCCGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGTTATCAAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCCTTATCATTGGTAAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTggg > 2:677717/1‑275 (MQ=255) gATTACGCGCGGCGTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTCCCTTAATGGTGAACATTATTGTCTGGTGCTGGGCg > 1:268767/1‑275 (MQ=255) gATGACGCGAGGCGTATCGAAGCAACGGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTCCTATCCGCTTGCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCg < 2:98239/275‑1 (MQ=255) cgcgcgGCGTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCCATGATTTACTATCCGCCGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCCCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCTGCTGGAATATTCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGTTGCTGGGCGATAAc > 1:569332/1‑275 (MQ=255) gcgcgGCGTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACa > 2:129600/1‑275 (MQ=255) aGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAg < 2:238066/275‑1 (MQ=255) tGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCtt < 1:197061/274‑1 (MQ=255) tGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTTAACCTTCTTGGCTGGTTCTGGGCGATAACATCTTCTTTGGTCAGGGCTTCAGt > 2:401816/1‑275 (MQ=255) gATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCCCCGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTTGCTGGTGGTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTTAGGGCTTCAGTCCGa > 2:492617/1‑275 (MQ=255) tACGATAATCCAATGATTTGCTATCCTCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTGCGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAg < 2:253250/273‑1 (MQ=255) gCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATg > 1:482307/1‑275 (MQ=255) tGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTGCGGTAAGGGCTTAAGTCCGAAGCTGCGTGCTGTTgcg > 2:494336/1‑275 (MQ=255) aCTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGgcgcgc > 1:12248/1‑275 (MQ=255) aCTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGgcgcgc > 1:817247/1‑275 (MQ=255) tCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGTCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTGGCGGGGCGCCCCg > 2:787874/1‑275 (MQ=255) tCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCTCGCACCg > 1:367264/1‑275 (MQ=255) tCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCg > 1:18439/1‑275 (MQ=255) tCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGACCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGACACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTATGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGTTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGgcgcgccgcg > 1:500942/1‑271 (MQ=255) cGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCCCACCATCACTACGCCGGAAGATCACGGTAATTTCGAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTCAGTTCGGTACCCAGTTGGAATATGCCGCACAGCCCAGCCCGGACGGGCTG‑GCGCAGGCCTTTCTCATCGGTGAAACCTTCCTTACTGGTGAACCTTCTTATCTGCTACTGGGCGTTAACATGTTCTTCGGACAGGGCTGCCGTCCGAAGCTGCGTCAGGTTGCGgcccggagcg > 2:558223/1‑268 (MQ=255) cTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAgg > 1:262569/1‑275 (MQ=255) tCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATCACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCCGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAgggg > 2:75114/1‑274 (MQ=255) tCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGc > 1:130024/1‑275 (MQ=255) 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ggCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGc > 1:392722/1‑274 (MQ=255) ggCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGc > 1:586954/1‑274 (MQ=255) ggTATCCGCTAAATTCTCATCTTCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCGGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATc < 1:203562/274‑1 (MQ=255) 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atcatcaCTACGCCGGAAGATAAAGGGTATTTCCAGCGCCTGCTGGGGCATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACg < 2:686068/275‑1 (MQ=255) cGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATCACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGACCCGATGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGGGATGGACCCGGCACGCTTTGGCgtggtt > 2:855630/1‑274 (MQ=255) aTTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAAt > 1:604091/1‑275 (MQ=255) aTTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGAGCACCGAAGGGCCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGACAGGTTTGGCGTGGGGGAGTTTGACGACaa > 1:382346/1‑274 (MQ=255) tttCCAGCGCCTGCTGGGCGCTGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTACTTAAGGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCAGGGAGATAACATCTTCTTCGGTCAGTGCTTCAGACCGAAGCTGGGTCATGATGCGGCGAGCACCGAAGGGGCCACGGCTTTTGGCGATCAGGTGATGAACCCGGACCGGTGTGGCGTGGCGGGGTTCGACGACAAt > 2:621221/1‑274 (MQ=255) gcgcCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCCTGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCcgcg > 1:606964/1‑275 (MQ=255) ggTAGGGAGTTCGGTGTCCAGCTGGAATATGCCGAACGGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGGCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCGCTGgaaga < 2:801594/275‑1 (MQ=255) gTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGA‑‑ATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACATTTTCCGCGCTATCCCGCTGGACGaaaa > 1:286605/1‑275 (MQ=255) aGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTTTCAGGTGATGGACCCGGAACGCCTTGGCGGGGTGGAGGTTTACGACAATTTCCGGCCTCTCCTGCTGGAAGaaac > 1:475899/1‑274 (MQ=255) ttCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTatcatc > 1:516452/1‑66 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(MQ=255) tATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGGGGTTGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTACCTCGCTGGAAGAAAAGCCACAACAGc > 2:359733/1‑275 (MQ=255) aaCAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGGGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCACTATCTCGCTGGAAGAAAAGCCAAAACAGCCGAAGTAAAACGGGGGGGt > 1:209371/1‑274 (MQ=255) aaCAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCGCTGGAAGAAAAGCCAAAACAGCTGAAGTCAAACTGGGCGGt > 1:588328/1‑274 (MQ=255) 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gcgcAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTGATGGTTAACCTTCTTGTCGGGTGCTGGGCGATAACATCTTGTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCGCTGGAAGAAAAGCCAAAACAGCCGAAGTCAAACTGGGCGGTGACCGGGCTTTATTTCTACGACAg < 2:727422/275‑1 (MQ=255) | TCAGCGGAGGCAAACATGAAAGGTATTATCCTGGCGGGCGGTTCCGGCACCCGATTGCATCCGATTACGCGCGGCGTATCGAAGCAACTGTTGCCGATTTACGATAAGCCAATGATTTACTATCCGCTGTCGGTGCTGATGCTGGCCGGTATCCGCGAAATTCTCATCATCACTACGCCGGAAGATAAAGGTTATTTCCAGCGCCTGCTGGGCGATGGTAGTGAGTTCGGTATCCAGCTGGAATATGCCGAACAGCCCAGCCCGGACGGTCTG‑GCGCAGGCCTTTATCATCGGTGAAACCTTCCTTAATGGTGAACCTTCTTGTCTGGTGCTGGGCGATAACATCTTCTTCGGTCAGGGCTTCAGTCCGAAGCTGCGTCATGTTGCGGCGCGCACCGAAGGGGCGACGGTTTTTGGCTATCAGGTGATGGACCCGGAACGCTTTGGCGTGGTGGAGTTTGACGACAATTTCCGCGCTATCTCGCTGGAAGAAAAGCCAAAACAGCCGAAGTCAAACTGGGCGGTGACCGGGCTTTATTTCTACGACAG > NC_000913/3973593‑3974140 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |