Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 704,083 | C→A | 100% | A47E (GCG→GAG) | nagE → | N‑acetyl glucosamine specific PTS enzyme IIC, IIB, and IIA components |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 704,083 | 0 | C | A | 100.0% | 390.1 / ‑6.7 | 109 | A47E (GCG→GAG) | nagE | N‑acetyl glucosamine specific PTS enzyme IIC, IIB, and IIA components |
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Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GTTTAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAGATGATCTAACAATCTGATTACAGAACATCGGCAGTACAATTTGCAGCAAAATAAAAATACGGCTTGAAACGAGCCAAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGCGATTTTTGATAACCTCGCATTAATCTTCGCCATCGGTGTGGCATCCAGCTGGTCGAAAGACAGCGCTGGTGCGGCGGCGCTGGCGGGTGCGGTAGGTTACTTTGTGTTAACCAAAGCGATGGTGACCATCAACCCAGAAATTAACATGGGTGTACTGGCGGGTAT‑CATTACCGGTCTGGTTGGTGGCGCAGCCTATAACCGTTGGTCCGATATTAAACTGCCGGACTTCCTGAGCTTCTTCGGCGGCAAACGCTTTGTGCCGATTGCCACCGGATTCTTCTG > NC_000913/703797‑704365 | ttAATTTGCGATACGAATTAAATTTTCACACACTCTGTAGCAGATGATCTAACAATCTGATTACAGAACATCGGCAGTACAATTTGCAGCAAAATAAAAATACGGCTTGAAACGAGCCAAATAGGGTTCTCGTAGGGGGAATAAGATGAATATTTTAGGTTTTTTCCAGCGACTCGGTAGGGCGTTACAGCTCCCTATCGCGGTGCTGCCGGTGGCGGCACTGTTGCTGCGATTCGGTCAGCCAGATTTACTTAACGTTGCGTTTATTGCCCAGGCGGGCGGTGAGAtt < 1:897412/289‑1 (MQ=255) 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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |