| Predicted mutation | ||||||
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| JC | CP025533 | 372,682 | Δ18 bp | coding (266‑283/1092 nt) | CYL77_01865 → | glycosyltransferase family 1 protein |
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| ? | CP025533 | 372700 = | 1 (0.010) | coding (284/1092 nt) | CYL77_01865 | glycosyltransferase family 1 protein | |||||
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
TATTTTTTATGAAGGGATCCTGCAGAATCTAATTCAAGATGGGTGGGATGTGCACCTTGTTTCAAATCCAGGCCCAGTTGGGAAGAAATTACTGAATGGTAAAGCTCATACTATCGAGATGTCTAGAGAGATTTCAATAGGTACCGATGTTAAATCATTATTTAATTGGGTGCTATTGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 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TAAATCATTATTTAATTGGGTGCTATTGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGC > 1:787734/1‑249 AATCATTATTTAATTGGGTGCTATTGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGC < 2:143557/249‑1 TCATTATTTAATTGGGTGCTATTGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGTAATTGAAGATGCGCAC < 1:1409546/249‑1 TCATTATTTAATTGGGTGCTATTGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCAC > 2:888488/1‑249 TTATTTAATTGGGTGCTATTGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCT < 1:170485/249‑1 AATTGGGTGCTATTGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTT < 1:1461352/249‑1 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TTGGGTGCTATTGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAA < 1:1034238/249‑1 GTGCTATTGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGA < 1:61178/249‑1 CTATTGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGn > 1:1195478/1‑248 TATTGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAG > 2:1207895/1‑249 TATTGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAG > 1:161267/1‑249 TGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGC < 2:1106306/249‑1 TGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGC < 1:718555/249‑1 CTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAn > 2:936396/1‑248 TTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAG > 2:1177292/1‑249 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GTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATG > 1:532299/1‑249 TCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGG > 2:1404273/1‑249 CAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCn > 1:974139/1‑248 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GTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTT < 1:1228899/249‑1 TTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTG < 1:578285/249‑1 GGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAG < 2:1417934/249‑1 AGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGTACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAGCTTGATCGCTT < 1:442309/249‑1 CTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAGCTTGATCGCTTTA < 1:340129/249‑1 TCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAGCTTGATCGCTTTAGA < 2:385733/249‑1 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GGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAGCTTGATCGCTTTAGAGTTCCATCC > 2:1071426/1‑249 GAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAGCTTGATCGCTTTAGAGTTCCATCCC < 2:331666/249‑1 TCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAGCTTGATCGCTTTAGAGTTCCATCCCTTG < 1:1395278/249‑1 CAGCACGAATTGTCTATGTGGCACGTGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAGCTTGATCGCTTTAGAGTTCCATCCCTTGAAGAGA < 1:1551458/249‑1 CACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAGCTTGATCGCTTTAGAGTTCCATCCCTTGAAGAGAAAT < 2:626957/249‑1 TTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAGCTTGATCGCTTTAGAGTTCCATCCCTTGAAGAGAAATTATCTG < 2:478184/249‑1 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CP025533/372425‑372681‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cacgaattgTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAGCTTGATCGCTTTAGAGTTCCATCCCTTGAAGAGAAATTATCTGCT > CP025533/372700‑372947 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |