| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | CP025533 | 421,428 | G→A | A21V (GCA→GTA) | CYL77_02075 ← | DUF2505 domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP025533 | 421,428 | 0 | G | A | 99.4% | 727.4 / NA | 176 | A21V (GCA→GTA) | CYL77_02075 | DUF2505 domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (78/97); minor base C (1/0); total (79/97) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.49e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
TGACGTCAGCGTTGTACTCGACGGTTGTGGCGTTGTTGGTCAGTGCAGGAACCGTGAGGACTCGCTTGACCTTCAGTGCCTGGCTGATCATTGCGCGAACTGCCTCTGGGAGGACCTCGAGTGGGAGGACCTCAAAAAGGGTTGCGGTTGCGCCACCGTCAGCTGCGGTGAACTCGTTGACCTCGCCAGCTTCGGGGGAGAGGTTCTCTGCGATGTATGCCCAGTAGGCTTCGGTGGTCAGTGCTTGGTGCACCTTGCCGACGGGCTGATTGATCGTAATGGTGTTTTCTGTACGCGTTGCCATGAGGATAAGACTACCGTTAGTGGGGTGTTGGATTCATCGCTAGCCCAGGAAATCGCCGCGATCGACGGCGTCGAACTCGATTCGGAAGTCACTTTCGCCGATCTGACGACCCTCCGCATCGGCGGAAAACCCCGCAGCGCCGTACGTTGCCAGACCACGGAGGCGCTGGTCAGCGCCATAAAA > CP025533/421186‑421672 | gACGTCAGCGTTGTACTCGACGGTTGTGGCGTTGTTGGTCAGTGCAGGAACCGTGAGGACTCGCTTGACCTTCAGTGCCTGGCTGATCATTGCGCGAACTGCCTCTGGGAGGACCTCGAGTGGGAGGACCTCAAAAAGGGTTGCGGTTGCGCCACCGTCAGCTGCGGTGAACTCGTTGACCTCGCCAGCTTCGGGGGAGAGGTTCTCTGCGATGTATGCCCAGTAGGCTTCGGTGGTCAGTACTTGGTg < 2:289874/249‑1 (MQ=255) cGTCAGCGTTGTACTCGACGGTTGTGGCGGTGGTGGTCAGTGCAGGAACCGTGAGGACTCGCTTGACCTTCAGTGCCTGGCTGATCATTGCGCGAACTGCCTCTGGGAGGACCTCGAGTGGGAGGACCTCAAAAAGGGTTGCGGTTGCGCCACCGTCAGCTGCGGTGAACTCGTTGACCTCGCCAGCTTCGGGGGAGAGGTTCTCTGCGATGTATGCCCAGTAGGCTTCGGTGGTCAGTACTTGGTGCa < 2:527184/249‑1 (MQ=255) gTCAGCGTTGTACTCGACGGTTGTGGCGTTGTTGGTCAGTGCAGGAACCGTGAGGACTCGCTTGACCTTCAGTGCCTGGCTGATCATTGCGCGAACTGCCTCTGGGAGGACCTCGAGTGGGAGGACCTCAAAAAGGGTTGCGGTTGCGCCACCGTCAGCTGCGGTGAACTCGTTGACCTCGCCAGCTTCGGGGGAGAGGTTCTCTGCGATGTATGCCCAGTGGGCTTCGGTGGTCAGTACTTGGTGCAc > 2:1559874/1‑249 (MQ=255) gTCAGCGTTGTACTCGACGGTTGTGGCGTTGTTGGTCAGTGCAGGAACCGTGAGGACTCGCTTGACCTTCAGTGCCTGGCTGATCATTGCGCGAACTGCCTCTGGGAGGACCTCGAGTGGGAGGACCTCAAAAAGGGTTGCGGTTGCGCCACCGTCAGCTGCGGTGAACTCGTTGACCTCGCCAGCTTCGGGGGAGAGGTTCTCTGCGATGTATGCCCAGTAGGCTTCGGTGGTCAGTACTTGGTGCAc < 2:1080559/249‑1 (MQ=255) 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TGACGTCAGCGTTGTACTCGACGGTTGTGGCGTTGTTGGTCAGTGCAGGAACCGTGAGGACTCGCTTGACCTTCAGTGCCTGGCTGATCATTGCGCGAACTGCCTCTGGGAGGACCTCGAGTGGGAGGACCTCAAAAAGGGTTGCGGTTGCGCCACCGTCAGCTGCGGTGAACTCGTTGACCTCGCCAGCTTCGGGGGAGAGGTTCTCTGCGATGTATGCCCAGTAGGCTTCGGTGGTCAGTGCTTGGTGCACCTTGCCGACGGGCTGATTGATCGTAATGGTGTTTTCTGTACGCGTTGCCATGAGGATAAGACTACCGTTAGTGGGGTGTTGGATTCATCGCTAGCCCAGGAAATCGCCGCGATCGACGGCGTCGAACTCGATTCGGAAGTCACTTTCGCCGATCTGACGACCCTCCGCATCGGCGGAAAACCCCGCAGCGCCGTACGTTGCCAGACCACGGAGGCGCTGGTCAGCGCCATAAAA > CP025533/421186‑421672 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |