| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP025533 | = 612724 | 3 (0.020) | 111 (0.870) | 98/496 | 0.2 | 97.4% | coding (334/1617 nt) | groL | molecular chaperone GroEL |
| ? | CP025533 | = 2632710 | NA (NA) | intergenic (‑129/‑113) | CYL77_12475/CYL77_12480 | ISL3 family transposase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
CCTCGGCCCACGCGGCCGTAACGTGGTTCTTGATAAGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP025533/612477‑612724‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCGAAGCAGACGCACT < CP025533/2632710‑2632466 CCTCGGCCCACGCGGCCGTAACGTGGTTCTTGATAAGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCG > 2:309803/1‑249 TCGGCCCACGCGGCCGTAACGTGGTTCTTGATAAGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGC > 1:1048166/1‑249 CGGCCCACGCGGCCGTAACGTGGTTCTTGATAAGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCC < 1:1232277/249‑1 GCCCACGCGGCCGTAACGTGGTTCTTGATAAGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCT > 2:1177283/1‑249 CCCACGCGGCCGTAACGTGGTTCTTGATAAGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTT < 2:578645/249‑1 CCCACGCGGCCGTAACGTGGTTCTTGATAAGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTT > 2:1183774/1‑249 GCGGCCGTAACGTGGTTCTTGATAAGGCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGT < 1:664736/249‑1 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GCATTCGGCGGACCTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGC < 1:804049/249‑1 CTCTGGTCACCAACGACGGTGTCAGCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGAC < 2:310255/249‑1 CTCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGAC > 1:345018/1‑249 nCTGGTCACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACC < 2:1054278/248‑1 ACCAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAAT > 2:626209/1‑249 CAACGACGGTGTCACCATTGCCCGCGACATCGACCTTGAGGATCCTTTTGAGAACCTCGGTGCGCAGCTGGTGAAGTCCGTTGCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAA < 2:421853/249‑1 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GCTGTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGG < 1:1014800/249‑1 GTTAAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAGGCTAACCAAACACCAACAAAACGCTCTACCCATGAGGTCTACCGGCca > 2:447785/1‑247 AAGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACAT > 1:931413/1‑249 AGACCAACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATC > 2:1195391/1‑249 AACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGC > 2:960276/1‑249 ACGACATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCT < 1:1010515/249‑1 ATCGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACAC > 2:333301/1‑249 CGCTGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCA < 2:352577/249‑1 nGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCT < 1:85732/248‑1 nGGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCT < 2:937369/248‑1 GGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTG < 2:952403/249‑1 GGTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACACCACAGCACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGTTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTG > 2:186389/1‑249 GTGACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGC > 1:994127/1‑249 TGACGGCAGCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCC < 1:5846/249‑1 GACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCG > 2:594673/1‑249 GACGGCACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACAGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCG > 2:1215852/1‑249 ACCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGC > 1:95449/1‑249 CCACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCG < 1:692164/249‑1 CACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAGCCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGG > 2:926185/1‑249 CACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGG < 1:622520/249‑1 CACGACTGCAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGG < 2:422694/249‑1 CAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGCACTAGGA > 2:226929/1‑249 CAACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTATAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGA < 2:1157651/249‑1 AACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGAC < 1:197374/249‑1 ACTCTGCTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACT > 1:613163/1‑249 CTTGCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCAT < 1:415323/249‑1 GCTCAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCAC > 1:663852/1‑249 CAGGCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGG > 2:313607/1‑249 GCACTCATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGC < 1:1122232/249‑1 CATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCG < 2:50161/249‑1 ATTGCTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGA > 2:719146/1‑249 CTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCn > 2:362286/1‑248 CTGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCn > 1:931856/1‑248 TGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAG > 1:208460/1‑249 TGAAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAG > 1:468777/1‑249 AAGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGT < 2:232461/249‑1 AGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTG < 1:1115692/249‑1 AGGCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTG < 2:1252345/249‑1 GCCTGCGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGAT < 2:115113/249‑1 CGCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACAC > 2:793062/1‑249 GCAACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACC < 1:25457/249‑1 AACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCT > 2:49438/1‑249 ACGTTGCTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTG < 1:1090262/249‑1 CTGCTGGCGCAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCGAn > 1:489411/1‑248 CAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCGAAGCAGACGCA < 1:648199/249‑1 CAAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCCAAGCAGACGCA > 2:734096/1‑249 AAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGCTTACACCCTGACCGAACCAGACGCAC > 1:1054499/1‑249 AAACCGGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACAGCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCGAAGCAGACGCAC < 2:892048/249‑1 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CP025533/612477‑612724‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGCCCTTCCGGTTTTGGGGTACATCACAGAACCTGGGCTAGCGGTGTAGACCCGAAAATAAACGAGCCTTTTGTCAGGGTTAAGGTTTAGGTATCTAAGCTAACCAAACACCAACAAAAGGCTCTACCCATGAAGTCTACCGGCAACATCATCGCTGACACCATCTGCCGCACTGCGGAACTAGGACTCACCATCACCGGCGCTTCCGATGCAGGTGATTACACCCTGATCGAAGCAGACGCACT < CP025533/2632710‑2632466 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |