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Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
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AGGGGCCTTTTGTTGTCTTCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGAT < 1:771368/249‑1 CCTTTTGTTGTCTTCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATT > 1:677418/1‑249 CTTTTGTTGTCTTCTTCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTC < 1:803747/249‑1 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nnTCTCCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTGTGG < 1:41982/247‑1 CCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTGTGGTTGAn > 2:86382/1‑248 CCTGGAGGCTATTTAAGAAGTTTAAATTGTGTCCATGAGTTCGCTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTGTGGTTGAA < 1:1154007/249‑1 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cTCGAGCTAAATTAGACGTCGCGTGCGATCAGATCGTCCAAGTTCTCTGGGGAGAGCAGGTATGGAGCAACTTCGAGGACGGTGAAAGCTCCGCTTTGGCCCTGCTGCTTCATGCGGTGAGCTGCGCGACCGAAAGCGATCTGTGAGGAAGCGGTGAAATCTGGGTTTCGGTCCAGCTTGAGGATGTATTCCACGGTGTGGTTGAAGCCACCGGTGTCGCCGGTGGTAATCACGTGGCCACCGTGTGGC > CP025533/2793967‑2794214 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |