New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | CP025533 | = 273426 | 147 (1.160) | 125 (1.000) +GCTA |
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Only 100 of 276 total aligned reads displayed.
CCGAATTCGACAAGGCAATCACCGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTAAAAACTCCGCTTGAGTGCTACACTTTAAGCGGGGTTTTAATGTTTGAGGGGCGATGGGGGTCGAGCTTGTGAAGTGGAATTTTCCACAAGTTTTAAGTTTCTTTAGCAGGGGAAACACTGCTGATAGCACTAGCGATAAAGAACATGAAAATGCAACGGAGCTAGCGGCCGAAGCTTTAGCGGATGTCATTTTTCAGTGGAAAAACTGGGTCTACCGACGCGTTGATAGTGTGC > CP025533/273179‑273673 | gAATTCGACAAGGCAATCACCGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTaaaaa > 1:417466/1‑249 (MQ=255) 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gCAATCACCGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTaaa > 1:1160044/1‑249 (MQ=255) cAATCACCGTGGACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaag < 1:184177‑M1/249‑17 (MQ=255) ggACCAGGCGCAGGAGATCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTAAAAACTCCGCTTg < 2:46723/249‑1 (MQ=255) 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gagaTCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaagatgtaacaatggctacagttgaa < 1:1010197‑M1/249‑40 (MQ=255) gagaTCTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTAAAAACTCCGCTTGAGTGCTACACttt < 2:335167/249‑1 (MQ=255) cTTGGGTGCCGCTTCAGGCGTCAAGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaagatgtaacaatggctacagttgaaaattt > 1:347521‑M1/1‑205 (MQ=255) 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aGCTTGTCGACGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTAAAAACTCCGCTTGAGTGCTACACTTTAAGCGGGGTTTTAATGTTTGAGGGGCGa < 2:123173/249‑1 (MQ=255) cGTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaagatgtaacaatggctacagttgaaaatttcaatgaacttcccgcacacgtatggccacgcaa > 1:220890‑M1/1‑172 (MQ=255) gTCCCAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaagatgtaacaatggctacagttgaaaatttcaatgaacttcccgcacacgtatggccacgcaat < 1:279327‑M1/249‑79 (MQ=255) 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ccAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTAAAAACTCCGCTTGAGTGCTACACTTTAAGCGGGGTTTTAATGTTTGAGGGGCGATGGGGGTCGAGCtt < 2:330554/249‑1 (MQ=255) cAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAgctagcaccggagaagatgtaacaatggctacagttgaaaatttcaatgaacttcccgcacacgtatggccacgcaatgccg > 2:285921‑M1/1‑167 (MQ=255) cAACCCCACTTGCAGCTGCCGGCATTGACGAATCCCTCGTTGGACGCATCCGTCAGGACTCCACTGTCGACGATAACCGCGGTCTGGTTCTCGTCGTATCTGGCGACAACCTCCGCAAGGGTGCTGCGCTAAACACCATCCAGATCGCTGAGCTGCTGGTTAAGTAAAAACCCGCCATTAAAAACTCCGCTTGAGTGCTACACTTTAAGCGGGGTTTTAATGTTTGAGGGGCGATGGGGGTCGAGCTtg > 2:808336/1‑249 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |