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Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
AATAGGCTCCGCAGCTGGCTCCGGCTCCACATCTGGAACTGGAGTTTCCTCCAGCGCAGCTTCCGCAGATTCCACAGCAACCTGAGCAGCCTCTGCAGCCTCGGTGACCTCAGCAACTGCCGCAAGTTCTTCAACTGCAGGTTCTTCGATTGTTTCGGGAACTTCCGCTACTGCAGGTTCCTCAACAACTGCAGGTTCCTCTGCTACTGCAGGTTCCTCAACAATTGCTGGTTCCTCTGCTACTGCAGGTTCCTCTGCTACTGCAGGTTCCTCTGCTACTGCAGGTTCCTCAACAATTGCTGGTTCCTCTGCTACTGCAGGTTCTTCAACAACTGCTGGCTCTTCAGTTTCGACCTCTGGCTCAACAGCGACAACTTCTTTAACCTCAGGCTCCTTAACTTCTGGTTCCTCGACAACATCATCAGAGGTTTCTGGTTCAGGAGTTGCAGGTGCTTCTTCAGCAGGCTTTTGAGCTGCGAAAGTTTCAGTCGATTG > CP025533/2180462‑2180956 | cgccggcacgatctcatcaataggctccgcagctggctccggctccacatctggaactggagtttcctccagcgcagcttccgcagattccacagcaacctgagcagcctctgcagcctcggtgacctcagcaactgccgcaagttcttcaactgcaggttcttcgattgtttcgggaacttccgctactgcaggttcctcaacaactgcaggttcctctgccactgcaggttcctcaacaattgctgg < 2:975279‑M1/2‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |