| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP025533 | = 497710 | 105 (0.830) | 6 (0.070) | 6/346 | 15.8 | 7.2% | intergenic (+2/‑251) | CYL77_02460/CYL77_02465 | tRNA‑Thr/tRNA‑Thr |
| ? | CP025533 | 498036 = | 82 (0.930) | intergenic (+3/‑36) | CYL77_02465/CYL77_02470 | tRNA‑Thr/tRNA‑Met | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
CGTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTACCGCGGATGAAACCGCTTCTAACTGCAAATTTTTTGAGGTTAGAAGCGGTGTTTTCGCAAATTGACAGGCTGATGGTAACATTGCCTGTGCTCCATAGGGGCGTAGCTCAATTGGCAGAGCAACGGTCTCCAAAACCGTAG > CP025533/497791‑498284 | cGTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAACGAGCCTGACGTCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTg < 2:1048466/249‑1 (MQ=255) gAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCtt < 1:542450/249‑1 (MQ=255) gTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAACTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCg < 1:1158804/249‑1 (MQ=255) cAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTann > 1:539098/1‑247 (MQ=255) aGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAGTTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAagn > 1:464259/1‑248 (MQ=255) aGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAagn > 2:142523/1‑248 (MQ=255) ccACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGAt > 2:1196269/1‑249 (MQ=255) gCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAATCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACCGCATTTCCAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAg < 2:1098573/249‑1 (MQ=255) aTCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCa > 1:1046400/1‑249 (MQ=255) cAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAAtgt > 2:1036279/1‑249 (MQ=255) cAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAAtgt > 1:681586/1‑249 (MQ=255) aGTAGCGGTGCAACTTAATCCAATAATTCATTTCGCTTAATTCAGGTTTGTGTTGTGGTAGCGGTTCTGGTTAAAGTTATTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGAACTTGATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAAtgtg < 2:324968/249‑1 (MQ=37) tGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGgtgtn > 2:41582/1‑248 (MQ=255) gCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAg > 2:653483/1‑249 (MQ=255) tttAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCa < 2:591393/249‑1 (MQ=255) aGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTagag > 2:319404/1‑249 (MQ=255) aaaaCCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCa > 2:791698/1‑249 (MQ=255) aaaaCCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCa > 1:331945/1‑249 (MQ=255) aaCCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAg > 2:879754/1‑249 (MQ=255) ccTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCg > 1:363806/1‑249 (MQ=255) cTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATa > 1:415773/1‑249 (MQ=255) ttCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATaa > 1:432941/1‑249 (MQ=255) ccgtcAGTTTTTTGTTGTGGTAGCGGTTCGGTTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACCGGCTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATc < 1:1193334/245‑1 (MQ=255) aGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCtgt > 2:612171/1‑249 (MQ=255) ttGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTcg > 1:1054615/1‑249 (MQ=255) tgtgTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTcgc > 1:303124/1‑249 (MQ=255) tgtgTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTcgc > 2:655482/1‑249 (MQ=255) gtgtTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTcgcg < 1:745195/249‑1 (MQ=255) 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tAAAGTTATTCAGGCTTCAACGGAGCGTAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTTAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTa < 2:436383/249‑1 (MQ=255) aaaGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCGTCGCtca > 2:667110/1‑247 (MQ=255) aGTTCCTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTACcg < 1:1102530/249‑1 (MQ=255) 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ttAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTAGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCATTCGCTACCGCGGAt > 2:1154728/1‑249 (MQ=255) aaGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTACCGCGGATGa > 2:211110/1‑249 (MQ=255) aGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTATGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTAGAGCACTGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGGCTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTACCGCGGATgca > 2:295898/1‑247 (MQ=255) cTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTACCGCGGATGAAAcc < 2:462799/249‑1 (MQ=255) cTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTACCGCGGATGAAAcc > 2:536824/1‑249 (MQ=255) cAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTACCGCGGATGAAACCGCt > 1:915522/1‑249 (MQ=255) 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cAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTACCGCGGATGAAACCGCTTCTAACTGCa > 1:3674/1‑249 (MQ=255) cGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTACCGCGGATGAAACCGCTTCTAACTGCAAAt < 2:329369/249‑1 (MQ=255) aGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTACCGCGGATGAAACCGCTTCTAACTGCAAAttttt > 1:1132345/1‑249 (MQ=255) 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CGTGAGTTTTTAGTTTCAGGCCACATGCATCGCAGTAGGGGTGCAATTTAATCCAAGAAAACCTTTAGCTTCCTGCAGATTTGTGTTGCGGTAGCGGTTCGGGTTAAAGTTCTTAAGGCTTCAACGGAGCGCAGCGGTAGTTATACGGACTGCATTTCAAAGAGCTTGACGCCCCCTTAGCTCAGTCGGTAGAGCGTTTCCATGGTAAGGAAAAGGTCAACAGTTCGATTCTGTTAGGGGGCTCTGTTGCTTTTATTCTCGTAAGAGATGTTGAGCAATGTGGCGGTGTAGCTCAGTGGTAGAGCAAGCGACTCATAATCGCTGTGTCGCGAGTTCAATTCTCGCCATCGCTACCGCGGATGAAACCGCTTCTAACTGCAAATTTTTTGAGGTTAGAAGCGGTGTTTTCGCAAATTGACAGGCTGATGGTAACATTGCCTGTGCTCCATAGGGGCGTAGCTCAATTGGCAGAGCAACGGTCTCCAAAACCGTAG > CP025533/497791‑498284 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |