Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP025533 | 1,177,120 | 0 | T | G | 30.2% | 246.8 / 18.4 | 107 | N259T (AAC→ACC) | kgd | 2‑oxoglutarate dehydrogenase E1/E2 component |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (17/57); new base G (32/0); total (50/57) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.94e-15 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
CCCAGAAGGAATCATCGGTGAGCAGGCGAGACATGGTGCGCAGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCTGAGGAAGGTCGATAGCAAGGCCCAGGTTGATGTGCTCAGGCACGATCAGGGTTGGCTTGCCGTCGATGACGTCGTAGGAGTTGTTCAT > CP025533/1176872‑1177367 | cccAGAAGGAATCATCGGTGAGCAGGCGAGACATGGTGCGCAGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGt < 2:211159/249‑1 (MQ=255) cccAGAAGGAATCATCGGTGAGCAGGCGAGACATGGTGCGCAGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGt < 1:837221/249‑1 (MQ=255) cccAGAAGGAATCATCGGTGAGCAGGCGAGACATGGTGCGCAGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCCCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGAGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGt < 1:1100467/249‑1 (MQ=255) ccAGAAGGAATCATCGGTGAGCAGGCGAGACATGGTGCGCAGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTGCCGATG‑CCACCTGGGtt > 1:1209093/1‑249 (MQ=255) cAGAAGGAATCATCGGTGAGCAGGCGAGACATGGTGCGCAGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTg < 1:1061724/249‑1 (MQ=255) aGAAGGAATCATCGGTGAGCAGGCGAGACATGGTGCGCAGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCCGGGTTgg > 1:264954/1‑249 (MQ=255) aGAAGGAATCATCGGTGAGCAGGCGAGACATGGTGCGCAGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTAACGATG‑GCACCCGGGGTgg > 1:475220/1‑249 (MQ=255) aGGCGAGACATGGTGCGCAGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTGCCGATG‑CCCCCCGGGGTGGTCAAAGAAAAGGGGACGccc > 2:1190788/1‑249 (MQ=255) aGGCGAGACATGGTGCGCAGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGCAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGCGGCGGTAACCGCTG‑CCCCCCGGGATGGTTAATGGAACGGtcatgcac > 1:244045/1‑242 (MQ=255) ggCGAGACATGGTGCGCAGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCCGTG‑CCACCTGGGGTGGTCGAGGAAACGGGGACACCCt > 1:242873/1‑249 (MQ=255) agaCATGGTGCGCAGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTGCCGAAG‑CCCCCCGGGGTGGTCAAGGAAACGGGAAGGCCCCGGtg > 2:397384/1‑248 (MQ=255) agaCATGGTGCGCAGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTa < 1:172812/249‑1 (MQ=255) tGGTGCGCAGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCCGGGTTGGTCGAGGGAACGGGAACGCCCTGGTAGTC‑At > 1:1123974/1‑249 (MQ=255) ggTGCGCAGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGGACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGGGACGGGAACGCCCTGGTAgggagc > 2:554531/1‑244 (MQ=255) cgcAGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATg < 1:89284/249‑1 (MQ=255) cgcAGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCCGGGGTGGGCAAGGAAACGGTAACGGCCTCGTAGTC‑ATCCATg > 2:628453/1‑249 (MQ=255) cAGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGt < 2:142193/249‑1 (MQ=255) cAGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGt < 2:1193559/249‑1 (MQ=255) cAGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCCATG‑CCACCCAGGGTTGTCAAGGAAAAGGTAACACCCCGGTAATCTATCCATgt > 1:442787/1‑248 (MQ=255) aGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTg > 1:30170/1‑249 (MQ=255) aGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTg < 1:1182150/249‑1 (MQ=255) tCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTg < 1:564359/249‑1 (MQ=255) cACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCCGGGTTGGGCCAGGAAACGGTAACGCCCCGGGAGTC‑ATCCATGGTGGGGTTGc > 1:718984/1‑249 (MQ=255) cACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTAACGATG‑CCCCCTGGGGTGGTCAAGGAAAAGGTAACGCCCCGGTGGGC‑ATTCCTGGGGGGCTTGc > 1:819812/1‑249 (MQ=255) cGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTGCCGCTG‑CCACCCGGGGTGGTGAAGGGAAAGGGAAAGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGGGCTTGCCCt > 2:677476/1‑249 (MQ=255) acaGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCCGGGGTGGTCAAGGAAACGGTAAAGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCgg > 1:428348/1‑249 (MQ=255) cACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGc < 1:1067477/249‑1 (MQ=255) aCCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑ACACCCGGGGTGGTCAAGGAAACGGGGAAGCCCTGGTAGTC‑ATCCCTGGGGTGGTTGCCCTTGCGGGAGCg > 2:587674/1‑249 (MQ=255) ccTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGCTG‑CCCCCCGGGGTGGTGCAGGAAACGGGAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCACGGTGAGCTTGCCCCTGCGGGAGCGTg > 2:1074094/1‑249 (MQ=255) tCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCCGGGGTGGGCCAGGGAACGGGAAAGCCCTGGTAGGC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGa > 1:59647/1‑249 (MQ=255) cgcgGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGGTG‑CCACCTGGGGTGGGGGAGGAAAAGGGAAAGCCCGTGTAGTC‑GTCCCATGTGGGGTTGCCCTTGCGGGAGGGTGGCGCGgtgt > 2:1166707/1‑249 (MQ=255) cgcgGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGGTGGGCAAGGAAAAGGGGAAGCCCTGGTAGGC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGGGCCACGATGt > 1:671652/1‑249 (MQ=255) cgGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTATCGATG‑CCACCTGGGGTGGTCAAGGGAACGGGAACGCCCCGGTTGTC‑ATCCATGGTGTGCTTGCCCTTTCGGGGGCGTGCCACGATGTCt > 1:496009/1‑249 (MQ=255) ggTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCtt < 2:914326/249‑1 (MQ=255) gTGATCGCAGGTGGAGGTGCTGGTGACAAGTGTGCCAACGGCGAGCTCGGCAAGGCGGTCTTCTGCAGCGCCCTGGCCCTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACGTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ACCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCtgc < 2:1224312/249‑3 (MQ=255) gATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGt < 2:775306/249‑1 (MQ=255) tCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAg < 1:245562/249‑1 (MQ=255) tCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAg < 2:209798/249‑1 (MQ=255) gTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCCGGGGTGGTCAAGGGAACGGTAACGCCCTGGTAGGC‑ATCCCTGGTGAGCTTGCCCCTGCGGGGGGGTGCCCCGATGTCTTCGTAGGc > 1:199567/1‑249 (MQ=255) gTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGGTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGc < 1:179378/249‑1 (MQ=255) tAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCt < 2:567493/249‑1 (MQ=255) aGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCCCGGGTGGTGAAGGAAAAGGTGACGCCCCGGTGGTC‑ATCCATGGTGGGCTTGCCCCTTCGGGGGCGGGGCACGATGTCTTCGTAGGCTg > 2:892480/1‑249 (MQ=255) tGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGa < 2:371043/249‑1 (MQ=255) ggTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCCCCCGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGGGCGGGCCCCGATGTCTTCGTAGGGTGCGGGGaa > 1:354543/1‑249 (MQ=255) gTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAAc < 1:76533/249‑1 (MQ=255) tGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACt < 2:994758/249‑1 (MQ=255) aTGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGGACCGATG‑CCACCCGGGGTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGGGCTTGCCCTTGCGGGGGCGGGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCg > 1:940965/1‑249 (MQ=255) aaGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGtt < 1:208908/249‑1 (MQ=255) aaGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGtt < 2:1222470/249‑1 (MQ=255) tttGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCAt < 2:387734/249‑1 (MQ=255) tttGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCCGGGGTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGGCCTTGCGGGGGGGTGGCACGATGTCTTCGTAGGGTGCGAGGGACTCGGAGAAggttat > 2:422138/1‑244 (MQ=255) ttGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTCGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCAtc < 1:1190788/249‑1 (MQ=255) cAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCAtcttct < 2:192474/249‑1 (MQ=255) cGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCCGGGGTGGTCAAGGGAAAGGTAACGCCCCGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTTCCCCTTCGGGGGCGTGGCACGATGTTTTCGTAGGCTGCGGGGAACTCGGGGGAGTTCATCTTCTCCGttt > 2:313997/1‑249 (MQ=255) aGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTTTCGATGCCCCCCTGGGTGTGT‑AAGGAAACAGGAAAGCCCCCGTAGTC‑ATCCATAGTGAGCTTTTCCTTGCGGGAGCGTGCACCCATGGCTTCTTTGGCTGCGAGGAACCCTGGGGAATTCATTTTCTCGGTTTcc > 2:318217/1‑249 (MQ=255) aGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTcc < 2:35777/249‑1 (MQ=255) aGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCCGGGGTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGGGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGGTCATCTTCTCGGGTTcc > 1:347878/1‑249 (MQ=255) ctctGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCtt < 1:915673/249‑1 (MQ=255) tGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTGTCGATG‑GCCCCCGGGGTGGTCAAGGAAACGGTGAAGCCCCGGTCATG‑CTCCATGGTGAGCTTGCCCCTGTGGGGGCGTGCCGCGCTGTCTTCGTAGGGTGCGGGGGAGGCCGTGAAGTTCATGATCTCGGTTTCCTTGA‑t > 2:12914/1‑249 (MQ=255) cAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCCGGGGTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑Tgg > 1:886462/1‑249 (MQ=255) cGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCCCCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAAAGCCCTGGTAGTC‑ATCCACGGTGGGCTTGCCCTTTCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTTCTAGGCGGCGAGGGACTCGGAGAAAGTCCTCTTCTCTGTTTTCTTGA‑TGgctgat > 1:428399/1‑247 (MQ=255) cGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGgctgct < 1:848912/249‑1 (MQ=255) tcttctGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACg < 1:28903/249‑1 (MQ=255) cttctGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCCGGGTTGGTCAAGGAAACGGGAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGGGCTTGCCCTTGCGGGGGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGGTGCGAGGGACTCGGGGAAGGTCATCTTCTCGGTTTTCTTGA‑TGGCTGGTACgg > 1:1165157/1‑248 (MQ=255) aaGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTg < 1:628453/249‑1 (MQ=255) aaGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGGACCGAAT‑CCCCCCGGGGTGGGCAAGGGAACGGTGACGCCCTGGGAGTG‑CTCCATTGGGTGCTTGCCCCTGCCGGGGCGGGCCACGATGTCTTCCTTGGGATCGGGGGGATCCGGGGAGGTCATCTTCTCGGTGTTCTTGA‑TGGGTGCTACGACAAGTg > 2:563899/1‑249 (MQ=255) cccTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCgg < 2:1057799/249‑1 (MQ=255) cccTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCgg < 1:259818/249‑1 (MQ=255) cTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGa < 2:121633/249‑1 (MQ=255) cTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGa < 1:1019867/249‑1 (MQ=255) gAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCCGGGGTGGTCAAGGAAAAGGTAACGCCCCGGTAATC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGcc > 1:765442/1‑249 (MQ=255) aaCTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCg < 2:30170/249‑1 (MQ=255) nngctgGGGAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCt < 1:191139/247‑1 (MQ=255) ctgctgGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGGTGGTCAAGGAAAAGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCCTGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGGGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGGGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAATGCGCGGGGGCCGTCCt > 1:839007/1‑249 (MQ=255) ctgGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCt < 1:1175670/249‑1 (MQ=255) tgGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGGTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCCTTCGGGGGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCTg > 1:673739/1‑249 (MQ=255) ggTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCTGAg < 2:306946/249‑1 (MQ=255) gTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGACGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCTGAgg < 1:40158/249‑1 (MQ=255) tAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGGACCGATG‑CCCCCCGGGTTGGTCAAGGAAAAGGGAACGCCCTGGTAGTT‑ATCCATGGTGGGCTTTCCCTTTCGGGGGGGTGCCACGATGTCTTCGTTGGCTGCGGGGAAACCGGAGAAAGTTAACCTCTCGGTTTCCTTTATTGGGTG‑TACGGCAAATTCGGGGGGGGCGGCCTTCttcgga > 2:241310/1‑244 (MQ=255) aTGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCTGAGGAAGGTCg < 2:1042130/249‑1 (MQ=255) ccGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCTGAGGAAGGTCGATAGCa < 1:659966/249‑1 (MQ=255) acacCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCTGAGGAAGGTCGATAGCAAgg < 1:679636/249‑1 (MQ=255) gatgGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCTGAGGAAGGTCGATAGCAAGGCCCAGGtt < 2:889047/249‑1 (MQ=255) gatgGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTAACGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCTCTTGCGGGAGCTTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCTGAGGAAGGTCGATAGCAAGGCCCAGGtt < 2:1008855/249‑1 (MQ=255) cccTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCTGAGGAAGGTCGATAGCAAGGCCCAGGTTGATGTGc < 2:1030937/249‑1 (MQ=255) ccTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGGTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGGGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGGGCCGTCCTTCTTAGGAAGGTCGATAGCAAGGCCCCGGTTGATGTGCTCAGGCa > 1:278473/1‑249 (MQ=255) cTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCTGAGGAAGGTCGATAGCAAGGCCCAGGTTGATGTGCTCAGGCAc < 1:968641/249‑1 (MQ=255) ttAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCTGAGGAAGGTCGATAGCAAGGCCCAGGTTGATGTGCTCAGGCACGATCa < 2:99848/249‑1 (MQ=255) tAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCCGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTTCGGGGGCGTGCCCCGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAAATCGGGGAAGTTCATCTTCTCGGTTTTCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGAGCGCGGGGGCCGTCCTTCTGTGGGAGGTCGATAGCAAGGCCCCGGTTGATGTGCTCAGGCACGGTCAg > 2:338926/1‑249 (MQ=255) gAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGGTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGGGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGGGCCGTCCTTCTGAGGGAAGGCGATAGCAAGGCCCAGGTTGATGTGCTCAGGCACGATCAGGGGTgggt > 1:389844/1‑247 (MQ=255) aaCAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCTGAGGAAGGTCGATAGCAAGGCCCAGGTTGATGTGCTCAGGCACGATCAGGGTTGGCtt < 2:772955/249‑1 (MQ=255) aCAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCTGAGGAAGGTCGATAGCAAGGCCCAGGTTGATGTGCTCAGGCACGATCAGGGTTGGCTTg < 1:722660/249‑1 (MQ=255) agagTGGCGGGTACCGATG‑CCACCCGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAAAGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGGTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTTGTAGGCTGCGGGGAACTCGGGGAAGTTCATCTTCTCGGTTTTCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCTTGGGAAGGGCGATAGCAAGGCCCAGGGTGATGTGGTCAGGGCCGGTCAGGGGTGGGTTGcc > 2:228659/1‑249 (MQ=255) gTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCTGAGGAAGGTCGATAGCAAGGCCCAGGTTGATGTGCTCAGGCACGATCAGGGTTGGCTTGCCGTc < 1:972989/249‑1 (MQ=255) gCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCTGAGGAAGGTCGATAGCAAGGCCCAGGTTGATGTGCTCAGGCACGATCAGGGTTGGCTTGCCGTCGAt > 2:99346/1‑249 (MQ=255) gggTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCTGAGGAAGGTCGATAGCAAGGCCCAGGTTGATGTGCTCAGGCACGATCAGGGTTGGCTTGCCGTCGATGa < 1:1569/249‑1 (MQ=255) cGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCTGAGGAAGGTCGATAGCAAGGCCCAGGTTGATGTGCTCAGGCACGATCAGGGTTGGCTTGCCGTCGATGAcgtcgt > 2:785897/1‑249 (MQ=255) ccACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCTGAGGAAGGTCGATAGCAAGGCCCAGGTTGATGTGCTCAGGCACGATCAGGGTTGACTTGCCGTCGATGACGTCGTAGGAg > 2:691490/1‑249 (MQ=255) cTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCTGAGGAAGGTCGATAGCAAGGCCCAGGTTGATGTGCTCAGGCACGATCAGGGTTGGCTTGCCGTCGATGACGTCGTAGGAgttgt < 2:442787/249‑1 (MQ=255) gTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCTGAGGAAGGTCGATAGCAAGGCCCAGGTTGATGTGCTCAGGCACGATCAGGGTTGGCTTGCCGTCGATGACGTCGTAGGAGTTGTTCAt < 1:28104/249‑1 (MQ=255) | CCCAGAAGGAATCATCGGTGAGCAGGCGAGACATGGTGCGCAGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATG‑CCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTC‑ATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGA‑TGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCTGAGGAAGGTCGATAGCAAGGCCCAGGTTGATGTGCTCAGGCACGATCAGGGTTGGCTTGCCGTCGATGACGTCGTAGGAGTTGTTCAT > CP025533/1176872‑1177367 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |