Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | CP025533 | 2,084,508 | 0 | G | T | 48.0% | 57.4 / inf | 252 | intergenic (‑10/+191) | dapA/CYL77_09945 | 4‑hydroxy‑tetrahydrodipicolinate synthase/thymidylate synthase (FAD) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (54/77); new base T (48/73); total (102/150) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.98e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.06e-01 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
CAACTTCCTCACGAACGGCCTTGAGCAGTTCTAGTTTTTCAGCGGCGGTTGTCGTTGGGGATTCACCAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGCCAAAAATGTTGTCTTAACTATATGAATTTTTAGCTCGTGGGTGTGAGCTTTGCGTTAAAAGTCCATGACATACGGGCTTGTTGCCATTTGCGATCCGTCTGCCAAAGTTTC > CP025533/2084261‑2084755 | cTTCCTCACGAACGGCCTTGAGCAGTTCTAGTTTTTCAGCGGCGGTTGTCGTTGGGGATTCACCAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTa < 2:270596/249‑1 (MQ=255) aCGAACGGCCTTGAGCAGTTCTAGTTTTTCAGCGGCGGTTGTCGTTGGGGATTCACCAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACcttctt < 1:1131647/249‑1 (MQ=255) aCGAACGGCCTTGAGCAGTTCTAGTTTTTCAGCGGCGGTTGTCGTTGGGGATTCACCAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACcttctt < 1:1229255/249‑1 (MQ=255) gAACGGCCTTGAGCAGTTCTAGTTTTTCAGCGGCGGTTGTCGTTGGGGATTCACCAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTcc < 1:1189249/249‑1 (MQ=255) aCGGCCTTGAGCAGTTCTAGTTTTTCAGCGGCGGTTGTCGTTGGGGATTCACCAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCt > 1:871520/1‑249 (MQ=255) ggCCTTGAGCAGTTCTAGTTTTTCAGCGGCGGTTGTCGTTGGGGATTCACCAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCa > 2:87995/1‑249 (MQ=255) ccTTGAGCAGTTCTAGTTTTTCAGCGGCGGTTGTCGTTGGGGATTCACCAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑tt < 1:352692/249‑1 (MQ=255) cTTGAGCAGTTCTAGTTTTTCAGCGGCGGTTGTCGTTGGGGATTCACCAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCA‑ttt > 2:1097453/1‑249 (MQ=255) ntGAGCAGTTCTAGTTTTTCAGCGGCGGTTGTCGTTGGGGATTCACCAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCA‑tttt < 1:1160409/248‑2 (MQ=255) gCAGTTCTAGTTTTTCAGCGGCGGTTGTCGTTGGGGATTCACCAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑tgggg > 2:805671/1‑249 (MQ=255) ttCTAGTTTTTCAGCGGCGGTTGTCGTTGGGGATTCACCAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTaa < 2:673937/249‑1 (MQ=255) nnaGTTTTTCAGCGGCGGGTGTCGTTGGGGATTCACCAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCATTTT‑GGGGGTTaaa < 1:1174322/247‑1 (MQ=255) tAGTTTTTCAGCGGCGGTTGTCGTTGGGGATTCACCAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAaaca > 1:1244426/1‑249 (MQ=255) tttttCAGCGGCGGTTGTCGTTGGGGATTCACCAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCATTTT‑GGGGGTTAaacaac > 2:17589/1‑249 (MQ=255) tttttCAGCGGCGGTTGTCGTTGGGGATTCACCAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAAcc > 1:579315/1‑249 (MQ=255) gcggTTGTCGTTGGGGATTCACCAGTGATGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCaaaaaa > 2:164346/1‑249 (MQ=255) ggTTGTCGTTGTGGAATCACCAGTGGTCCCGGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGTTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑TGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAAcc < 2:196176/249‑1 (MQ=255) gTCGTTGGGGATTCACCAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCATTTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTaa < 1:135292/249‑1 (MQ=255) gTTGGGGATTCACCAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTaacaac > 2:1086010/1‑249 (MQ=255) tGGGGATTCACCAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACtt < 2:500694/249‑1 (MQ=255) tGGGGATTCACCAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACtt < 2:755515/249‑1 (MQ=255) gggATTCACCAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCATTTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACttt < 2:992495/249‑1 (MQ=255) ggATTCACCAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCATTTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACtttt > 2:557305/1‑249 (MQ=255) ttCACCAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCATTTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCa > 1:1005926/1‑249 (MQ=255) tCACCAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATa > 1:255977/1‑249 (MQ=255) cACCAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCATTTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATa < 1:1125431/249‑1 (MQ=255) ccAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCATTTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAAc < 1:235920/249‑1 (MQ=255) tggtgCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCATTTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATc < 2:1171564/249‑1 (MQ=255) tggtgCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCg < 1:912428/249‑1 (MQ=255) ggtgCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGc < 1:664587/249‑1 (MQ=255) cgcgAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCATTTT‑GGGGGTTACACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAg > 1:290545/1‑249 (MQ=255) gcgAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCATTTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGc < 2:1013067/249‑1 (MQ=255) aaCCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACAtt > 2:1108211/1‑249 (MQ=255) aCCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCATTTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACAtt < 1:669832/249‑1 (MQ=255) cAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCATTTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTcc < 2:302602/249‑1 (MQ=255) aaaGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGa < 1:702585/249‑1 (MQ=255) aGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATa < 1:507389/249‑1 (MQ=255) aaTCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCATTTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATaa < 1:31021/249‑1 (MQ=255) aTCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGa < 1:994549/249‑1 (MQ=255) tCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGaa < 1:1074089/249‑1 (MQ=255) cAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCATTTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAAc < 1:852855/249‑1 (MQ=255) aaGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTCTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACaa > 2:641189/1‑249 (MQ=255) cccTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCATTTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAAtt < 1:1225396/249‑1 (MQ=255) cccTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACC‑TCTTCCCTCATTTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTg > 1:26467/1‑249 (MQ=255) cTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCATTTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCTCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGa > 1:316473/1‑249 (MQ=255) cTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGac < 1:1086010/249‑1 (MQ=255) tATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCATTTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGaca < 2:612747/249‑1 (MQ=255) aaCCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGc < 2:1071051/249‑1 (MQ=255) ccAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCATTTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCa > 2:775629/1‑249 (MQ=255) aaaTAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAaga < 1:468923/249‑1 (MQ=255) aaGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGtt > 2:283033/1‑249 (MQ=255) aGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGttt > 2:699754/1‑249 (MQ=255) ccGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGttttt > 2:534689/1‑249 (MQ=255) aCTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCA‑TTTTGGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGaattcgcgt < 2:1024552‑M2/249‑10 (MQ=255) cagcGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGc < 1:148612/249‑1 (MQ=255) agcGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGcc > 1:114917/1‑249 (MQ=255) gATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGCCaaa > 1:600921/1‑249 (MQ=255) tatCGCTGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTATGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGCCaaaaa > 2:1230168/1‑249 (MQ=255) tatCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGCCaaaaa < 2:222036/249‑1 (MQ=255) tCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCA‑TTTTGGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGaattcgcgtatggcaatgacagtttgagac < 2:723523‑M2/249‑31 (MQ=255) tCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGCCAAAAAtg < 2:749217/249‑1 (MQ=255) tGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCA‑TTTTGGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGaattcgcgtatggcaatgacagtttgagacggcc < 1:383873‑M2/249‑35 (MQ=255) tGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCA‑TTTTGGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGaattcgcgtatggcaatgacagtttgagacggcc > 1:641364‑M2/1‑215 (MQ=255) cGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCA‑TTTTGGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGaattcgcgtatggcaatgacagtttgagacggccacaggc < 2:416198‑M2/249‑41 (MQ=255) ccGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCA‑TTTTGGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGaattcgcgtatggcaatgacagtttgagacggccacaggcgatgct < 2:323733‑M2/249‑47 (MQ=255) gTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGCCAAAAATGTTGTCTTAACTATATGaa < 1:1065555/249‑1 (MQ=255) tGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGCCAAAAATGTTGTCTTAACTATATGAAt > 2:938574/1‑249 (MQ=255) aTGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCA‑TTTTGGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGaattcgcgtatggcaatgacagtttgagacggccacaggcgattctgagaag < 1:44843‑M2/249‑53 (MQ=255) aTGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGCCAAAAATGTTGTCTTAACTATATGAAtttt < 2:442187/249‑1 (MQ=255) aTGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGCCAAAAATGTTGTCTTAACTATATGAAtttt > 1:1017147/1‑249 (MQ=255) ggAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGCCAAAAATGTTGTCTTAACTATATGAAtttttn > 2:685503/1‑248 (MQ=255) cTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCA‑TTTTGGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGaattcgcgtatggcaatgacagtttgagacggccacaggcgattctgagaagccattttctttgggc < 1:49523‑M2/249‑68 (MQ=255) cTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCA‑TTTTGGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGaattcgcgcatggcaatgacagtttgagacggccacaggcgattctgagaagccattttctttgggc > 2:592061‑M2/1‑182 (MQ=255) cTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGCCAAAAATGTTGTCTTAACTATATGAATTTTTAGCTCGTGGGtgtg < 1:723370/249‑1 (MQ=255) tACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGCCAAAAATGTTGTCTTAACTATATGAATTTTTAGCTCGTGGGtgtgn > 1:638139/1‑248 (MQ=255) nacTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCA‑TTTTGGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCTCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGaattcgcgtatggcaatgacagtttgagacggccacaggcgattctgagaagccattttctttgggcg > 2:316473‑M2/2‑181 (MQ=255) tCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCA‑TTTTGGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGaattcgcgtatggcaatgacagtttgagacggccacaggcgattctgagaagccattttctttgggcgccg < 1:906502‑M2/249‑72 (MQ=255) tCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGCCAAAAATGTTGTCTTAACTATATGAATTTTTAGCTCGTGGGTGTGAGCt > 1:586467/1‑249 (MQ=255) cAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGCCAAAAATGTTGTCTTAACTATATGAATTTTTAGCTCGTGGGTGTGAGCttt < 2:427583/249‑1 (MQ=255) tGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGCCAAAAATGTTGTCTTAACTATATGAATTTTTAGCTCGTGGGTGTGAGCTTTGCGTTa > 1:704609/1‑249 (MQ=255) tGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGCCAAAAATGTTGTCTTAACTATATGAATTTTTAGCTCGTGGGTGTGAGCTTTGCGTTa > 2:1047082/1‑249 (MQ=255) ccGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGCCAAAAATGTTGTCTTAACTATATGAATTTTTAGCTCGTGGGTGTGAGCTTTGCGTTaaa > 2:729309/1‑249 (MQ=255) cGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCA‑TTTTGGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGaattcgcgtatggcaatgacagtttgagacggccacaggcgattctgagaagccattttctttgggcgccgtggcagttttt > 2:1148090‑M2/1‑167 (MQ=255) aaGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCA‑TTTTGGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGaattcgcgtatggcaatgacagtttgagacggccacaggcgattctgagaagccattttctttgggcgccgtggcagtttttat < 2:1251036‑M2/249‑85 (MQ=255) nnactACGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTTCTCATAGAGTTCAATTATACCATCTTCTCTCA‑TTTTGGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTCTGCATAACATTCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGaattcgcgtatggcaatgacagtttgagacggccacaggcgattctgagaagccattttctttgggcgccgtggcagtttttattgggtcc > 2:402610‑M2/3‑158 (MQ=255) tCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGCCAAAAATGTTGTCTTAACTATATGAATTTTTAGCTCGTGGGTGTGAGCTTTGCGTTAAAAGTCCATGACATAc > 1:1093211/1‑249 (MQ=255) ggTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCA‑TTTTGGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGaattcgcgtatggcaatgacagtttgagacggccacaggcgattctgagaagccattttctttgggcgccgtggcagtttttattgggtcccaccgcc > 1:805671‑M2/1‑151 (MQ=255) cTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCA‑TTTTGGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGaattcgcgtatggcaatgacagtttgagacggccacaggcgattctgagaagccattttctttgggcgccgtggcagtttttattgggtcccaccgccgaa < 1:1255489‑M2/249‑102 (MQ=255) ttAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCA‑TTTTGGGGGTTAAACAACCAAAAAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGaattcgcgtatggcaatgacagtttgagacggccacaggcgattctgagaagccattttctttgggcgccgtggcagtttttattggatcacaccgccgaac < 2:458001‑M2/249‑103 (MQ=255) ntAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGCCAAAAATGTTGTCTTAACTATATGAATTTTTAGCTCGTGGGTGTGAGCTTTGCGTTAAAAGTCCATGACATACGGGCttg < 1:322444/248‑1 (MQ=255) ntAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGCCAAAAATGTTGTCTTAACTATATGAATTTTTAGCTCGTGGGTGTGAGCTTTGCGTTAAAAGTCCATGACATACGGGCttg < 2:1219742/248‑1 (MQ=255) gCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGCCAAAAATGTTGTCTTAACTATATGAATTTTTAGCTCGTGGGTGTGAGCTTTGCGTTAAAAGTCCATGACATACGGGCttgttg > 1:212274/1‑249 (MQ=255) ttAAACCTGTGCTCATACAGTTCAATGATACCTTCTTCCCTCA‑TTTTGGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGaattcgcgtatggcaatgacagtttgagacggccacaggcgattctgagaagccattttctttgggcgccgtggcagtttttattgggtcccaccgccgaactgcatat > 1:172740‑M2/1‑140 (MQ=255) aaCCTGTGCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCA‑TTTTGGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGaattcgcgtatggcaatgacagtttgagacggccacaggcgattctgagaagccattttctttgggcgccgtggcagtttttattgggtcccaccgccgaactgcatattcg < 2:1194276‑M2/249‑113 (MQ=255) aCCAGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTACCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCTATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGCCAAAAATGTTGTCTTAACTATATGAATTTTTAGCTCGTGGGTGTGAGCTTTGCGTTAAAAGTCCATGACATACGGGCTTGTTGCCATTTGc < 2:865065/249‑1 (MQ=255) gCTCATAGAGTTCAATTATACCTTCTTCCCTCA‑TTTTGGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGaattcgcgtatggcaatgacagtttgagacggccacaggcgattctgagaagccattttctttgggcgccgtggcagtttgtattgggtcccaccgccgaactgcatattcgaaccaag < 1:777904‑M2/249‑120 (MQ=255) cATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGCCAAAAATGTTGTCTTAACTATATGAATTTTTAGCTCGTGGGTGTGAGCTTTGCGTTAAAAGTCCATGACATACGGGCTTGTTGCCATTTGCGATCCGTCt > 1:736775/1‑249 (MQ=255) agagTTCAATTATACCTTCTTCCCTCA‑TTTTGGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGaattcgcgtatggcaatgacagtttgagacggccacaggcgattctgagaagccattttctttgggcgccgtggcagtttttattgggtcccaccgccgaactgcatattcgaaccaaggagcct < 2:919319‑M2/249‑126 (MQ=255) agagTTCAATTATACCT‑CTTCCCTCA‑TTTTGGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGaattcgcgtatggcaatgacagtttgagacggccacaggcgattctgagaagccattttctttgggcgccgtggcagtttttattgggtcccaccgccgaactgcatattcgaaccaaggagcctc > 2:26467‑M2/1‑123 (MQ=255) agagTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGCCAAAAATGTTGTCTTAACTATATGAATTTTTAGCTCGTGGGTGTGAGCTTTGCGTTAAAAGTCCATGACATACGGGCTTGTTGCCATTTGCGATCCGTCTGcc < 2:888948/249‑1 (MQ=255) | CAACTTCCTCACGAACGGCCTTGAGCAGTTCTAGTTTTTCAGCGGCGGTTGTCGTTGGGGATTCACCAGTGGTGCCCGCGAGAACCAAAGAATCCAAGCCCTTATCAACCAAATAAGCCGCGACTTCGCGGCCAGCAGCGATATCGATGTCTCCGGATTCCGTGAATGGAGTAACCATTGCTACTCCAACGGTGCCGAAGTGCTCTACTCCGGTCTTAGCTGTTAAACCTGTGCTCATAGAGTTCAAGGTTACCTTCTTCCCTCA‑TTT‑GGGGGTTAAACAACCCCGCAAAAAACCTAACAACTTTTGCATAACAATCGCCCAAGCCACATTCCGATAAGAACAATTGACACGAGCAAGAGGTTTTTACGGCTGTCTTTTACAGCCAAAAATGTTGTCTTAACTATATGAATTTTTAGCTCGTGGGTGTGAGCTTTGCGTTAAAAGTCCATGACATACGGGCTTGTTGCCATTTGCGATCCGTCTGCCAAAGTTTC > CP025533/2084261‑2084755 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |