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Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
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ATAGGTACCGATGTTAAATCATTATTTAATTGGGTGCTATTGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAA < 2:849613/249‑1 ATAGGTAACGATGTTAAATCATTATTTAATTGGGTGCTATTGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAA < 2:764916/249‑1 TACCGATGTTAAATCATTATTTAATTGGGTGCTATTGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAAT < 2:1492557/249‑1 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TCATTATTTAATTGGGTGCTATTGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCAC > 1:208668/1‑249 CATTATTTAATTGGGTGCTATTGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACC > 1:235455/1‑249 TTATTTAATTGGGTGCTATTGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCT > 1:988790/1‑249 TATTTAATTGGGTGCTATTGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTC > 2:926780/1‑249 AATTGGGTGCTATTGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTT < 1:876586/249‑1 AATTGGGTGCTATTGCTTAGGAAAATTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTT < 1:96760/249‑1 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TTCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTT < 2:1202630/249‑1 TCGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTA < 2:757301/249‑1 CGTCCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTAT < 2:234453/249‑1 CCAAGAGTGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGC < 2:1230789/249‑1 TGCTGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGA < 2:264174/249‑1 TGATAGTTGGAACTCCGAAAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATG > 2:400389/1‑249 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AAGCTTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAGCTTGATCGCT < 1:226290/249‑1 GCTTAATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTGGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCGCTCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGCTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGTGCTTGATCGATTT > 2:548781/1‑249 TTCATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAGCTTGATCGCTTTnn > 2:245228/1‑247 CATTGCTGGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAGCTTGATCGCTTTAGAG < 1:11333/249‑1 GGGAGTCGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAGCTTGATCGCTTTAGAGTTCCATC > 2:105185/1‑249 gtgGTGGCAGCACGAATTGTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCGTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAAGGGAGTTGAGCTTGATCGCTTTAGAGTTCCATCCCTT < 2:44383/246‑1 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CP025533/372431‑372681‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cacgaattgTCTATGTGGCACATGGGCTGCGCTCTGAAACTGTTTTAGGCTTAAAAAAGAAGATTCTAGTGTTTTTGGAATATTTGACCCAGTTGTTTGCACATCAAACTTTGGCTGTAAGTCATTCTCTGAAGAAAGCAATTGAAGATGCGCACCCTCGTTTTAAAGGAAGAGTGCAAGTCTTAGGTTATGGCAGTATGAATGGAGTTGAGCTTGATCGCTTTAGAGTTCCATCCCTTGAAGAGAAATTATCTG > CP025533/372700‑372945 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |